CTSV

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1FH0, 3H6S, 3KFQ

Ідентифікатори

Символи

CTSV, cathepsin V, CATL2, CTSL2, CTSU

Зовнішні ІД

OMIM: 603308 MGI: 88564 HomoloGene: 76699 GeneCards: CTSV

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity • пептидний зв'язок • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • aminopeptidase activity • hydrolase activity • serine-type endopeptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type carboxypeptidase activity • GO:0031493 histone binding • kininogen binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • перикаріон • apical part of cell • secretory granule • extracellular region • Мікроворсинки • вакуоля • lysosomal lumen • neuron projection • лізосома • external side of plasma membrane • міжклітинний простір • клітинне ядро • ядерце • GO:0016023 cytoplasmic vesicle
Біологічний процес	• male gonad development • GO:1904578 response to organic cyclic compound • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • cellular response to starvation • extracellular matrix disassembly • response to glucocorticoid • response to glucose • Sertoli cell differentiation • response to gonadotropin • протеоліз • cell communication • decidualization • Сперматогенез • multicellular organism aging • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • nerve development • autophagic cell death • response to odorant • regulation of keratinocyte differentiation • negative regulation of keratinocyte proliferation • protein processing • protein autoprocessing • hair follicle morphogenesis • regulation of actin cytoskeleton reorganization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1515


13039

Ensembl


ENSG00000136943


ENSMUSG00000021477

UniProt


O60911


P06797

RefSeq (мРНК)


NM_001333 NM_001201575


NM_009984

RefSeq (білок)


NP_001188504 NP_001324


NP_034114

Локус (UCSC)

Хр. 9: 97.03 – 97.16 Mb

Хр. 13: 64.51 – 64.52 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CTSV (англ. Cathepsin V) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 334 амінокислот, а молекулярна маса — 37 329^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNLSLVLAAF	CLGIASAVPK	FDQNLDTKWY	QWKATHRRLY	GANEEGWRRA
VWEKNMKMIE	LHNGEYSQGK	HGFTMAMNAF	GDMTNEEFRQ	MMGCFRNQKF
RKGKVFREPL	FLDLPKSVDW	RKKGYVTPVK	NQKQCGSCWA	FSATGALEGQ
MFRKTGKLVS	LSEQNLVDCS	RPQGNQGCNG	GFMARAFQYV	KENGGLDSEE
SYPYVAVDEI	CKYRPENSVA	NDTGFTVVAP	GKEKALMKAV	ATVGPISVAM
DAGHSSFQFY	KSGIYFEPDC	SSKNLDHGVL	VVGYGFEGAN	SNNSKYWLVK
NSWGPEWGSN	GYVKIAKDKN	NHCGIATAAS	YPNV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Локалізований у лізосомі.

Література

Broemme D., Li Z., Barnes M., Mehler E. (1999). Human cathepsin V functional expression, tissue distribution, electrostatic surface potential, enzymatic characterization, and chromosomal localization. Biochemistry. 38: 2377—2385. PMID 10029531 DOI:10.1021/bi982175f
Itoh R., Kawamoto S., Adachi W., Kinoshita S., Okubo K. (1999). Genomic organization and chromosomal localization of the human cathepsin L2 gene. DNA Res. 6: 137—140. PMID 10382972 DOI:10.1093/dnares/6.2.137
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Niwa Y., Suzuki T., Dohmae N., Umezawa K., Simizu S. (2012). Determination of cathepsin V activity and intracellular trafficking by N-glycosylation. FEBS Lett. 586: 3601—3607. PMID 22967898 DOI:10.1016/j.febslet.2012.08.001

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2538 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O60911 (англ.) . Архів оригіналу за 17 листопада 2016. Процитовано 8 вересня 2017.