CSF1

CSF1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1HMC, 3UEZ, 3UF2, 4ADF, 4FA8, 4WRL, 4WRM

Ідентифікатори
Символи CSF1, CSF-1, MCSF, colony stimulating factor 1
Зовнішні ІД OMIM: 120420 MGI: 1339753 HomoloGene: 7282 GeneCards: CSF1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• macrophage colony-stimulating factor receptor binding
• protein homodimerization activity
• growth factor activity
• cytokine activity
• identical protein binding

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• perinuclear region of cytoplasm
• CSF1-CSF1R complex
• мембрана
• міжклітинний простір
• endoplasmic reticulum lumen
• extracellular region
• клітинна мембрана

Біологічний процес

• positive regulation of microglial cell migration
• диференціація клітин
• GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process
• mammary gland fat development
• branching involved in mammary gland duct morphogenesis
• transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
• процес імунної системи
• positive regulation of Ras protein signal transduction
• positive regulation of macrophage colony-stimulating factor signaling pathway
• mammary duct terminal end bud growth
• monocyte activation
• positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• macrophage colony-stimulating factor signaling pathway
• positive regulation of odontogenesis of dentin-containing tooth
• positive regulation of cell population proliferation
• regulation of macrophage derived foam cell differentiation
• positive regulation of multicellular organism growth
• homeostasis of number of cells within a tissue
• regulation of ossification
• inflammatory response
• positive regulation of macrophage chemotaxis
• вроджений імунітет
• positive regulation of mononuclear cell proliferation
• osteoclast proliferation
• positive regulation of osteoclast differentiation
• positive regulation of cell migration
• positive regulation of monocyte differentiation
• positive regulation of protein kinase activity
• developmental process involved in reproduction
• positive regulation of cell-matrix adhesion
• positive regulation of macrophage differentiation
• проліферація
• macrophage differentiation
• посттрансляційна модифікація
• regulation of signaling receptor activity
• cytokine-mediated signaling pathway
• кровотворення
• osteoclast differentiation
• response to ischemia
• microglial cell proliferation
• negative regulation of neuron death

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1435
12977
Ensembl
ENSG00000184371
ENSMUSG00000014599
UniProt
P09603
P07141
RefSeq (мРНК)
NM_172212
NM_000757
NM_172210
NM_172211
NM_001113529
NM_001113530
NM_007778
RefSeq (білок)
NP_000748
NP_757349
NP_757350
NP_757351
NP_001107001
NP_001107002
NP_031804
Локус (UCSC) Хр. 1: 109.91 – 109.93 Mb Хр. 3: 107.65 – 107.67 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CSF1 (англ. Colony stimulating factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 554 амінокислот, а молекулярна маса — 60 179[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTAPGAAGRCPPTTWLGSLLLLVCLLASRSITEEVSEYCSHMIGSGHLQS
LQRLIDSQMETSCQITFEFVDQEQLKDPVCYLKKAFLLVQDIMEDTMRFR
DNTPNAIAIVQLQELSLRLKSCFTKDYEEHDKACVRTFYETPLQLLEKVK
NVFNETKNLLDKDWNIFSKNCNNSFAECSSQDVVTKPDCNCLYPKAIPSS
DPASVSPHQPLAPSMAPVAGLTWEDSEGTEGSSLLPGEQPLHTVDPGSAK
QRPPRSTCQSFEPPETPVVKDSTIGGSPQPRPSVGAFNPGMEDILDSAMG
TNWVPEEASGEASEIPVPQGTELSPSRPGGGSMQTEPARPSNFLSASSPL
PASAKGQQPADVTGTALPRVGPVRPTGQDWNHTPQKTDHPSALLRDPPEP
GSPRISSLRPQGLSNPSTLSAQPQLSRSHSSGSVLPLGELEGRRSTRDRR
SPAEPEGGPASEGAARPLPRFNSVPLTDTGHERQSEGSFSPQLQESVFHL
LVPSVILVLLAVGGLLFYRWRRRSHQEPQRADSPLEQPEGSPLTQDDRQV
ELPV

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, факторів росту. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Pampfer S., Tabibzadeh S., Chuan F.-C., Pollard J.W. (1991). Expression of colony-stimulating factor-1 (CSF-1) messenger RNA in human endometrial glands during the menstrual cycle: molecular cloning of a novel transcript that predicts a cell surface form of CSF-1. Mol. Endocrinol. 5: 1931—1938. PMID 1791839 DOI:10.1210/mend-5-12-1931
  • Sakai N., Umeda T., Suzuki H., Ishimatsu Y., Shikita M. (1987). Macrophage colony-stimulating factor purified from normal human urine. Amino-terminal sequence and amino acid composition. FEBS Lett. 222: 341—344. PMID 3498652 DOI:10.1016/0014-5793(87)80398-8
  • Rettenmier C.W., Roussel M.F. (1988). Differential processing of colony-stimulating factor 1 precursors encoded by two human cDNAs. Mol. Cell. Biol. 8: 5026—5034. PMID 3264877 DOI:10.1128/MCB.8.11.5026
  • Glocker M.O., Arbogast B., Schreurs J., Deinzer M.L. (1993). Assignment of the inter- and intramolecular disulfide linkages in recombinant human macrophage colony stimulating factor using fast atom bombardment mass spectrometry. Biochemistry. 32: 482—488. PMID 8422357 DOI:10.1021/bi00053a012
  • Pixley F.J., Stanley E.R. (2004). CSF-1 regulation of the wandering macrophage: complexity in action. Trends Cell Biol. 14: 628—638. PMID 15519852 DOI:10.1016/j.tcb.2004.09.016

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2432 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 25 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, P09603 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.