CDC42BPA

Ідентифікатори

Символи

CDC42BPA, MRCK, MRCKA, PK428, CDC42 binding protein kinase alpha

Зовнішні ІД

OMIM: 603412 MGI: 2441841 HomoloGene: 55765 GeneCards: CDC42BPA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • protein serine/threonine kinase activity • protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • magnesium ion binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • kinase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • actomyosin • екзосома • cell leading edge • cell-cell junction • lamellipodium • cell projection • цитоскелет
Біологічний процес	• protein phosphorylation • actomyosin structure organization • GO:0007243 intracellular signal transduction • cell migration • фосфорилювання • actin cytoskeleton reorganization • actin cytoskeleton organization • peptidyl-threonine phosphorylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8476


226751

Ensembl


ENSG00000143776


ENSMUSG00000026490

UniProt


Q5VT25


Q3UU96

RefSeq (мРНК)

NM_003607 NM_014826 NM_001366010 NM_001366011 NM_001366019
NM_001387550 NM_001394014

NM_001033285 NM_001346804 NM_001346805 NM_001359541 NM_001359542
NM_001359543 NM_001359544 NM_001359545 NM_001359546 NM_001359547 NM_001359548 NM_001359549

RefSeq (білок)


NP_003598 NP_055641 NP_001352939 NP_001352940 NP_001352948

NP_001028457 NP_001333733 NP_001333734 NP_001346470 NP_001346471
NP_001346472 NP_001346473 NP_001346474 NP_001346475 NP_001346476 NP_001346477 NP_001346478

Локус (UCSC)

