CSTF3 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d5/Protein_CSTF3_PDB_2ond.png/250px-Protein_CSTF3_PDB_2ond.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2OND, 2OOE | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CSTF3, CSTF-77, cleavage stimulation factor subunit 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600367 MGI: 1351825 HomoloGene: 1014 GeneCards: CSTF3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA polyadenylation • mRNA cleavage • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA processing • mRNA 3'-end processing • RNA 3'-end processing |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/82/PBB_GE_CSTF3_203947_at_fs.png/250px-PBB_GE_CSTF3_203947_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001033505 NM_001033506 NM_001326 |
| | NM_001037326 NM_145529 NM_177253 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001028677 NP_001028678 NP_001317 |
| | NP_001032403 NP_663504 NP_796227 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 33.08 – 33.16 Mb | Хр. 2: 104.42 – 104.5 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CSTF3 (англ. Cleavage stimulation factor subunit 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 717 амінокислот, а молекулярна маса — 82 922[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSGDGATEQA | | AEYVPEKVKK | | AEKKLEENPY | | DLDAWSILIR | | EAQNQPIDKA |
RKTYERLVAQ | | FPSSGRFWKL | | YIEAEIKAKN | | YDKVEKLFQR | | CLMKVLHIDL |
WKCYLSYVRE | | TKGKLPSYKE | | KMAQAYDFAL | | DKIGMEIMSY | | QIWVDYINFL |
KGVEAVGSYA | | ENQRITAVRR | | VYQRGCVNPM | | INIEQLWRDY | | NKYEEGINIH |
LAKKMIEDRS | | RDYMNARRVA | | KEYETVMKGL | | DRNAPSVPPQ | | NTPQEAQQVD |
MWKKYIQWEK | | SNPLRTEDQT | | LITKRVMFAY | | EQCLLVLGHH | | PDIWYEAAQY |
LEQSSKLLAE | | KGDMNNAKLF | | SDEAANIYER | | AISTLLKKNM | | LLYFAYADYE |
ESRMKYEKVH | | SIYNRLLAIE | | DIDPTLVYIQ | | YMKFARRAEG | | IKSGRMIFKK |
AREDTRTRHH | | VYVTAALMEY | | YCSKDKSVAF | | KIFELGLKKY | | GDIPEYVLAY |
IDYLSHLNED | | NNTRVLFERV | | LTSGSLPPEK | | SGEIWARFLA | | FESNIGDLAS |
ILKVEKRRFT | | AFKEEYEGKE | | TALLVDRYKF | | MDLYPCSASE | | LKALGYKDVS |
RAKLAAIIPD | | PVVAPSIVPV | | LKDEVDRKPE | | YPKPDTQQMI | | PFQPRHLAPP |
GLHPVPGGVF | | PVPPAAVVLM | | KLLPPPICFQ | | GPFVQVDELM | | EIFRRCKIPN |
TVEEAVRIIT | | GGAPELAVEG | | NGPVESNAVL | | TKAVKRPNED | | SDEDEEKGAV |
VPPVHDIYRA | | RQQKRIR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Takagaki Y., Manley J.L. (1994). A subunit of the polyadenylation factor CstF is the human homologue of the Drosophila suppressor of forked protein. Nature. 372: 471—474. PMID 7984242 DOI:10.1038/372471a0
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Takagaki Y., Manley J.L. (2000). Complex protein interactions within the human polyadenylation machinery identify a novel component. Mol. Cell. Biol. 20: 1515—1525. PMID 10669729 DOI:10.1128/MCB.20.5.1515-1525.2000
- Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2485 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q12996 (англ.) . Архів оригіналу за 2 серпня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |