DCHS1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | DCHS1, CDH19, CDH25, CDHR6, FIB1, PCDH16, VMLDS1, MVP2, dachsous cadherin-related 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603057 MGI: 2685011 HomoloGene: 2771 GeneCards: DCHS1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Van Maldergem syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • apical part of cell • внутрішньоклітинний |
---|
Біологічний процес | • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cochlea development • cell migration involved in endocardial cushion formation • ossification involved in bone maturation • Нейрогенез • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • розвиток нирки • heart morphogenesis • hippo signaling • branching involved in ureteric bud morphogenesis • адгезія клітин • neural tube development • post-anal tail morphogenesis • mitral valve formation • digestive tract development • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • pattern specification process • nephron development • protein localization to plasma membrane • cell-cell adhesion • mitral valve morphogenesis • condensed mesenchymal cell proliferation • cell migration • anatomical structure morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 6.62 – 6.66 Mb | Хр. 7: 105.4 – 105.44 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DCHS1 (англ. Dachsous cadherin-related 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 298 амінокислот, а молекулярна маса — 346 181[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQKELGIVPS | | CPGMKSPRPH | | LLLPLLLLLL | | LLLGAGVPGA | | WGQAGSLDLQ |
IDEEQPAGTL | | IGDISAGLPA | | GTAAPLMYFI | | SAQEGSGVGT | | DLAIDEHSGV |
VRTARVLDRE | | QRDRYRFTAV | | TPDGATVEVT | | VRVADINDHA | | PAFPQARAAL |
QVPEHTAFGT | | RYPLEPARDA | | DAGRLGTQGY | | ALSGDGAGET | | FRLETRPGPD |
GTPVPELVVT | | GELDRENRSH | | YMLQLEAYDG | | GSPPRRAQAL | | LDVTLLDIND |
HAPAFNQSRY | | HAVVSESLAP | | GSPVLQVFAS | | DADAGVNGAV | | TYEINRRQSE |
GDGPFSIDAH | | TGLLQLERPL | | DFEQRRVHEL | | VVQARDGGAH | | PELGSAFVTV |
HVRDANDNQP | | SMTVIFLSAD | | GSPQVSEAAP | | PGQLVARISV | | SDPDDGDFAH |
VNVSLEGGEG | | HFALSTQDSV | | IYLVCVARRL | | DREERDAYNL | | RVTATDSGSP |
PLRAEAAFVL | | HVTDVNDNAP | | AFDRQLYRPE | | PLPEVALPGS | | FVVRVTARDP |
DQGTNGQVTY | | SLAPGAHTHW | | FSIDPTSGII | | TTAASLDYEL | | EPQPQLIVVA |
TDGGLPPLAS | | SATVSVALQD | | VNDNEPQFQR | | TFYNASLPEG | | TQPGTCFLQV |
TATDADSGPF | | GLLSYSLGAG | | LGSSGSPPFR | | IDAHSGDVCT | | TRTLDRDQGP |
SSFDFTVTAV | | DGGGLKSMVY | | VKVFLSDEND | | NPPQFYPREY | | AASISAQSPP |
GTAVLRLRAH | | DPDQGSHGRL | | SYHILAGNSP | | PLFTLDEQSG | | LLTVAWPLAR |
RANSVVQLEI | | GAEDGGGLQA | | EPSARVDISI | | VPGTPTPPIF | | EQLQYVFSVP |
EDVAPGTSVG | | IVQAHNPPGR | | LAPVTLSLSG | | GDPRGLFSLD | | AVSGLLQTLR |
PLDRELLGPV | | LELEVRAGSG | | VPPAFAVARV | | RVLLDDVNDN | | SPAFPAPEDT |
VLLPPNTAPG | | TPIYTLRALD | | PDSGVNSRVT | | FTLLAGGGGA | | FTVDPTTGHV |
RLMRPLGPSG | | GPAHELELEA | | RDGGSPPRTS | | HFRLRVVVQD | | VGTRGLAPRF |
NSPTYRVDLP | | SGTTAGTQVL | | QVQAQAPDGG | | PITYHLAAEG | | ASSPFGLEPQ |
SGWLWVRAAL | | DREAQELYIL | | KVMAVSGSKA | | ELGQQTGTAT | | VRVSILNQNE |
HSPRLSEDPT | | FLAVAENQPP | | GTSVGRVFAT | | DRDSGPNGRL | | TYSLQQLSED |
SKAFRIHPQT | | GEVTTLQTLD | | REQQSSYQLL | | VQVQDGGSPP | | RSTTGTVHVA |
VLDLNDNSPT | | FLQASGAAGG | | GLPIQVPDRV | | PPGTLVTTLQ | | AKDPDEGENG |
TILYTLTGPG | | SELFSLHPHS | | GELLTAAPLI | | RAERPHYVLT | | LSAHDQGSPP |
