CNOT7 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ed/Protein_CNOT7_PDB_2d5r.png/250px-Protein_CNOT7_PDB_2d5r.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2D5R, 4GMJ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CNOT7, CAF1, Caf1a, hCAF-1, CAF-1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604913 MGI: 1298230 HomoloGene: 49011 GeneCards: CNOT7 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nuclease activity • nucleic acid binding • exoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 3'-5'-exoribonuclease activity • signal transducer activity • poly(A)-specific ribonuclease activity • exonuclease activity • RNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • transcription factor binding • GO:0001106 transcription corepressor activity |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • CCR4-NOT complex • гіалоплазма • мембрана • ядерні тільця • P-body • цитоплазма • nuclear speck • CCR4-NOT core complex • host cell PML body |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of gene expression • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • P-body assembly • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of mRNA catabolic process • gene silencing by miRNA • regulation of translation • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • GO:0072468 сигнальна трансдукція • Сайленсинг генів • transcription, DNA-templated • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • positive regulation of viral genome replication • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • defense response to virus • negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • carbohydrate metabolic process • negative regulation of translation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/89/PBB_GE_CNOT7_218250_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CNOT7_218250_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_013354 NM_054026 NM_001322087 NM_001322088 NM_001322089
| NM_001322090 NM_001322091 NM_001322092 NM_001322093 NM_001322094 NM_001322095 NM_001322096 NM_001322097 NM_001322098 NM_001322099 NM_001322100 |
| | NM_001271542 NM_001271543 NM_011135 NM_001361938 NM_001361939 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001309016 NP_001309017 NP_001309018 NP_001309019 NP_001309020
| NP_001309021 NP_001309022 NP_001309023 NP_001309024 NP_001309025 NP_001309026 NP_001309027 NP_001309028 NP_001309029 NP_037486 NP_473367 |
| | NP_001258471 NP_001258472 NP_035265 NP_001348867 NP_001348868 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 17.22 – 17.25 Mb | Хр. 8: 40.95 – 40.97 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CNOT7 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 285 амінокислот, а молекулярна маса — 32 745[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPAATVDHSQ | | RICEVWACNL | | DEEMKKIRQV | | IRKYNYVAMD | | TEFPGVVARP |
IGEFRSNADY | | QYQLLRCNVD | | LLKIIQLGLT | | FMNEQGEYPP | | GTSTWQFNFK |
FNLTEDMYAQ | | DSIELLTTSG | | IQFKKHEEEG | | IETQYFAELL | | MTSGVVLCEG |
VKWLSFHSGY | | DFGYLIKILT | | NSNLPEEELD | | FFEILRLFFP | | VIYDVKYLMK |
SCKNLKGGLQ | | EVAEQLELER | | IGPQHQAGSD | | SLLTGMAFFK | | MREMFFEDHI |
DDAKYCGHLY | | GLGSGSSYVQ | | NGTGNAYEEE | | ANKQS |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bianchin C., Mauxion F., Sentis S., Seraphin B., Corbo L. (2005). Conservation of the deadenylase activity of proteins of the Caf1 family in human. RNA. 11: 487—494. PMID 15769875 DOI:10.1261/rna.7135305
- Aslam A., Mittal S., Koch F., Andrau J.C., Winkler G.S. (2009). The Ccr4-NOT deadenylase subunits CNOT7 and CNOT8 have overlapping roles and modulate cell proliferation. Mol. Biol. Cell. 20: 3840—3850. PMID 19605561 DOI:10.1091/mbc.E09-02-0146
- Cooke A., Prigge A., Wickens M. (2010). Translational repression by deadenylases. J. Biol. Chem. 285: 28506—28513. PMID 20634287 DOI:10.1074/jbc.M110.150763
- Piao X., Zhang X., Wu L., Belasco J.G. (2010). CCR4-NOT deadenylates mRNA associated with complexes in human cells. Mol. Cell. Biol. 30: 1486—1494. PMID 20065043 DOI:10.1128/MCB.01481-09
- Doidge R., Mittal S., Aslam A., Winkler G.S. (2012). The anti-proliferative activity of BTG/TOB proteins is mediated via the Caf1a (CNOT7) and Caf1b (CNOT8) deadenylase subunits of the Ccr4-not complex. PLoS ONE. 7: E51331—E51331. PMID 23236473 DOI:10.1371/journal.pone.0051331
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14101 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UIV1 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |