CELF2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2MY7, 2MY8, 4LJM, 4LMZ, 4TLQ

Ідентифікатори

Символи

CELF2, BRUNOL3, CUGBP2, ETR-3, ETR3, NAPOR, CELF-2, CUG-BP2, CUGBP, Elav-like family member 2, CUGBP Elav-like family member 2, DEE97

Зовнішні ІД

OMIM: 602538 MGI: 1338822 HomoloGene: 4783 GeneCards: CELF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding • RNA binding • pre-mRNA binding • mRNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • regulation of heart contraction • mRNA splice site selection • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10659


14007

Ensembl


ENSG00000048740


ENSMUSG00000002107

UniProt


O95319


Q9Z0H4

RefSeq (мРНК)

NM_001025076
NM_001025077
NM_001083591
NM_006561
NM_001326317

NM_001326318
NM_001326319
NM_001326320
NM_001326321
NM_001326323
NM_001326324
NM_001326325
NM_001326326
NM_001326327
NM_001326328
NM_001326329
NM_001326330
NM_001326331
NM_001326332
NM_001326333
NM_001326334
NM_001326335
NM_001326336
NM_001326337
NM_001326338
NM_001326339
NM_001326340
NM_001326341
NM_001326342
NM_001326343
NM_001326344
NM_001326345
NM_001326346
NM_001326347
NM_001326348
NM_001326349
NM_001394502
NM_001394513
NM_001394517
NM_001394518
NM_001394519

NM_001110228 NM_001110229 NM_001110230 NM_001110231 NM_001110232
NM_001160292 NM_001160293 NM_010160 NM_183219 NM_001310447 NM_001347094

RefSeq (білок)

NP_001020247 NP_001020248 NP_001077060 NP_001313246 NP_001313247
NP_001313248 NP_001313249 NP_001313250 NP_001313252 NP_001313253 NP_001313254 NP_001313255 NP_001313256 NP_001313257 NP_001313258 NP_001313259 NP_001313260 NP_001313261 NP_001313262 NP_001313263 NP_001313264 NP_001313265 NP_001313266 NP_001313267 NP_001313268 NP_001313269 NP_001313270 NP_001313271 NP_001313272 NP_001313273 NP_001313274 NP_001313275 NP_001313276 NP_001313277 NP_001313278 NP_006552

NP_001103698
NP_001103699
NP_001103700
NP_001103701
NP_001103702

NP_001153764
NP_001153765
NP_001297376
NP_001334023
NP_034290
NP_001393762
NP_001393763
NP_001393764
NP_001393770
NP_001393771
NP_001393772
NP_001393773
NP_001393774
NP_001393775
NP_001393776
NP_001393777
NP_001393778
NP_001393779
NP_001393780
NP_001393781
NP_001393783
NP_001393784
NP_001393787
NP_001393846
NP_001393847
NP_001393848
NP_001393849
NP_001393850
NP_001393851
NP_001393852
NP_001393853
NP_001393854
NP_001393855
NP_001393856
NP_001393857
NP_001393858
NP_001393859
NP_001393860
NP_001393861
NP_001393862
NP_001393863
NP_001393871
NP_001393872
NP_001393873
NP_001393874
NP_001393875
NP_001393876
NP_001393877
NP_001393878
NP_001393879
NP_001393880
NP_001393881
NP_001393882
NP_001393883
NP_001393884
NP_001393885
NP_001393886
NP_001393887
NP_001393888
NP_001393889
NP_001393890
NP_001393891
NP_001393892
NP_001393893
NP_001393894
NP_001393895
NP_001393896
NP_001393897
NP_001393898
NP_001393899
NP_001393900
NP_001393901
NP_001393902
NP_001393903
NP_001393904
NP_001393905
NP_001393906
NP_001393907
NP_001393908
NP_001393909
NP_001393910
NP_001393911

Локус (UCSC)

Хр. 10: 10.8 – 11.34 Mb

Хр. 2: 6.54 – 7.51 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CELF2 (англ. CUGBP Elav-like family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 54 285^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRCPKSAVTM	RNEELLLSNG	TANKMNGALD	HSDQPDPDAI	KMFVGQIPRS
WSEKELKELF	EPYGAVYQIN	VLRDRSQNPP	QSKGCCFVTF	YTRKAALEAQ
NALHNIKTLP	GMHHPIQMKP	ADSEKSNAVE	DRKLFIGMVS	KKCNENDIRV
MFSPFGQIEE	CRILRGPDGL	SRGCAFVTFS	TRAMAQNAIK	AMHQSQTMEG
CSSPIVVKFA	DTQKDKEQRR	LQQQLAQQMQ	QLNTATWGNL	TGLGGLTPQY
LALLQQATSS	SNLGAFSGIQ	QMAGMNALQL	QNLATLAAAA	AAAQTSATST
NANPLSTTSS	ALGALTSPVA	ASTPNSTAGA	AMNSLTSLGT	LQGLAGATVG
LNNINALAGM	AALNGGLGAT	GLTNGTAGTM	DALTQAYSGI	QQYAAAALPT
LYSQSLLQQQ	SAAGSQKEGP	EGANLFIYHL	PQEFGDQDIL	QMFMPFGNVI
SAKVFIDKQT	NLSKCFGFVS	YDNPVSAQAA	IQAMNGFQIG	MKRLKVQLKR
SKNDSKPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Choi D.-K., Ito T., Mitsui Y., Sakaki Y. (1998). Fluorescent differential display analysis of gene expression in apoptotic neuroblastoma cells. Gene. 223: 21—31. PMID 9858671 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00364-3
Choi D.-K., Ito T., Tsukahara F., Hirai M., Sakaki Y. (1999). Developmentally-regulated expression of mNapor encoding an apoptosis-induced ELAV-type RNA binding protein. Gene. 237: 135—142. PMID 10524244 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00312-1
Good P.J., Chen Q., Warner S.J., Herring D.C. (2000). A family of human RNA-binding proteins related to the Drosophila Bruno translational regulator. J. Biol. Chem. 275: 28583—28592. PMID 10893231 DOI:10.1074/jbc.M003083200
Li D., Bachinski L.L., Roberts R. (2001). Genomic organization and isoform-specific tissue expression of human NAPOR (CUGBP2) as a candidate gene for familial arrhythmogenic right ventricular dysplasia. Genomics. 74: 396—401. PMID 11414768 DOI:10.1006/geno.2001.6558
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ladd A.N., Charlet-B N., Cooper T.A. (2001). The CELF family of RNA binding proteins is implicated in cell-specific and developmentally regulated alternative splicing. Mol. Cell. Biol. 21: 1285—1296. PMID 11158314 DOI:10.1128/MCB.21.4.1285-1296.2001

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2550 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O95319 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.