CDH6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CDH6, CAD6, KCAD, cadherin 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603007 MGI: 107435 HomoloGene: 21027 GeneCards: CDH6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • catenin complex |
---|
Біологічний процес | • Сигнальний шлях Notch • адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c8/PBB_GE_CDH6_205533_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CDH6_205533_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/da/PBB_GE_CDH6_210602_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CDH6_210602_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/43/PBB_GE_CDH6_205532_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CDH6_205532_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 31.19 – 31.33 Mb | Хр. 15: 13.03 – 13.17 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CDH6 (англ. Cadherin 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 790 амінокислот, а молекулярна маса — 88 309[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRTYRYFLLL | | FWVGQPYPTL | | STPLSKRTSG | | FPAKKRALEL | | SGNSKNELNR |
SKRSWMWNQF | | FLLEEYTGSD | | YQYVGKLHSD | | QDRGDGSLKY | | ILSGDGAGDL |
FIINENTGDI | | QATKRLDREE | | KPVYILRAQA | | INRRTGRPVE | | PESEFIIKIH |
DINDNEPIFT | | KEVYTATVPE | | MSDVGTFVVQ | | VTATDADDPT | | YGNSAKVVYS |
ILQGQPYFSV | | ESETGIIKTA | | LLNMDRENRE | | QYQVVIQAKD | | MGGQMGGLSG |
TTTVNITLTD | | VNDNPPRFPQ | | STYQFKTPES | | SPPGTPIGRI | | KASDADVGEN |
AEIEYSITDG | | EGLDMFDVIT | | DQETQEGIIT | | VKKLLDFEKK | | KVYTLKVEAS |
NPYVEPRFLY | | LGPFKDSATV | | RIVVEDVDEP | | PVFSKLAYIL | | QIREDAQINT |
TIGSVTAQDP | | DAARNPVKYS | | VDRHTDMDRI | | FNIDSGNGSI | | FTSKLLDRET |
LLWHNITVIA | | TEINNPKQSS | | RVPLYIKVLD | | VNDNAPEFAE | | FYETFVCEKA |
KADQLIQTLH | | AVDKDDPYSG | | HQFSFSLAPE | | AASGSNFTIQ | | DNKDNTAGIL |
TRKNGYNRHE | | MSTYLLPVVI | | SDNDYPVQSS | | TGTVTVRVCA | | CDHHGNMQSC |
HAEALIHPTG | | LSTGALVAIL | | LCIVILLVTV | | VLFAALRRQR | | KKEPLIISKE |
DIRDNIVSYN | | DEGGGEEDTQ | | AFDIGTLRNP | | EAIEDNKLRR | | DIVPEALFLP |
RRTPTARDNT | | DVRDFINQRL | | KENDTDPTAP | | PYDSLATYAY | | EGTGSVADSL |
SSLESVTTDA | | DQDYDYLSDW | | GPRFKKLADM | | YGGVDSDKDS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Shimoyama Y., Gotoh M., Terasaki T., Kitajima M., Hirohashi S. (1995). Isolation and sequence analysis of human cadherin-6 complementary DNA for the full coding sequence and its expression in human carcinoma cells. Cancer Res. 55: 2206—2211. PMID 7743525
- Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1765 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P55285 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |