CXCL12

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1A15, 1QG7, 1SDF, 1VMC, 2J7Z, 2K01, 2K03, 2K04, 2K05, 2KEC, 2KED, 2KEE, 2KOL, 2NWG, 2SDF, 3GV3, 3HP3, 4LMQ, 4UAI, 2N55

Ідентифікатори

Символи

CXCL12, IRH, PBSF, SCYB12, SDF1, TLSF, TPAR1, C-X-C motif chemokine ligand 12

Зовнішні ІД

OMIM: 600835 MGI: 103556 HomoloGene: 128606 GeneCards: CXCL12

Онтологія гена
Молекулярна функція	• chemokine receptor binding • cytokine activity • chemokine activity • CXCR chemokine receptor binding • chemoattractant activity • growth factor activity • signaling receptor binding • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • extracellular region • екзосома • external side of plasma membrane • міжклітинний простір • цитоплазма • клітинне ядро • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• negative regulation of leukocyte tethering or rolling • G protein-coupled receptor signaling pathway • regulation of calcium ion transport • response to hypoxia • positive regulation of endothelial cell proliferation • positive regulation of cell migration • chemokine-mediated signaling pathway • adult locomotory behavior • response to mechanical stimulus • response to peptide hormone • positive regulation of monocyte chemotaxis • cellular calcium ion homeostasis • response to virus • neuron migration • response to heat • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • positive regulation of axon extension involved in axon guidance • кровообіг • telencephalon cell migration • хемотаксис • regulation of actin polymerization or depolymerization • positive regulation of calcium ion import • brain development • адгезія клітин • positive regulation of dopamine secretion • animal organ regeneration • positive regulation of neuron differentiation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of cell population proliferation • cell chemotaxis • negative regulation of leukocyte apoptotic process • response to radiation • positive regulation of T cell migration • positive regulation of cell adhesion • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive chemotaxis • induction of positive chemotaxis • defense response • response to ultrasound • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • T cell chemotaxis • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain • regulation of signaling receptor activity • axon guidance • GO:0022415 viral process • integrin activation • chemokine (C-X-C motif) ligand 12 signaling pathway • cellular response to chemokine • negative regulation of dendritic cell apoptotic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6387


20315

Ensembl


ENSG00000107562


ENSMUSG00000061353

UniProt


P48061


P40224

RefSeq (мРНК)


NM_199168 NM_000609 NM_001033886 NM_001178134 NM_001277990


NM_001012477 NM_013655 NM_021704

RefSeq (білок)


NP_000600 NP_001029058 NP_001171605 NP_001264919 NP_954637


NP_001012495 NP_038683 NP_068350

Локус (UCSC)

Хр. 10: 44.37 – 44.39 Mb

Хр. 6: 117.15 – 117.16 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CXCL12 або SDF-1(англ. C-X-C motif chemokine ligand 12) – білок, який кодується геном CXCL12, розташованим у людей на довгому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 93 амінокислот, а молекулярна маса — 10 666^[4]. Хемокін підродини CXC, взаємодіє з рецепторами CXCR4 і CXCR7 та відіграє важливу роль в ембріональному розвитку і гематопоезі.^[5] CXCL12 виступає не тільки як хемоатрактант: у деяких випадках він може стимулювати проліферацію клітин і сприяти їх виживанню.^[6]

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNAKVVVVLV		LVLTALCLSD		GKPVSLSYRC		PCRFFESHVA		RANVKHLKIL
NTPNCALQIV		ARLKNNNRQV		CIDPKLKWIQ		EYLEKALNKR		FKM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Функції

CXCL12 виконує безліч функцій як в дорослому організмі, так і в ході ембріонального розвитку. У першу чергу, CXCL12 є хемоаттрактантом для клітин, які мають його рецептори на мембрані, наприклад для B-лімфоцитів і гемопоетичних стовбурових клітин. Клітини строми кісткового мозку синтезують CXCL12, який забезпечує локалізацію гемопоетичних клітин-попередників у їх клітинних нішах і не дає їм завчасно покинути кістковий мозок. В ембріональному розвитку CXCL12 керує міграцією різних типів клітин і відіграє важливу роль у формуванні органів.^[7]

CXCL12 виступає як фактор росту для B-клітин і стимулює їх проліферацію. Крім того, CXCL12 може захищати злоякісні В-клітини від апоптозу при хронічному лімфоцитарному лейкозі.^[8]

Див. також

Хромосома 10

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10672 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018.
↑ UniProt, P48061 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018.
↑ Rankin S. M. Chemokines and adult bone marrow stem cells // Immunol Lett. — 2012. — Т. 145, вип. 1—2. — С. 47—54. — DOI:10.1016/j.imlet.2012.04.009. — PMID 22698183.
↑ Yu L., Cecil J., Peng S. B., Schrementi J., Kovacevic S., Paul D., Su E. W., Wang J. Identification and expression of novel isoforms of human stromal cell-derived factor 1 // Gene. — 2006. — Т. 7, вип. 374. — С. 174—179. — PMID 16626895.
↑ Lewellis S. W., Knaut H. Attractive guidance: how the chemokine SDF1/CXCL12 guides different cells to different locations // Semin Cell Dev Biol. — 2012. — Т. 23, вип. 3. — С. 333—340. — DOI:10.1016/j.semcdb.2012.03.009. — PMID 22414535.
↑ Burger J. A., Tsukada N., Burger M., Zvaifler N. J., Dell'Aquila M., Kipps T. J. Blood-derived nurse-like cells protect chronic lymphocytic leukemia B cells from spontaneous apoptosis through stromal cell-derived factor-1 // Blood. — 2000. — Т. 96, вип. 8. — С. 2655—2663. — PMID 11023495.^{[недоступне посилання з листопадаа 2019]}

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Veldkamp C.T., Peterson F.C., Pelzek A.J., Volkman B.F. (2005). The monomer-dimer equilibrium of stromal cell-derived factor-1 (CXCL 12) is altered by pH, phosphate, sulfate, and heparin. Protein Sci. 14: 1071—1081. PMID 15741341 DOI:10.1110/ps.041219505
Veldkamp C.T., Seibert C., Peterson F.C., Sakmar T.P., Volkman B.F. (2006). Recognition of a CXCR4 sulfotyrosine by the chemokine stromal cell-derived factor-1alpha (SDF-1alpha/CXCL12). J. Mol. Biol. 359: 1400—1409. PMID 16725153 DOI:10.1016/j.jmb.2006.04.052
Gozansky E.K., Louis J.M., Caffrey M., Clore G.M. (2005). Mapping the binding of the N-terminal extracellular tail of the CXCR4 receptor to stromal cell-derived factor-1alpha. J. Mol. Biol. 345: 651—658. PMID 15588815 DOI:10.1016/j.jmb.2004.11.003
Murphy J.W., Yuan H., Kong Y., Xiong Y., Lolis E.J. (2010). Heterologous quaternary structure of CXCL12 and its relationship to the CC chemokine family. Proteins. 78: 1331—1337. PMID 20077567 DOI:10.1002/prot.22666