CLSPN

Ідентифікатори

Символи

CLSPN, claspin

Зовнішні ІД

OMIM: 605434 MGI: 2445153 HomoloGene: 11138 GeneCards: CLSPN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • anaphase-promoting complex binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі
Біологічний процес	• реплікація ДНК • клітинний цикл • DNA damage checkpoint signaling • mitotic DNA replication checkpoint signaling • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • activation of protein kinase activity • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК • protein deubiquitination • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


63967


269582

Ensembl


ENSG00000092853


ENSMUSG00000042489

UniProt


Q9HAW4


Q80YR7

RefSeq (мРНК)


NM_001190481 NM_022111 NM_001330490


NM_175554

RefSeq (білок)


NP_001177410 NP_001317419 NP_071394


NP_780763 NP_001392727 NP_001392728 NP_001392729 NP_001392730

Локус (UCSC)

Хр. 1: 35.72 – 35.77 Mb

Хр. 4: 126.45 – 126.49 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLSPN (англ. Claspin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 339 амінокислот, а молекулярна маса — 151 094^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTGEVGSEVH	LEINDPNVIS	QEEADSPSDS	GQGSYETIGP	LSEGDSDEEI
FVSKKLKNRK	VLQDSDSETE	DTNASPEKTT	YDSAEEENKE	NLYAGKNTKI
KRIYKTVADS	DESYMEKSLY	QENLEAQVKP	CLELSLQSGN	STDFTTDRKS
SKKHIHDKEG	TAGKAKVKSK	RRLEKEERKM	EKIRQLKKKE	TKNQEDDVEQ
PFNDSGCLLV	DKDLFETGLE	DENNSPLEDE	ESLESIRAAV	KNKVKKHKKK
EPSLESGVHS	FEEGSELSKG	TTRKERKAAR	LSKEALKQLH	SETQRLIRES
ALNLPYHMPE	NKTIHDFFKR	KPRPTCHGNA	MALLKSSKYQ	SSHHKEIIDT
ANTTEMNSDH	HSKGSEQTTG	AENEVETNAL	PVVSKETQII	TGSDESCRKD
LVKNEELEIQ	EKQKQSDIRP	SPGDSSVLQQ	ESNFLGNNHS	EECQVGGLVA
FEPHALEGEG	PQNPEETDEK	VEEPEQQNKS	SAVGPPEKVR	RFTLDRLKQL
GVDVSIKPRL	GADEDSFVIL	EPETNRELEA	LKQRFWKHAN	PAAKPRAGQT
VNVNVIVKDM	GTDGKEELKA	DVVPVTLAPK	KLDGASHTKP	GEKLQVLKAK
LQEAMKLRRF	EERQKRQALF	KLDNEDGFEE	EEEEEEEMTD	ESEEDGEEKV
EKEEKEEELE	EEEEKEEEEE	EEGNQETAEF	LLSSEEIETK	DEKEMDKENN
DGSSEIGKAV	GFLSVPKSLS	SDSTLLLFKD	SSSKMGYFPT	EEKSETDENS
GKQPSKLDED	DSCSLLTKES	SHNSSFELIG	STIPSYQPCN	RQTGRGTSFF
PTAGGFRSPS	PGLFRASLVS	SASKSSGKLS	EPSLPIEDSQ	DLYNASPEPK
TLFLGAGDFQ	FCLEDDTQSQ	LLDADGFLNV	RNHRNQYQAL	KPRLPLASMD
ENAMDANMDE	LLDLCTGKFT	SQAEKHLPRK	SDKKENMEEL	LNLCSGKFTS
QDASTPASSE	LNKQEKESSM	GDPMEEALAL	CSGSFPTDKE	EEDEEEEFGD
FRLVSNDNEF	DSDEDEHSDS	GNDLALEDHE	DDDEEELLKR	SEKLKRQMRL
RKYLEDEAEV	SGSDVGSEDE	YDGEEIDEYE	EDVIDEVLPS	DEELQSQIKK
IHMKTMLDDD	KRQLRLYQER	YLADGDLHSD	GPGRMRKFRW	KNIDDASQMD
LFHRDSDDDQ	TEEQLDESEA	RWRKERIERE	QWLRDMAQQG	KITAEEEEEI
GEDSQFMILA	KKVTAKALQK	NASRPMVIQE	SKSLLRNPFE	AIRPGSAQQV
KTGSLLNQPK	AVLQKLAALS	DHNPSAPRNS	RNFVFHTLSP	VKAEAAKESS
KSQVKKRGPS	FMTSPSPKHL	KTDDSTSGLT	RSIFKYLES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kumagai A., Dunphy W.G. (2000). Claspin, a novel protein required for the activation of Chk1 during a DNA replication checkpoint response in Xenopus egg extracts. Mol. Cell. 6: 839—849. PMID 11090622 DOI:10.1016/S1097-2765(05)00092-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chini C.C.S., Chen J. (2003). Human claspin is required for replication checkpoint control. J. Biol. Chem. 278: 30057—30062. PMID 12766152 DOI:10.1074/jbc.M301136200
Lin S.-Y., Li K., Stewart G.S., Elledge S.J. (2004). Human claspin works with BRCA1 to both positively and negatively regulate cell proliferation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 6484—6489. PMID 15096610 DOI:10.1073/pnas.0401847101
Clarke C.A.L., Clarke P.R. (2005). DNA-dependent phosphorylation of Chk1 and claspin in a human cell-free system. Biochem. J. 388: 705—712. PMID 15707391 DOI:10.1042/BJ20041966
Zhang D., Zaugg K., Mak T.W., Elledge S.J. (2006). A role for the deubiquitinating enzyme USP28 in control of the DNA-damage response. Cell. 126: 529—542. PMID 16901786 DOI:10.1016/j.cell.2006.06.039

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19715 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9HAW4 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.