CUL5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3DPL, 3DQV, 4JGH, 4N9F

Ідентифікатори

Символи

CUL5, VACM-1, VACM1, cullin 5, CUL-5

Зовнішні ІД

OMIM: 601741 MGI: 1922967 HomoloGene: 2597 GeneCards: CUL5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • calcium channel activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• cullin-RING ubiquitin ligase complex • гіалоплазма • Cul5-RING ubiquitin ligase complex • Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex • SCF ubiquitin ligase complex
Біологічний процес	• intrinsic apoptotic signaling pathway • проліферація • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of cell population proliferation • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0022415 viral process • ERBB2 signaling pathway • calcium ion transmembrane transport • cellular response to DNA damage stimulus • посттрансляційна модифікація • G1/S transition of mitotic cell cycle • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8065


75717

Ensembl


ENSG00000166266


ENSMUSG00000032030

UniProt


Q93034


Q9D5V5

RefSeq (мРНК)


NM_003478


NM_001161618 NM_027807

RefSeq (білок)


NP_003469


NP_001155090 NP_082083

Локус (UCSC)

Хр. 11: 108.01 – 108.11 Mb

Хр. 9: 53.53 – 53.58 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CUL5 (англ. Cullin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 780 амінокислот, а молекулярна маса — 90 955^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATSNLLKNK	GSLQFEDKWD	FMRPIVLKLL	RQESVTKQQW	FDLFSDVHAV
CLWDDKGPAK	IHQALKEDIL	EFIKQAQARV	LSHQDDTALL	KAYIVEWRKF
FTQCDILPKP	FCQLEITLMG	KQGSNKKSNV	EDSIVRKLML	DTWNESIFSN
IKNRLQDSAM	KLVHAERLGE	AFDSQLVIGV	RESYVNLCSN	PEDKLQIYRD
NFEKAYLDST	ERFYRTQAPS	YLQQNGVQNY	MKYADAKLKE	EEKRALRYLE
TRRECNSVEA	LMECCVNALV	TSFKETILAE	CQGMIKRNET	EKLHLMFSLM
DKVPNGIEPM	LKDLEEHIIS	AGLADMVAAA	ETITTDSEKY	VEQLLTLFNR
FSKLVKEAFQ	DDPRFLTARD	KAYKAVVNDA	TIFKLELPLK	QKGVGLKTQP
ESKCPELLAN	YCDMLLRKTP	LSKKLTSEEI	EAKLKEVLLV	LKYVQNKDVF
MRYHKAHLTR	RLILDISADS	EIEENMVEWL	REVGMPADYV	NKLARMFQDI
KVSEDLNQAF	KEMHKNNKLA	LPADSVNIKI	LNAGAWSRSS	EKVFVSLPTE
LEDLIPEVEE	FYKKNHSGRK	LHWHHLMSNG	IITFKNEVGQ	YDLEVTTFQL
AVLFAWNQRP	REKISFENLK	LATELPDAEL	RRTLWSLVAF	PKLKRQVLLY
EPQVNSPKDF	TEGTLFSVNQ	EFSLIKNAKV	QKRGKINLIG	RLQLTTERMR
EEENEGIVQL	RILRTQEAII	QIMKMRKKIS	NAQLQTELVE	ILKNMFLPQK
KMIKEQIEWL	IEHKYIRRDE	SDINTFIYMA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ohta T., Michel J.J., Schottelius A.J., Xiong Y. (1999). ROC1, a homolog of APC11, represents a family of cullin partners with an associated ubiquitin ligase activity. Mol. Cell. 3: 535—541. PMID 10230407 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80482-7
Harada J.N., Shevchenko A., Shevchenko A., Pallas D.C., Berk A.J. (2002). Analysis of the adenovirus E1B-55K-anchored proteome reveals its link to ubiquitination machinery. J. Virol. 76: 9194—9206. PMID 12186903 DOI:10.1128/JVI.76.18.9194-9206.2002
Mehle A., Goncalves J., Santa-Marta M., McPike M., Gabuzda D. (2004). Phosphorylation of a novel SOCS-box regulates assembly of the HIV-1 Vif-Cul5 complex that promotes APOBEC3G degradation. Genes Dev. 18: 2861—2866. PMID 15574592 DOI:10.1101/gad.1249904
Kohroki J., Nishiyama T., Nakamura T., Masuho Y. (2005). ASB proteins interact with cullin5 and Rbx2 to form E3 ubiquitin ligase complexes. FEBS Lett. 579: 6796—6802. PMID 16325183 DOI:10.1016/j.febslet.2005.11.016

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2556 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q93034 (англ.) . Архів оригіналу за 10 грудня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.