CIZ1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CIZ1, LSFR1, NP94, ZNF356, CDKN1A interacting zinc finger protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611420 MGI: 1920234 HomoloGene: 8112 GeneCards: CIZ1 |
---|
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c8/PBB_GE_CIZ1_211358_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CIZ1_211358_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/59/PBB_GE_CIZ1_205516_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_CIZ1_205516_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5e/PBB_GE_CIZ1_213977_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CIZ1_213977_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001131015 NM_001131016 NM_001131017 NM_001131018 NM_001257975
| NM_001257976 NM_012127 |
| | NM_001252534 NM_001252536 NM_001252537 NM_001252538 NM_028412 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001124487 NP_001124488 NP_001124489 NP_001124490 NP_001244904
| NP_001244905 NP_036259 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 128.16 – 128.2 Mb | Хр. 2: 32.24 – 32.27 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CIZ1 (англ. CDKN1A interacting zinc finger protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 898 амінокислот, а молекулярна маса — 100 045[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFSQQQQQQL | | QQQQQQLQQL | | QQQQLQQQQL | | QQQQLLQLQQ | | LLQQSPPQAP |
LPMAVSRGLP | | PQQPQQPLLN | | LQGTNSASLL | | NGSMLQRALL | | LQQLQGLDQF |
AMPPATYDTA | | GLTMPTATLG | | NLRGYGMASP | | GLAAPSLTPP | | QLATPNLQQF |
FPQATRQSLL | | GPPPVGVPMN | | PSQFNLSGRN | | PQKQARTSSS | | TTPNRKDSSS |
QTMPVEDKSD | | PPEGSEEAAE | | PRMDTPEDQD | | LPPCPEDIAK | | EKRTPAPEPE |
PCEASELPAK | | RLRSSEEPTE | | KEPPGQLQVK | | AQPQARMTVP | | KQTQTPDLLP |
EALEAQVLPR | | FQPRVLQVQA | | QVQSQTQPRI | | PSTDTQVQPK | | LQKQAQTQTS |
PEHLVLQQKQ | | VQPQLQQEAE | | PQKQVQPQVQ | | PQAHSQGPRQ | | VQLQQEAEPL |
KQVQPQVQPQ | | AHSQPPRQVQ | | LQLQKQVQTQ | | TYPQVHTQAQ | | PSVQPQEHPP |
AQVSVQPPEQ | | THEQPHTQPQ | | VSLLAPEQTP | | VVVHVCGLEM | | PPDAVEAGGG |
MEKTLPEPVG | | TQVSMEEIQN | | ESACGLDVGE | | CENRAREMPG | | VWGAGGSLKV |
TILQSSDSRA | | FSTVPLTPVP | | RPSDSVSSTP | | AATSTPSKQA | | LQFFCYICKA |
SCSSQQEFQD | | HMSEPQHQQR | | LGEIQHMSQA | | CLLSLLPVPR | | DVLETEDEEP |
PPRRWCNTCQ | | LYYMGDLIQH | | RRTQDHKIAK | | QSLRPFCTVC | | NRYFKTPRKF |
VEHVKSQGHK | | DKAKELKSLE | | KEIAGQDEDH | | FITVDAVGCF | | EGDEEEEEDD |
EDEEEIEVEE | | ELCKQVRSRD | | ISREEWKGSE | | TYSPNTAYGV | | DFLVPVMGYI |
CRICHKFYHS | | NSGAQLSHCK | | SLGHFENLQK | | YKAAKNPSPT | | TRPVSRRCAI |
NARNALTALF | | TSSGRPPSQP | | NTQDKTPSKV | | TARPSQPPLP | | RRSTRLKT |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- Mitsui K., Matsumoto A., Ohtsuka S., Ohtsubo M., Yoshimura A. (1999). Cloning and characterization of a novel p21(Cip1/Waf1)-interacting zinc finger protein, ciz1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 264: 457—464. PMID 10529385 DOI:10.1006/bbrc.1999.1516
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Warder D.E., Keherly M.J. (2003). Ciz1, Cip1 interacting zinc finger protein 1 binds the consensus DNA sequence ARYSR(0-2)YYAC. J. Biomed. Sci. 10: 406—417. PMID 12824700 DOI:10.1007/BF02256432
- Gilley J., Fried M. (1999). Extensive gene order differences within regions of conserved synteny between the Fugu and human genomes: implications for chromosomal evolution and the cloning of disease genes. Hum. Mol. Genet. 8: 1313—1320. PMID 10369878 DOI:10.1093/hmg/8.7.1313
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16744 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9ULV3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |