CNOT6L |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3NGN, 3NGO, 3NGQ, 5DV2 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CNOT6L, CCR4b, CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 618069 MGI: 2443154 HomoloGene: 100830 GeneCards: CNOT6L |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • poly(A)-specific ribonuclease activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • 3'-5'-exoribonuclease activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • CCR4-NOT complex • клітинне ядро • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • mRNA processing • transcription, DNA-templated • positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly • mRNA destabilization • positive regulation of cell population proliferation • Сайленсинг генів • regulation of translation • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001286790 NM_144571 NM_001365006 NM_001365007 |
| | NM_001285511 NM_001285514 NM_144910 NM_178854 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001273719 NP_653172 NP_001351935 NP_001351936 |
| | NP_001272440 NP_001272443 NP_659159 NP_849185 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 77.71 – 77.82 Mb | Хр. 5: 96.22 – 96.31 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CNOT6L (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 555 амінокислот, а молекулярна маса — 63 001[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRLIGMPKEK | | YDPPDPRRIY | | TIMSAEEVAN | | GKKSHWAELE | | ISGRVRSLST |
SLWSLTHLTA | | LHLNDNYLSR | | IPPDIAKLHN | | LVYLDLSSNK | | LRSLPAELGN |
MVSLRELLLN | | NNLLRVLPYE | | LGRLFQLQTL | | GLKGNPLSQD | | ILNLYQDPDG |
TRKLLNFMLD | | NLAVHPEQLP | | PRPWITLKER | | DQILPSASFT | | VMCYNVLCDK |
YATRQLYGYC | | PSWALNWEYR | | KKGIMEEIVN | | CDADIISLQE | | VETEQYFTLF |
LPALKERGYD | | GFFSPKSRAK | | IMSEQERKHV | | DGCAIFFKTE | | KFTLVQKHTV |
EFNQVAMANS | | DGSEAMLNRV | | MTKDNIGVAV | | VLEVHKELFG | | AGMKPIHAAD |
KQLLIVANAH | | MHWDPEYSDV | | KLIQTMMFVS | | EVKNILEKAS | | SRPGSPTADP |
NSIPLVLCAD | | LNSLPDSGVV | | EYLSNGGVAD | | NHKDFKELRY | | NECLMNFSCN |
GKNGSSEGRI | | THGFQLKSAY | | ENNLMPYTNY | | TFDFKGVIDY | | IFYSKTHMNV |
LGVLGPLDPQ | | WLVENNITGC | | PHPHIPSDHF | | SLLTQLELHP | | PLLPLVNGVH |
LPNRR |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Mittal S., Aslam A., Doidge R., Medica R., Winkler G.S. (2011). The Ccr4a (CNOT6) and Ccr4b (CNOT6L) deadenylase subunits of the human Ccr4-Not complex contribute to the prevention of cell death and senescence. Mol. Biol. Cell. 22: 748—758. PMID 21233283 DOI:10.1091/mbc.E10-11-0898
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18042 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q96LI5 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2018. Процитовано 18 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |