CPSF1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CPSF1, CPSF160, HSU37012, P/cl.18, cleavage and polyadenylation specific factor 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606027 MGI: 2679722 HomoloGene: 40865 GeneCards: CPSF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleic acid binding • enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA polyadenylation • mRNA processing • mRNA cleavage • mRNA 3'-end processing • mRNA export from nucleus • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a5/PBB_GE_CPSF1_201638_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CPSF1_201638_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9c/PBB_GE_CPSF1_201639_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CPSF1_201639_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b9/PBB_GE_CPSF1_33132_at_fs.png/250px-PBB_GE_CPSF1_33132_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001164173 NM_053193 NM_001361485 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001157645 NP_444423 NP_001348414 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 144.39 – 144.41 Mb | Хр. 15: 76.48 – 76.49 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CPSF1 (англ. Cleavage and polyadenylation specific factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 443 амінокислот, а молекулярна маса — 160 884[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MYAVYKQAHP | | PTGLEFSMYC | | NFFNNSERNL | | VVAGTSQLYV | | YRLNRDAEAL |
TKNDRSTEGK | | AHREKLELAA | | SFSFFGNVMS | | MASVQLAGAK | | RDALLLSFKD |
AKLSVVEYDP | | GTHDLKTLSL | | HYFEEPELRD | | GFVQNVHTPR | | VRVDPDGRCA |
AMLVYGTRLV | | VLPFRRESLA | | EEHEGLVGEG | | QRSSFLPSYI | | IDVRALDEKL |
LNIIDLQFLH | | GYYEPTLLIL | | FEPNQTWPGR | | VAVRQDTCSI | | VAISLNITQK |
VHPVIWSLTS | | LPFDCTQALA | | VPKPIGGVVV | | FAVNSLLYLN | | QSVPPYGVAL |
NSLTTGTTAF | | PLRTQEGVRI | | TLDCAQATFI | | SYDKMVISLK | | GGEIYVLTLI |
TDGMRSVRAF | | HFDKAAASVL | | TTSMVTMEPG | | YLFLGSRLGN | | SLLLKYTEKL |
QEPPASAVRE | | AADKEEPPSK | | KKRVDATAGW | | SAAGKSVPQD | | EVDEIEVYGS |
EAQSGTQLAT | | YSFEVCDSIL | | NIGPCANAAV | | GEPAFLSEEF | | QNSPEPDLEI |
VVCSGHGKNG | | ALSVLQKSIR | | PQVVTTFELP | | GCYDMWTVIA | | PVRKEEEDNP |
KGEGTEQEPS | | TTPEADDDGR | | RHGFLILSRE | | DSTMILQTGQ | | EIMELDTSGF |
ATQGPTVFAG | | NIGDNRYIVQ | | VSPLGIRLLE | | GVNQLHFIPV | | DLGAPIVQCA |
VADPYVVIMS | | AEGHVTMFLL | | KSDSYGGRHH | | RLALHKPPLH | | HQSKVITLCL |
YRDLSGMFTT | | ESRLGGARDE | | LGGRSGPEAE | | GLGSETSPTV | | DDEEEMLYGD |
SGSLFSPSKE | | EARRSSQPPA | | DRDPAPFRAE | | PTHWCLLVRE | | NGTMEIYQLP |
DWRLVFLVKN | | FPVGQRVLVD | | SSFGQPTTQG | | EARREEATRQ | | GELPLVKEVL |
LVALGSRQSR | | PYLLVHVDQE | | LLIYEAFPHD | | SQLGQGNLKV | | RFKKVPHNIN |
FREKKPKPSK | | KKAEGGGAEE | | GAGARGRVAR | | FRYFEDIYGY | | SGVFICGPSP |
HWLLVTGRGA | | LRLHPMAIDG | | PVDSFAPFHN | | VNCPRGFLYF | | NRQGELRISV |
LPAYLSYDAP | | WPVRKIPLRC | | TAHYVAYHVE | | SKVYAVATST | | NTPCARIPRM |
TGEEKEFETI | | ERDERYIHPQ | | QEAFSIQLIS | | PVSWEAIPNA | | RIELQEWEHV |
TCMKTVSLRS | | EETVSGLKGY | | VAAGTCLMQG | | EEVTCRGRIL | | IMDVIEVVPE |
PGQPLTKNKF | | KVLYEKEQKG | | PVTALCHCNG | | HLVSAIGQKI | | FLWSLRASEL |
TGMAFIDTQL | | YIHQMISVKN | | FILAADVMKS | | ISLLRYQEES | | KTLSLVSRDA |
KPLEVYSVDF | | MVDNAQLGFL | | VSDRDRNLMV | | YMYLPEAKES | | FGGMRLLRRA |
DFHVGAHVNT | | FWRTPCRGAT | | EGLSKKSVVW | | ENKHITWFAT | | LDGGIGLLLP |
MQEKTYRRLL | | MLQNALTTML | | PHHAGLNPRA | | FRMLHVDRRT | | LQNAVRNVLD |
GELLNRYLYL | | STMERSELAK | | KIGTTPDIIL | | DDLLETDRVT | | AHF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Murthy K.G., Manley J.L. (1995). The 160-kD subunit of human cleavage-polyadenylation specificity factor coordinates pre-mRNA 3'-end formation. Genes Dev. 9: 2672—2683. PMID 7590244 DOI:10.1101/gad.9.21.2672
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- McCracken S., Lambermon M., Blencowe B.J. (2002). SRm160 splicing coactivator promotes transcript 3'-end cleavage. Mol. Cell. Biol. 22: 148—160. PMID 11739730 DOI:10.1128/MCB.22.1.148-160.2002
- Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
- Laishram R.S., Anderson R.A. (2010). The poly A polymerase Star-PAP controls 3'-end cleavage by promoting CPSF interaction and specificity toward the pre-mRNA. EMBO J. 29: 4132—4145. PMID 21102410 DOI:10.1038/emboj.2010.287
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2324 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q10570 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |