CTSF |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CTSF, CATSF, CLN13, cathepsin F |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603539 MGI: 1861434 HomoloGene: 31194 GeneCards: CTSF |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
neuronal ceroid lipofuscinosis 13, adult neuronal ceroid lipofuscinosis[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity |
---|
Клітинна компонента | • extracellular vesicle • лізосома • lysosomal lumen • екзосома • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • протеоліз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 66.56 – 66.57 Mb | Хр. 19: 4.91 – 4.91 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CTSF (англ. Cathepsin F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 484 амінокислот, а молекулярна маса — 53 366[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPWLQLLSL | | LGLLPGAVAA | | PAQPRAASFQ | | AWGPPSPELL | | APTRFALEMF |
NRGRAAGTRA | | VLGLVRGRVR | | RAGQGSLYSL | | EATLEEPPCN | | DPMVCRLPVS |
KKTLLCSFQV | | LDELGRHVLL | | RKDCGPVDTK | | VPGAGEPKSA | | FTQGSAMISS |
LSQNHPDNRN | | ETFSSVISLL | | NEDPLSQDLP | | VKMASIFKNF | | VITYNRTYES |
KEEARWRLSV | | FVNNMVRAQK | | IQALDRGTAQ | | YGVTKFSDLT | | EEEFRTIYLN |
TLLRKEPGNK | | MKQAKSVGDL | | APPEWDWRSK | | GAVTKVKDQG | | MCGSCWAFSV |
TGNVEGQWFL | | NQGTLLSLSE | | QELLDCDKMD | | KACMGGLPSN | | AYSAIKNLGG |
LETEDDYSYQ | | GHMQSCNFSA | | EKAKVYINDS | | VELSQNEQKL | | AAWLAKRGPI |
SVAINAFGMQ | | FYRHGISRPL | | RPLCSPWLID | | HAVLLVGYGN | | RSDVPFWAIK |
NSWGTDWGEK | | GYYYLHRGSG | | ACGVNTMASS | | AVVD |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Локалізований у лізосомі.
Література
- Santamaria I., Velasco G., Pendas A.M., Paz A., Lopez-Otin C. (1999). Molecular cloning and structural and functional characterization of human cathepsin F, a new cysteine proteinase of the papain family with a long propeptide domain. J. Biol. Chem. 274: 13800—13809. PMID 10318784 DOI:10.1074/jbc.274.20.13800
- Naegler D.K., Sulea T., Menard R. (1999). Full-length cDNA of human cathepsin F predicts the presence of a cystatin domain at the N-terminus of the cysteine protease zymogen. Biochem. Biophys. Res. Commun. 257: 313—318. PMID 10198209 DOI:10.1006/bbrc.1999.0461
- Wex T., Wex H., Broemme D. (1999). The human cathepsin F gene -- a fusion product between an ancestral cathepsin and cystatin gene. Biol. Chem. 380: 1439—1442. PMID 10661872 DOI:10.1515/BC.1999.185
- Wex T., Levy B., Wex H., Bromme D. (1999). Human cathepsins F and W: a new subgroup of cathepsins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 259: 401—407. PMID 10362521 DOI:10.1006/bbrc.1999.0700
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Somoza J.R., Palmer J.T., Ho J.D. (2002). The crystal structure of human cathepsin F and its implications for the development of novel immunomodulators. J. Mol. Biol. 322: 559—568. PMID 12225749 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00780-5
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CTSF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2531 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UBX1 (англ.) . Архів оригіналу за 16 квітня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |