CXCL16 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CXCL16

Ідентифікатори

Символи

CXCL16, CXCLG16, SR-PSOX, SRPSOX, C-X-C motif chemokine ligand 16

Зовнішні ІД

OMIM: 605398 MGI: 1932682 HomoloGene: 49694 GeneCards: CXCL16

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • chemokine activity • low-density lipoprotein particle receptor activity • scavenger receptor activity
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • мембрана • extracellular region • integral component of membrane • міжклітинний простір
Біологічний процес	• lymphocyte chemotaxis • positive regulation of cell growth • positive regulation of cell migration • рецептор-опосередкований ендоцитоз • response to tumor necrosis factor • response to cytokine • response to interferon-gamma • хемотаксис • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • T cell chemotaxis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


58191


66102

Ensembl


ENSG00000161921


ENSMUSG00000018920

UniProt


Q9H2A7


Q8BSU2

RefSeq (мРНК)


NM_022059 NM_001100812 NM_001386809


NM_023158

RefSeq (білок)


NP_001094282 NP_071342


NP_075647

Локус (UCSC)

Хр. 17: 4.73 – 4.74 Mb

Хр. 11: 70.34 – 70.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CXCL16 (англ. C-X-C motif chemokine ligand 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 17-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 254 амінокислот, а молекулярна маса — 27 579^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRDLRPGSR	VLLLLLLLLL	VYLTQPGNGN	EGSVTGSCYC	GKRISSDSPP
SVQFMNRLRK	HLRAYHRCLY	YTRFQLLSWS	VCGGNKDPWV	QELMSCLDLK
ECGHAYSGIV	AHQKHLLPTS	PPISQASEGA	SSDIHTPAQM	LLSTLQSTQR
PTLPVGSLSS	DKELTRPNET	TIHTAGHSLA	AGPEAGENQK	QPEKNAGPTA
RTSATVPVLC	LLAIIFILTA	ALSYVLCKRR	RGQSPQSSPD	LPVHYIPVAP
DSNT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як хемотаксис. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Matloubian M., David A., Engel S., Ryan J.E., Cyster J.G. (2000). A transmembrane CXC chemokine is a ligand for HIV-coreceptor Bonzo. Nat. Immunol. 1: 298—304. PMID 11017100 DOI:10.1038/79738
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16642 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H2A7 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.