Хр. 1: 226.99 – 227.32 Mb

Хр. 1: 179.79 – 179.99 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDC42BPA (англ. CDC42 binding protein kinase alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 732 амінокислот, а молекулярна маса — 197 307^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGEVRLRQL	EQFILDGPAQ	TNGQCFSVET	LLDILICLYD	ECNNSPLRRE
KNILEYLEWA	KPFTSKVKQM	RLHREDFEIL	KVIGRGAFGE	VAVVKLKNAD
KVFAMKILNK	WEMLKRAETA	CFREERDVLV	NGDNKWITTL	HYAFQDDNNL
YLVMDYYVGG	DLLTLLSKFE	DRLPEDMARF	YLAEMVIAID	SVHQLHYVHR
DIKPDNILMD	MNGHIRLADF	GSCLKLMEDG	TVQSSVAVGT	PDYISPEILQ
AMEDGKGRYG	PECDWWSLGV	CMYEMLYGET	PFYAESLVET	YGKIMNHKER
FQFPAQVTDV	SENAKDLIRR	LICSREHRLG	QNGIEDFKKH	PFFSGIDWDN
IRNCEAPYIP	EVSSPTDTSN	FDVDDDCLKN	SETMPPPTHT	AFSGHHLPFV
GFTYTSSCVL	SDRSCLRVTA	GPTSLDLDVN	VQRTLDNNLA	TEAYERRIKR
LEQEKLELSR	KLQESTQTVQ	ALQYSTVDGP	LTASKDLEIK	NLKEEIEKLR
KQVTESSHLE	QQLEEANAVR	QELDDAFRQI	KAYEKQIKTL	QQEREDLNKE
LVQASERLKN	QSKELKDAHC	QRKLAMQEFM	EINERLTELH	TQKQKLARHV
RDKEEEVDLV	MQKVESLRQE	LRRTERAKKE	LEVHTEALAA	EASKDRKLRE
QSEHYSKQLE	NELEGLKQKQ	ISYSPGVCSI	EHQQEITKLK	TDLEKKSIFY
EEELSKREGI	HANEIKNLKK	ELHDSEGQQL	ALNKEIMILK	DKLEKTRRES
QSEREEFESE	FKQQYEREKV	LLTEENKKLT	SELDKLTTLY	ENLSIHNQQL
EEEVKDLADK	KESVAHWEAQ	ITEIIQWVSD	EKDARGYLQA	LASKMTEELE
ALRNSSLGTR	ATDMPWKMRR	FAKLDMSARL	ELQSALDAEI	RAKQAIQEEL
NKVKASNIIT	ECKLKDSEKK	NLELLSEIEQ	LIKDTEELRS	EKGIEHQDSQ
HSFLAFLNTP	TDALDQFERS	PSCTPASKGR	RTVDSTPLSV	HTPTLRKKGC
PGSTGFPPKR	KTHQFFVKSF	TTPTKCHQCT	SLMVGLIRQG	CSCEVCGFSC
HITCVNKAPT	TCPVPPEQTK	GPLGIDPQKG	IGTAYEGHVR	IPKPAGVKKG
WQRALAIVCD	FKLFLYDIAE	GKASQPSVVI	SQVIDMRDEE	FSVSSVLASD
VIHASRKDIP	CIFRVTASQL	SASNNKCSIL	MLADTENEKN	KWVGVLSELH
KILKKNKFRD	RSVYVPKEAY	DSTLPLIKTT	QAAAIIDHER	IALGNEEGLF
VVHVTKDEII	RVGDNKKIHQ	IELIPNDQLV	AVISGRNRHV	RLFPMSALDG
RETDFYKLSE	TKGCQTVTSG	KVRHGALTCL	CVAMKRQVLC	YELFQSKTRH
RKFKEIQVPY	NVQWMAIFSE	QLCVGFQSGF	LRYPLNGEGN	PYSMLHSNDH
TLSFIAHQPM	DAICAVEISS	KEYLLCFNSI	GIYTDCQGRR	SRQQELMWPA
NPSSCCYNAP	YLSVYSENAV	DIFDVNSMEW	IQTLPLKKVR	PLNNEGSLNL
LGLETIRLIY	FKNKMAEGDE	LVVPETSDNS	RKQMVRNINN	KRRYSFRVPE
EERMQQRREM	LRDPEMRNKL	ISNPTNFNHI	AHMGPGDGIQ	ILKDLPMNPR
PQESRTVFSG	SVSIPSITKS	RPEPGRSMSA	SSGLSARSSA	QNGSALKREF
SGGSYSAKRQ	PMPSPSEGSL	SSGGMDQGSD	APARDFDGED	SDSPRHSTAS
NSSNLSSPPS	PASPRKTKSL	SLESTDRGSW	DP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Wilkinson S., Paterson H.F., Marshall C.J. (2005). Cdc42-MRCK and Rho-ROCK signalling cooperate in myosin phosphorylation and cell invasion. Nat. Cell Biol. 7: 255—261. PMID 15723050 DOI:10.1038/ncb1230
Leung T., Chen X.-Q., Tan I., Manser E., Lim L. (1998). Myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase acts as a Cdc42 effector in promoting cytoskeletal reorganization. Mol. Cell. Biol. 18: 130—140. PMID 9418861 DOI:10.1128/MCB.18.1.130
Tan I., Ng C.H., Lim L., Leung T. (2001). Phosphorylation of a novel myosin binding subunit of protein phosphatase 1 reveals a conserved mechanism in the regulation of actin cytoskeleton. J. Biol. Chem. 276: 21209—21216. PMID 11399775 DOI:10.1074/jbc.M102615200
Sumi T., Matsumoto K., Shibuya A., Nakamura T. (2001). Activation of LIM kinases by myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase alpha. J. Biol. Chem. 276: 23092—23096. PMID 11340065 DOI:10.1074/jbc.C100196200
Tan I., Seow K.T., Lim L., Leung T. (2001). Intermolecular and intramolecular interactions regulate catalytic activity of myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase alpha. Mol. Cell. Biol. 21: 2767—2778. PMID 11283256 DOI:10.1128/MCB.21.8.2767-2778.2001
Tan I., Cheong A., Lim L., Leung T. (2003). Genomic organization of human myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase alpha reveals multiple alternative splicing and functional diversity. Gene. 304: 107—115. PMID 12568720 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01185-X

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1737 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q5VT25 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.