CHRNB2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2K58, 2K59, 2KSR, 2LM2 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CHRNB2, EFNL3, nAChRB2, cholinergic receptor nicotinic beta 2 subunit |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 118507 MGI: 87891 HomoloGene: 595 GeneCards: CHRNB2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
autosomal dominant nocturnal frontal lobe epilepsy 3[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
pozanicline, ispronicline[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • acetylcholine binding • acetylcholine receptor activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ligand-gated ion channel activity • protein heterodimerization activity • extracellular ligand-gated ion channel activity • acetylcholine-gated cation-selective channel activity • transmembrane signaling receptor activity • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential |
---|
Клітинна компонента | • acetylcholine-gated channel complex • integral component of membrane • postsynaptic membrane • мембрана • клітинна мембрана • синапс • міжклітинні контакти • external side of plasma membrane • integral component of plasma membrane • neuron projection • plasma membrane raft • dopaminergic synapse • cholinergic synapse • integral component of presynaptic membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane |
---|
Біологічний процес | • visual learning • regulation of synaptic transmission, dopaminergic • response to cocaine • smooth muscle contraction • regulation of circadian sleep/wake cycle, REM sleep • regulation of dopamine secretion • response to hypoxia • associative learning • когнітивність • locomotory behavior • protein heterooligomerization • central nervous system neuron axonogenesis • optic nerve morphogenesis • regulation of synapse assembly • regulation of membrane potential • response to nicotine • membrane depolarization • nervous system process • synaptic transmission, cholinergic • ion transport • слух • навчення • пам'ять • negative regulation of action potential • regulation of dopamine metabolic process • behavioral response to nicotine • regulation of dendrite morphogenesis • B cell activation • neuromuscular synaptic transmission • synaptic transmission involved in micturition • positive regulation of dopamine secretion • positive regulation of B cell proliferation • regulation of circadian sleep/wake cycle, non-REM sleep • vestibulocochlear nerve development • conditioned taste aversion • GO:0015915 транспорт • соціальна поведінка • потенціал дії • sensory perception of pain • lateral geniculate nucleus development • positive regulation of synaptic transmission, dopaminergic • response to ethanol • central nervous system projection neuron axonogenesis • calcium ion transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • зір • ion transmembrane transport • regulation of postsynaptic membrane potential • excitatory postsynaptic potential • acetylcholine receptor signaling pathway • chemical synaptic transmission • response to acetylcholine • regulation of synaptic vesicle exocytosis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 154.57 – 154.58 Mb | Хр. 3: 89.65 – 89.67 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CHRNB2 (англ. Cholinergic receptor nicotinic beta 2 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 57 019[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MARRCGPVAL | | LLGFGLLRLC | | SGVWGTDTEE | | RLVEHLLDPS | | RYNKLIRPAT |
NGSELVTVQL | | MVSLAQLISV | | HEREQIMTTN | | VWLTQEWEDY | | RLTWKPEEFD |
NMKKVRLPSK | | HIWLPDVVLY | | NNADGMYEVS | | FYSNAVVSYD | | GSIFWLPPAI |
YKSACKIEVK | | HFPFDQQNCT | | MKFRSWTYDR | | TEIDLVLKSE | | VASLDDFTPS |
GEWDIVALPG | | RRNENPDDST | | YVDITYDFII | | RRKPLFYTIN | | LIIPCVLITS |
LAILVFYLPS | | DCGEKMTLCI | | SVLLALTVFL | | LLISKIVPPT | | SLDVPLVGKY |
LMFTMVLVTF | | SIVTSVCVLN | | VHHRSPTTHT | | MAPWVKVVFL | | EKLPALLFMQ |
QPRHHCARQR | | LRLRRRQRER | | EGAGALFFRE | | APGADSCTCF | | VNRASVQGLA |
GAFGAEPAPV | | AGPGRSGEPC | | GCGLREAVDG | | VRFIADHMRS | | EDDDQSVSED |
WKYVAMVIDR | | LFLWIFVFVC | | VFGTIGMFLQ | | PLFQNYTTTT | | FLHSDHSAPS |
SK |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Anand R., Lindstrom J. (1990). Nucleotide sequence of the human nicotinic acetylcholine receptor beta 2 subunit gene. Nucleic Acids Res. 18: 4272—4272. PMID 2377478 DOI:10.1093/nar/18.14.4272
- Groot Kormelink P.J., Luyten W.H.M.L. (1997). Cloning and sequence of full-length cDNAs encoding the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) subunits beta3 and beta4 and expression of seven nAChR subunits in the human neuroblastoma cell line SH-SY5Y and/or IMR-32. FEBS Lett. 400: 309—314. PMID 9009220 DOI:10.1016/S0014-5793(96)01383-X
- Rempel N., Heyers S., Engels H., Sleegers E., Steinlein O.K. (1998). The structures of the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor beta2- and alpha3-subunit genes (CHRNB2 and CHRNA3). Hum. Genet. 103: 645—653. PMID 9921897 DOI:10.1007/s004390050885
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kouvatsos N., Giastas P., Chroni-Tzartou D., Poulopoulou C., Tzartos S.J. (2016). Crystal structure of a human neuronal nAChR extracellular domain in pentameric assembly: Ligand-bound alpha2 homopentamer. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113: 9635—9640. PMID 27493220 DOI:10.1073/PNAS.1602619113
- Bondarenko V., Tillman T., Xu Y., Tang P. (2010). NMR structure of the transmembrane domain of the n-acetylcholine receptor beta2 subunit. Biochim. Biophys. Acta. 1798: 1608—1614. PMID 20441771 DOI:10.1016/j.bbamem.2010.04.014
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CHRNB2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic beta 2 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1962 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P17787 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |