CHMP5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2LXM, 3ULY, 3UM0, 3UM1, 3UM2, 4TXR

Ідентифікатори

Символи

CHMP5, C9orf83, HSPC177, PNAS-2, SNF7DC2, Vps60, CGI-34, charged multivesicular body protein 5

Зовнішні ІД

OMIM: 610900 MGI: 1924209 HomoloGene: 5757 GeneCards: CHMP5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • мембрана • endosome membrane • екзосома • клітинне ядро
Біологічний процес	• regulation of centrosome duplication • GO:0019067 viral life cycle • nucleus organization • multivesicular body sorting pathway • endosome to lysosome transport • multivesicular body assembly • regulation of mitotic spindle assembly • endosomal transport • protein transport • septum digestion after cytokinesis • mitotic metaphase plate congression • regulation of receptor recycling • lysosome organization • vacuolar transport • ESCRT III complex disassembly • GO:0015915 транспорт • midbody abscission • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to muramyl dipeptide
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51510


76959

Ensembl


н/д


ENSMUSG00000028419

UniProt


Q9NZZ3


Q9D7S9

RefSeq (мРНК)


NM_016410 NM_001195536


NM_029814

RefSeq (білок)


NP_001182465 NP_057494


NP_084090

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 4: 40.95 – 40.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CHMP5 (англ. Charged multivesicular body protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 219 амінокислот, а молекулярна маса — 24 571^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNRLFGKAKP	KAPPPSLTDC	IGTVDSRAES	IDKKISRLDA	ELVKYKDQIK
KMREGPAKNM	VKQKALRVLK	QKRMYEQQRD	NLAQQSFNME	QANYTIQSLK
DTKTTVDAMK	LGVKEMKKAY	KQVKIDQIED	LQDQLEDMME	DANEIQEALS
RSYGTPELDE	DDLEAELDAL	GDELLADEDS	SYLDEAASAP	AIPEGVPTDT
KNKDGVLVDE	FGLPQIPAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
Kuang Z., Seo E.J., Leis J. (2011). Mechanism of inhibition of retrovirus release from cells by interferon-induced gene ISG15. J. Virol. 85: 7153—7161. PMID 21543490 DOI:10.1128/JVI.02610-10
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 152845—152845. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26942 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NZZ3 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2018. Процитовано 8 вересня 2017.