CPSF1

Ідентифікатори

Символи

CPSF1, CPSF160, HSU37012, P/cl.18, cleavage and polyadenylation specific factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606027 MGI: 2679722 HomoloGene: 40865 GeneCards: CPSF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding • enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding • RNA binding
Клітинна компонента	• mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA polyadenylation • mRNA processing • mRNA cleavage • mRNA 3'-end processing • mRNA export from nucleus • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


29894


94230

Ensembl


ENSG00000071894


ENSMUSG00000034022

UniProt


Q10570


Q9EPU4

RefSeq (мРНК)


NM_013291


NM_001164173 NM_053193 NM_001361485

RefSeq (білок)


NP_037423


NP_001157645 NP_444423 NP_001348414

Локус (UCSC)

Хр. 8: 144.39 – 144.41 Mb

Хр. 15: 76.48 – 76.49 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CPSF1 (англ. Cleavage and polyadenylation specific factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 443 амінокислот, а молекулярна маса — 160 884^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYAVYKQAHP	PTGLEFSMYC	NFFNNSERNL	VVAGTSQLYV	YRLNRDAEAL
TKNDRSTEGK	AHREKLELAA	SFSFFGNVMS	MASVQLAGAK	RDALLLSFKD
AKLSVVEYDP	GTHDLKTLSL	HYFEEPELRD	GFVQNVHTPR	VRVDPDGRCA
AMLVYGTRLV	VLPFRRESLA	EEHEGLVGEG	QRSSFLPSYI	IDVRALDEKL
LNIIDLQFLH	GYYEPTLLIL	FEPNQTWPGR	VAVRQDTCSI	VAISLNITQK
VHPVIWSLTS	LPFDCTQALA	VPKPIGGVVV	FAVNSLLYLN	QSVPPYGVAL
NSLTTGTTAF	PLRTQEGVRI	TLDCAQATFI	SYDKMVISLK	GGEIYVLTLI
TDGMRSVRAF	HFDKAAASVL	TTSMVTMEPG	YLFLGSRLGN	SLLLKYTEKL
QEPPASAVRE	AADKEEPPSK	KKRVDATAGW	SAAGKSVPQD	EVDEIEVYGS
EAQSGTQLAT	YSFEVCDSIL	NIGPCANAAV	GEPAFLSEEF	QNSPEPDLEI
VVCSGHGKNG	ALSVLQKSIR	PQVVTTFELP	GCYDMWTVIA	PVRKEEEDNP
KGEGTEQEPS	TTPEADDDGR	RHGFLILSRE	DSTMILQTGQ	EIMELDTSGF
ATQGPTVFAG	NIGDNRYIVQ	VSPLGIRLLE	GVNQLHFIPV	DLGAPIVQCA
VADPYVVIMS	AEGHVTMFLL	KSDSYGGRHH	RLALHKPPLH	HQSKVITLCL
YRDLSGMFTT	ESRLGGARDE	LGGRSGPEAE	GLGSETSPTV	DDEEEMLYGD
SGSLFSPSKE	EARRSSQPPA	DRDPAPFRAE	PTHWCLLVRE	NGTMEIYQLP
DWRLVFLVKN	FPVGQRVLVD	SSFGQPTTQG	EARREEATRQ	GELPLVKEVL
LVALGSRQSR	PYLLVHVDQE	LLIYEAFPHD	SQLGQGNLKV	RFKKVPHNIN
FREKKPKPSK	KKAEGGGAEE	GAGARGRVAR	FRYFEDIYGY	SGVFICGPSP
HWLLVTGRGA	LRLHPMAIDG	PVDSFAPFHN	VNCPRGFLYF	NRQGELRISV
LPAYLSYDAP	WPVRKIPLRC	TAHYVAYHVE	SKVYAVATST	NTPCARIPRM
TGEEKEFETI	ERDERYIHPQ	QEAFSIQLIS	PVSWEAIPNA	RIELQEWEHV
TCMKTVSLRS	EETVSGLKGY	VAAGTCLMQG	EEVTCRGRIL	IMDVIEVVPE
PGQPLTKNKF	KVLYEKEQKG	PVTALCHCNG	HLVSAIGQKI	FLWSLRASEL
TGMAFIDTQL	YIHQMISVKN	FILAADVMKS	ISLLRYQEES	KTLSLVSRDA
KPLEVYSVDF	MVDNAQLGFL	VSDRDRNLMV	YMYLPEAKES	FGGMRLLRRA
DFHVGAHVNT	FWRTPCRGAT	EGLSKKSVVW	ENKHITWFAT	LDGGIGLLLP
MQEKTYRRLL	MLQNALTTML	PHHAGLNPRA	FRMLHVDRRT	LQNAVRNVLD
GELLNRYLYL	STMERSELAK	KIGTTPDIIL	DDLLETDRVT	AHF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Murthy K.G., Manley J.L. (1995). The 160-kD subunit of human cleavage-polyadenylation specificity factor coordinates pre-mRNA 3'-end formation. Genes Dev. 9: 2672—2683. PMID 7590244 DOI:10.1101/gad.9.21.2672
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
McCracken S., Lambermon M., Blencowe B.J. (2002). SRm160 splicing coactivator promotes transcript 3'-end cleavage. Mol. Cell. Biol. 22: 148—160. PMID 11739730 DOI:10.1128/MCB.22.1.148-160.2002
Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
Laishram R.S., Anderson R.A. (2010). The poly A polymerase Star-PAP controls 3'-end cleavage by promoting CPSF interaction and specificity toward the pre-mRNA. EMBO J. 29: 4132—4145. PMID 21102410 DOI:10.1038/emboj.2010.287

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2324 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q10570 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.