CLSPN |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLSPN, claspin |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605434 MGI: 2445153 HomoloGene: 11138 GeneCards: CLSPN |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • anaphase-promoting complex binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі |
---|
Біологічний процес | • реплікація ДНК • клітинний цикл • DNA damage checkpoint signaling • mitotic DNA replication checkpoint signaling • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • activation of protein kinase activity • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК • protein deubiquitination • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d1/PBB_GE_CLSPN_219621_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLSPN_219621_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001190481 NM_022111 NM_001330490 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001177410 NP_001317419 NP_071394 |
| | NP_780763 NP_001392727 NP_001392728 NP_001392729 NP_001392730 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 35.72 – 35.77 Mb | Хр. 4: 126.45 – 126.49 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLSPN (англ. Claspin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 339 амінокислот, а молекулярна маса — 151 094[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTGEVGSEVH | | LEINDPNVIS | | QEEADSPSDS | | GQGSYETIGP | | LSEGDSDEEI |
FVSKKLKNRK | | VLQDSDSETE | | DTNASPEKTT | | YDSAEEENKE | | NLYAGKNTKI |
KRIYKTVADS | | DESYMEKSLY | | QENLEAQVKP | | CLELSLQSGN | | STDFTTDRKS |
SKKHIHDKEG | | TAGKAKVKSK | | RRLEKEERKM | | EKIRQLKKKE | | TKNQEDDVEQ |
PFNDSGCLLV | | DKDLFETGLE | | DENNSPLEDE | | ESLESIRAAV | | KNKVKKHKKK |
EPSLESGVHS | | FEEGSELSKG | | TTRKERKAAR | | LSKEALKQLH | | SETQRLIRES |
ALNLPYHMPE | | NKTIHDFFKR | | KPRPTCHGNA | | MALLKSSKYQ | | SSHHKEIIDT |
ANTTEMNSDH | | HSKGSEQTTG | | AENEVETNAL | | PVVSKETQII | | TGSDESCRKD |
LVKNEELEIQ | | EKQKQSDIRP | | SPGDSSVLQQ | | ESNFLGNNHS | | EECQVGGLVA |
FEPHALEGEG | | PQNPEETDEK | | VEEPEQQNKS | | SAVGPPEKVR | | RFTLDRLKQL |
GVDVSIKPRL | | GADEDSFVIL | | EPETNRELEA | | LKQRFWKHAN | | PAAKPRAGQT |
VNVNVIVKDM | | GTDGKEELKA | | DVVPVTLAPK | | KLDGASHTKP | | GEKLQVLKAK |
LQEAMKLRRF | | EERQKRQALF | | KLDNEDGFEE | | EEEEEEEMTD | | ESEEDGEEKV |
EKEEKEEELE | | EEEEKEEEEE | | EEGNQETAEF | | LLSSEEIETK | | DEKEMDKENN |
DGSSEIGKAV | | GFLSVPKSLS | | SDSTLLLFKD | | SSSKMGYFPT | | EEKSETDENS |
GKQPSKLDED | | DSCSLLTKES | | SHNSSFELIG | | STIPSYQPCN | | RQTGRGTSFF |
PTAGGFRSPS | | PGLFRASLVS | | SASKSSGKLS | | EPSLPIEDSQ | | DLYNASPEPK |
TLFLGAGDFQ | | FCLEDDTQSQ | | LLDADGFLNV | | RNHRNQYQAL | | KPRLPLASMD |
ENAMDANMDE | | LLDLCTGKFT | | SQAEKHLPRK | | SDKKENMEEL | | LNLCSGKFTS |
QDASTPASSE | | LNKQEKESSM | | GDPMEEALAL | | CSGSFPTDKE | | EEDEEEEFGD |
FRLVSNDNEF | | DSDEDEHSDS | | GNDLALEDHE | | DDDEEELLKR | | SEKLKRQMRL |
RKYLEDEAEV | | SGSDVGSEDE | | YDGEEIDEYE | | EDVIDEVLPS | | DEELQSQIKK |
IHMKTMLDDD | | KRQLRLYQER | | YLADGDLHSD | | GPGRMRKFRW | | KNIDDASQMD |
LFHRDSDDDQ | | TEEQLDESEA | | RWRKERIERE | | QWLRDMAQQG | | KITAEEEEEI |
GEDSQFMILA | | KKVTAKALQK | | NASRPMVIQE | | SKSLLRNPFE | | AIRPGSAQQV |
KTGSLLNQPK | | AVLQKLAALS | | DHNPSAPRNS | | RNFVFHTLSP | | VKAEAAKESS |
KSQVKKRGPS | | FMTSPSPKHL | | KTDDSTSGLT | | RSIFKYLES |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Kumagai A., Dunphy W.G. (2000). Claspin, a novel protein required for the activation of Chk1 during a DNA replication checkpoint response in Xenopus egg extracts. Mol. Cell. 6: 839—849. PMID 11090622 DOI:10.1016/S1097-2765(05)00092-4
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chini C.C.S., Chen J. (2003). Human claspin is required for replication checkpoint control. J. Biol. Chem. 278: 30057—30062. PMID 12766152 DOI:10.1074/jbc.M301136200
- Lin S.-Y., Li K., Stewart G.S., Elledge S.J. (2004). Human claspin works with BRCA1 to both positively and negatively regulate cell proliferation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 6484—6489. PMID 15096610 DOI:10.1073/pnas.0401847101
- Clarke C.A.L., Clarke P.R. (2005). DNA-dependent phosphorylation of Chk1 and claspin in a human cell-free system. Biochem. J. 388: 705—712. PMID 15707391 DOI:10.1042/BJ20041966
- Zhang D., Zaugg K., Mak T.W., Elledge S.J. (2006). A role for the deubiquitinating enzyme USP28 in control of the DNA-damage response. Cell. 126: 529—542. PMID 16901786 DOI:10.1016/j.cell.2006.06.039
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19715 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9HAW4 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |