CYFIP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3P8C, 4N78

Ідентифікатори

Символи

CYFIP1, P140SRA-1, SHYC, SRA-1, SRA1, cytoplasmic FMR1 interacting protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606322 MGI: 1338801 HomoloGene: 22628 GeneCards: CYFIP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA 7-methylguanosine cap binding • translation regulator activity
Клітинна компонента	• екзосома • цитоплазма • синапс • cell projection • міжклітинні контакти • гіалоплазма • SCAR complex • focal adhesion • lamellipodium • perinuclear region of cytoplasm • ruffle • mRNA cap binding complex • neuron projection • extracellular region • filopodium tip • secretory granule lumen • specific granule lumen • neuronal cell body • terminal bouton • dendritic spine • dendritic growth cone • axonal growth cone • excitatory synapse • central region of growth cone • peripheral region of growth cone • tertiary granule lumen • postsynapse
Біологічний процес	• Rac protein signal transduction • когнітивність • Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis • multicellular organism development • ruffle organization • axon extension • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • нейробіологія розвитку • regulation of cell shape • диференціація клітин • positive regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation • lamellipodium assembly • cellular response to insulin stimulus • neutrophil degranulation • positive regulation of axon extension • positive regulation of axonogenesis • response to electrical stimulus • positive regulation of dendrite development • positive regulation of ruffle assembly • negative regulation of synaptic vesicle recycling • neuron projection development • positive regulation of neurotrophin TRK receptor signaling pathway • dendrite extension • regulation of translation • modification of synaptic structure • GO:0000767 cell morphogenesis • axon guidance • cell projection assembly • regulation of translation at postsynapse, modulating synaptic transmission • regulation of modification of postsynaptic actin cytoskeleton
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23191


20430

Ensembl


ENSG00000280618 ENSG00000273749 ENSG00000288461


ENSMUSG00000030447

UniProt


Q7L576


Q7TMB8

RefSeq (мРНК)

NM_001033028 NM_001287810 NM_014608 NM_001324119 NM_001324120
NM_001324122 NM_001324123 NM_001324124 NM_001324125 NM_001324126


NM_001164661 NM_001164662 NM_011370

RefSeq (білок)

NP_001028200 NP_001274739 NP_001311048 NP_001311049 NP_001311051
NP_001311052 NP_001311053 NP_001311054 NP_001311055 NP_055423


NP_001158133 NP_001158134 NP_035500

Локус (UCSC)

Хр. 15: 22.87 – 22.98 Mb

Хр. 7: 55.49 – 55.58 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CYFIP1 (англ. Cytoplasmic FMR1 interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 253 амінокислот, а молекулярна маса — 145 182^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAQVTLEDA	LSNVDLLEEL	PLPDQQPCIE	PPPSSLLYQP	NFNTNFEDRN
AFVTGIARYI	EQATVHSSMN	EMLEEGQEYA	VMLYTWRSCS	RAIPQVKCNE
QPNRVEIYEK	TVEVLEPEVT	KLMNFMYFQR	NAIERFCGEV	RRLCHAERRK
DFVSEAYLIT	LGKFINMFAV	LDELKNMKCS	VKNDHSAYKR	AAQFLRKMAD
PQSIQESQNL	SMFLANHNKI	TQSLQQQLEV	ISGYEELLAD	IVNLCVDYYE
NRMYLTPSEK	HMLLKVMGFG	LYLMDGSVSN	IYKLDAKKRI	NLSKIDKYFK
QLQVVPLFGD	MQIELARYIK	TSAHYEENKS	RWTCTSSGSS	PQYNICEQMI
QIREDHMRFI	SELARYSNSE	VVTGSGRQEA	QKTDAEYRKL	FDLALQGLQL
LSQWSAHVME	VYSWKLVHPT	DKYSNKDCPD	SAEEYERATR	YNYTSEEKFA
LVEVIAMIKG	LQVLMGRMES	VFNHAIRHTV	YAALQDFSQV	TLREPLRQAI
KKKKNVIQSV	LQAIRKTVCD	WETGHEPFND	PALRGEKDPK	SGFDIKVPRR
AVGPSSTQLY	MVRTMLESLI	ADKSGSKKTL	RSSLEGPTIL	DIEKFHRESF
FYTHLINFSE	TLQQCCDLSQ	LWFREFFLEL	TMGRRIQFPI	EMSMPWILTD
HILETKEASM	MEYVLYSLDL	YNDSAHYALT	RFNKQFLYDE	IEAEVNLCFD
QFVYKLADQI	FAYYKVMAGS	LLLDKRLRSE	CKNQGATIHL	PPSNRYETLL
KQRHVQLLGR	SIDLNRLITQ	RVSAAMYKSL	ELAIGRFESE	DLTSIVELDG
LLEINRMTHK	LLSRYLTLDG	FDAMFREANH	NVSAPYGRIT	LHVFWELNYD
FLPNYCYNGS	TNRFVRTVLP	FSQEFQRDKQ	PNAQPQYLHG	SKALNLAYSS
IYGSYRNFVG	PPHFQVICRL	LGYQGIAVVM	EELLKVVKSL	LQGTILQYVK
TLMEVMPKIC	RLPRHEYGSP	GILEFFHHQL	KDIVEYAELK	TVCFQNLREV
GNAILFCLLI	EQSLSLEEVC	DLLHAAPFQN	ILPRVHVKEG	ERLDAKMKRL
ESKYAPLHLV	PLIERLGTPQ	QIAIAREGDL	LTKERLCCGL	SMFEVILTRI
RSFLDDPIWR	GPLPSNGVMH	VDECVEFHRL	WSAMQFVYCI	PVGTHEFTVE
QCFGDGLHWA	GCMIIVLLGQ	QRRFAVLDFC	YHLLKVQKHD	GKDEIIKNVP
LKKMVERIRK	FQILNDEIIT	ILDKYLKSGD	GEGTPVEHVR	CFQPPIHQSL
ASS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як пдтримання форми клітини, диференціація, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13759 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
↑ UniProt, Q7L576 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.