CNOT6 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CNOT6, CCR4, Ccr4a, CCR4-NOT transcription complex subunit 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608951 MGI: 2144529 HomoloGene: 69187 GeneCards: CNOT6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • poly(A)-specific ribonuclease activity • exoribonuclease activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • 3'-5'-exoribonuclease activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • CCR4-NOT complex • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • transcription, DNA-templated • positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly • gene silencing by miRNA • positive regulation of cell population proliferation • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • Сайленсинг генів • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay • regulation of translation • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a6/PBB_GE_CNOT6_gnf1h02366_at_fs.png/250px-PBB_GE_CNOT6_gnf1h02366_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/36/PBB_GE_CNOT6_217970_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CNOT6_217970_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001303241 NM_015455 NM_001370472 NM_001370473 NM_001370474 |
| | NM_001290741 NM_212484 NM_001363356 NM_001363357 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001290170 NP_001357401 NP_001357402 NP_001357403 |
| | NP_001277670 NP_997649 NP_001350285 NP_001350286 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 180.49 – 180.58 Mb | Хр. 11: 49.56 – 49.6 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CNOT6 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 557 амінокислот, а молекулярна маса — 63 307[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPKEKYEPPD | | PRRMYTIMSS | | EEAANGKKSH | | WAELEISGKV | | RSLSASLWSL |
THLTALHLSD | | NSLSRIPSDI | | AKLHNLVYLD | | LSSNKIRSLP | | AELGNMVSLR |
ELHLNNNLLR | | VLPFELGKLF | | QLQTLGLKGN | | PLTQDILNLY | | QEPDGTRRLL |
NYLLDNLSGT | | AKRITTEQPP | | PRSWIMLQEP | | DRTRPTALFS | | VMCYNVLCDK |
YATRQLYGYC | | PSWALNWDYR | | KKAIIQEILS | | CNADIVSLQE | | VETEQYYSFF |
LVELKERGYN | | GFFSPKSRAR | | TMSEQERKHV | | DGCAIFFKTE | | KFTLVQKHTV |
EFNQLAMANS | | EGSEAMLNRV | | MTKDNIGVAV | | LLELRKESIE | | MPSGKPHLGT |
EKQLILVANA | | HMHWDPEYSD | | VKLVQTMMFL | | SEVKNIIDKA | | SRNLKSSVLG |
EFGTIPLVLC | | ADLNSLPDSG | | VVEYLSTGGV | | ETNHKDFKEL | | RYNESLTNFS |
CHGKNGTTNG | | RITHGFKLQS | | AYESGLMPYT | | NYTFDFKGII | | DYIFYSKPQL |
NTLGILGPLD | | HHWLVENNIS | | GCPHPLIPSD | | HFSLFAQLEL | | LLPFLPQVNG |
IHLPGRR |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chen J., Chiang Y.-C., Denis C.L. (2002). CCR4, a 3'-5' poly(A) RNA and ssDNA exonuclease, is the catalytic component of the cytoplasmic deadenylase. EMBO J. 21: 1414—1426. PMID 11889047 DOI:10.1093/emboj/21.6.1414
- Lykke-Andersen J., Wagner E. (2005). Recruitment and activation of mRNA decay enzymes by two ARE-mediated decay activation domains in the proteins TTP and BRF-1. Genes Dev. 19: 351—361. PMID 15687258 DOI:10.1101/gad.1282305
- Garapaty S., Mahajan M.A., Samuels H.H. (2008). Components of the CCR4-NOT complex function as nuclear hormone receptor coactivators via association with the NRC-interacting Factor NIF-1. J. Biol. Chem. 283: 6806—6816. PMID 18180299 DOI:10.1074/jbc.M706986200
- Piao X., Zhang X., Wu L., Belasco J.G. (2010). CCR4-NOT deadenylates mRNA associated with complexes in human cells. Mol. Cell. Biol. 30: 1486—1494. PMID 20065043 DOI:10.1128/MCB.01481-09
- Mittal S., Aslam A., Doidge R., Medica R., Winkler G.S. (2011). The Ccr4a (CNOT6) and Ccr4b (CNOT6L) deadenylase subunits of the human Ccr4-Not complex contribute to the prevention of cell death and senescence. Mol. Biol. Cell. 22: 748—758. PMID 21233283 DOI:10.1091/mbc.E10-11-0898
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14099 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9ULM6 (англ.) . Архів оригіналу за 12 лютого 2018. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |