CNOT7

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2D5R, 4GMJ

Ідентифікатори

Символи

CNOT7, CAF1, Caf1a, hCAF-1, CAF-1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7

Зовнішні ІД

OMIM: 604913 MGI: 1298230 HomoloGene: 49011 GeneCards: CNOT7

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nuclease activity • nucleic acid binding • exoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 3'-5'-exoribonuclease activity • signal transducer activity • poly(A)-specific ribonuclease activity • exonuclease activity • RNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • transcription factor binding • GO:0001106 transcription corepressor activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • CCR4-NOT complex • гіалоплазма • мембрана • ядерні тільця • P-body • цитоплазма • nuclear speck • CCR4-NOT core complex • host cell PML body
Біологічний процес	• negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of gene expression • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • P-body assembly • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of mRNA catabolic process • gene silencing by miRNA • regulation of translation • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • GO:0072468 сигнальна трансдукція • Сайленсинг генів • transcription, DNA-templated • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • positive regulation of viral genome replication • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • defense response to virus • negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • carbohydrate metabolic process • negative regulation of translation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


29883


18983

Ensembl


ENSG00000198791


ENSMUSG00000031601

UniProt


Q9UIV1


Q60809

RefSeq (мРНК)

NM_013354 NM_054026 NM_001322087 NM_001322088 NM_001322089
NM_001322090 NM_001322091 NM_001322092 NM_001322093 NM_001322094 NM_001322095 NM_001322096 NM_001322097 NM_001322098 NM_001322099 NM_001322100


NM_001271542 NM_001271543 NM_011135 NM_001361938 NM_001361939

RefSeq (білок)

NP_001309016 NP_001309017 NP_001309018 NP_001309019 NP_001309020
NP_001309021 NP_001309022 NP_001309023 NP_001309024 NP_001309025 NP_001309026 NP_001309027 NP_001309028 NP_001309029 NP_037486 NP_473367


NP_001258471 NP_001258472 NP_035265 NP_001348867 NP_001348868

Локус (UCSC)

Хр. 8: 17.22 – 17.25 Mb

Хр. 8: 40.95 – 40.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CNOT7 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 285 амінокислот, а молекулярна маса — 32 745^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAATVDHSQ	RICEVWACNL	DEEMKKIRQV	IRKYNYVAMD	TEFPGVVARP
IGEFRSNADY	QYQLLRCNVD	LLKIIQLGLT	FMNEQGEYPP	GTSTWQFNFK
FNLTEDMYAQ	DSIELLTTSG	IQFKKHEEEG	IETQYFAELL	MTSGVVLCEG
VKWLSFHSGY	DFGYLIKILT	NSNLPEEELD	FFEILRLFFP	VIYDVKYLMK
SCKNLKGGLQ	EVAEQLELER	IGPQHQAGSD	SLLTGMAFFK	MREMFFEDHI
DDAKYCGHLY	GLGSGSSYVQ	NGTGNAYEEE	ANKQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bianchin C., Mauxion F., Sentis S., Seraphin B., Corbo L. (2005). Conservation of the deadenylase activity of proteins of the Caf1 family in human. RNA. 11: 487—494. PMID 15769875 DOI:10.1261/rna.7135305
Aslam A., Mittal S., Koch F., Andrau J.C., Winkler G.S. (2009). The Ccr4-NOT deadenylase subunits CNOT7 and CNOT8 have overlapping roles and modulate cell proliferation. Mol. Biol. Cell. 20: 3840—3850. PMID 19605561 DOI:10.1091/mbc.E09-02-0146
Cooke A., Prigge A., Wickens M. (2010). Translational repression by deadenylases. J. Biol. Chem. 285: 28506—28513. PMID 20634287 DOI:10.1074/jbc.M110.150763
Piao X., Zhang X., Wu L., Belasco J.G. (2010). CCR4-NOT deadenylates mRNA associated with complexes in human cells. Mol. Cell. Biol. 30: 1486—1494. PMID 20065043 DOI:10.1128/MCB.01481-09
Doidge R., Mittal S., Aslam A., Winkler G.S. (2012). The anti-proliferative activity of BTG/TOB proteins is mediated via the Caf1a (CNOT7) and Caf1b (CNOT8) deadenylase subunits of the Ccr4-not complex. PLoS ONE. 7: E51331—E51331. PMID 23236473 DOI:10.1371/journal.pone.0051331

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14101 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UIV1 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.