RSASLQLLVQ | | VLPSARLAEP | | PPDLAERDPA | | APVPVVLTVT | | AAEGLRPGSL |
LGSVAAPEPA | | GVGALTYTLV | | GGADPEGTFA | | LDAASGRLYL | | ARPLDFEAGP |
PWRALTVRAE | | GPGGAGARLL | | RVQVQVQDEN | | EHAPAFARDP | | LALALPENPE |
PGAALYTFRA | | SDADGPGPNS | | DVRYRLLRQE | | PPVPALRLDA | | RTGALSAPRG |
LDRETTPALL | | LLVEATDRPA | | NASRRRAARV | | SARVFVTDEN | | DNAPVFASPS |
RVRLPEDQPP | | GPAALHVVAR | | DPDLGEAARV | | SYRLASGGDG | | HFRLHSSTGA |
LSVVRPLDRE | | QRAEHVLTVV | | ASDHGSPPRS | | ATQVLTVSVA | | DVNDEAPTFQ |
QQEYSVLLRE | | NNPPGTSLLT | | LRATDPDVGA | | NGQVTYGGVS | | SESFSLDPDT |
GVLTTLRALD | | REEQEEINLT | | VYAQDRGSPP | | QLTHVTVRVA | | VEDENDHAPT |
FGSAHLSLEV | | PEGQDPQTLT | | MLRASDPDVG | | ANGQLQYRIL | | DGDPSGAFVL |
DLASGEFGTM | | RPLDREVEPA | | FQLRIEARDG | | GQPALSATLL | | LTVTVLDAND |
HAPAFPVPAY | | SVEVPEDVPA | | GTLLLQLQAH | | DPDAGANGHV | | TYYLGAGTAG |
AFLLEPSSGE | | LRTAAALDRE | | QCPSYTFSVS | | AVDGAAAGPL | | STTVSVTITV |
RDVNDHAPTF | | PTSPLRLRLP | | RPGPSFSTPT | | LALATLRAED | | RDAGANASIL |
YRLAGTPPPG | | TTVDSYTGEI | | RVARSPVALG | | PRDRVLFIVA | | TDLGRPARSA |
TGVIIVGLQG | | EAERGPRFPR | | ASSEATIREN | | APPGTPIVSP | | RAVHAGGTNG |
PITYSILSGN | | EKGTFSIQPS | | TGAITVRSAE | | GLDFEVSPRL | | RLVLQAESGG |
AFAFTVLTLT | | LQDANDNAPR | | FLRPHYVAFL | | PESRPLEGPL | | LQVEADDLDQ |
GSGGQISYSL | | AASQPARGLF | | HVDPTTGTIT | | TTAILDREIW | | AETRLVLMAT |
DRGSPALVGS | | ATLTVMVIDT | | NDNRPTIPQP | | WELRVSEDAL | | LGSEIAQVTG |
NDVDSGPVLW | | YVLSPSGPQD | | PFSVGRYGGR | | VSLTGPLDFE | | QCDRYQLQLL |
AHDGPHEGRA | | NLTVLVEDVN | | DNAPAFSQSL | | YQVMLLEHTP | | PGSAILSVSA |
TDRDSGANGH | | ISYHLASPAD | | GFSVDPNNGT | | LFTIVGTVAL | | GHDGSGAVDV |
VLEARDHGAP | | GRAARATVHV | | QLQDQNDHAP | | SFTLSHYRVA | | VTEDLPPGST |
LLTLEATDAD | | GSRSHAAVDY | | SIISGNWGRV | | FQLEPRLAEA | | GESAGPGPRA |
LGCLVLLEPL | | DFESLTQYNL | | TVAAADRGQP | | PQSSVVPVTV | | TVLDVNDNPP |
VFTRASYRVT | | VPEDTPVGAE | | LLHVEASDAD | | PGPHGLVRFT | | VSSGDPSGLF |
ELDESSGTLR | | LAHALDCETQ | | ARHQLVVQAA | | DPAGAHFALA | | PVTIEVQDVN |
DHGPAFPLNL | | LSTSVAENQP | | PGTLVTTLHA | | IDGDAGAFGR | | LRYSLLEAGP |
GPEGREAFAL | | NSSTGELRAR | | VPFDYEHTES | | FRLLVGAADA | | GNLSASVTVS |
VLVTGEDEYD | | PVFLAPAFHF | | QVPEGARRGH | | SLGHVQATDE | | DGGADGLVLY |
SLATSSPYFG | | INQTTGALYL | | RVDSRAPGSG | | TATSGGGGRT | | RREAPRELRL |
EVIARGPLPG | | SRSATVPVTV | | DITHTALGLA | | PDLNLLLVGA | | VAASLGVVVV |
LALAALVLGL | | VRARSRKAEA | | APGPMSQAAP | | LASDSLQKLG | | REPPSPPPSE |
HLYHQTLPSY | | GGPGAGGPYP | | RGGSLDPSHS | | SGRGSAEAAE | | DDEIRMINEF |
PRVASVASSL | | AARGPDSGIQ | | QDADGLSDTS | | CEPPAPDTWY | | KGRKAGLLLP |
GAGATLYREE | | GPPATATAFL | | GGCGLSPAPT | | GDYGFPADGK | | PCVAGALTAI |
VAGEEELRGS | | YNWDYLLSWC | | PQFQPLASVF | | TEIARLKDEA | | RPCPPAPRID |
PPPLITAVAH | | PGAKSVPPKP | | ANTAAARAIF | | PPASHRSPIS | | HEGSLSSAAM |
SPSFSPSLSP | | LAARSPVVSP | | FGVAQGPSAS | | ALSAESGLEP | | PDDTELHI |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Matsuyoshi N., Imamura S. (1997). Multiple cadherins are expressed in human fibroblasts. Biochem. Biophys. Res. Commun. 235: 355—358. PMID 9199196 DOI:10.1006/bbrc.1997.6707
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з DCHS1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13681 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96JQ0 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |