| DCHS1 |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | DCHS1, CDH19, CDH25, CDHR6, FIB1, PCDH16, VMLDS1, MVP2, dachsous cadherin-related 1 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 603057 MGI: 2685011 HomoloGene: 2771 GeneCards: DCHS1 |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Van Maldergem syndrome[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • calcium ion binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • integral component of membrane
• мембрана
• клітинна мембрана
• apical part of cell
• внутрішньоклітинний
|
|---|
| Біологічний процес | • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
• cochlea development
• cell migration involved in endocardial cushion formation
• ossification involved in bone maturation
• Нейрогенез
• heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
• розвиток нирки
• heart morphogenesis
• hippo signaling
• branching involved in ureteric bud morphogenesis
• адгезія клітин
• neural tube development
• post-anal tail morphogenesis
• mitral valve formation
• digestive tract development
• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
• pattern specification process
• nephron development
• protein localization to plasma membrane
• cell-cell adhesion
• mitral valve morphogenesis
• condensed mesenchymal cell proliferation
• cell migration
• anatomical structure morphogenesis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 11: 6.62 – 6.66 Mb | Хр. 7: 105.4 – 105.44 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DCHS1 (англ. Dachsous cadherin-related 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 298 амінокислот, а молекулярна маса — 346 181[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MQKELGIVPS | | CPGMKSPRPH | | LLLPLLLLLL | | LLLGAGVPGA | | WGQAGSLDLQ |
| IDEEQPAGTL | | IGDISAGLPA | | GTAAPLMYFI | | SAQEGSGVGT | | DLAIDEHSGV |
| VRTARVLDRE | | QRDRYRFTAV | | TPDGATVEVT | | VRVADINDHA | | PAFPQARAAL |
| QVPEHTAFGT | | RYPLEPARDA | | DAGRLGTQGY | | ALSGDGAGET | | FRLETRPGPD |
| GTPVPELVVT | | GELDRENRSH | | YMLQLEAYDG | | GSPPRRAQAL | | LDVTLLDIND |
| HAPAFNQSRY | | HAVVSESLAP | | GSPVLQVFAS | | DADAGVNGAV | | TYEINRRQSE |
| GDGPFSIDAH | | TGLLQLERPL | | DFEQRRVHEL | | VVQARDGGAH | | PELGSAFVTV |
| HVRDANDNQP | | SMTVIFLSAD | | GSPQVSEAAP | | PGQLVARISV | | SDPDDGDFAH |
| VNVSLEGGEG | | HFALSTQDSV | | IYLVCVARRL | | DREERDAYNL | | RVTATDSGSP |
| PLRAEAAFVL | | HVTDVNDNAP | | AFDRQLYRPE | | PLPEVALPGS | | FVVRVTARDP |
| DQGTNGQVTY | | SLAPGAHTHW | | FSIDPTSGII | | TTAASLDYEL | | EPQPQLIVVA |
| TDGGLPPLAS | | SATVSVALQD | | VNDNEPQFQR | | TFYNASLPEG | | TQPGTCFLQV |
| TATDADSGPF | | GLLSYSLGAG | | LGSSGSPPFR | | IDAHSGDVCT | | TRTLDRDQGP |
| SSFDFTVTAV | | DGGGLKSMVY | | VKVFLSDEND | | NPPQFYPREY | | AASISAQSPP |
| GTAVLRLRAH | | DPDQGSHGRL | | SYHILAGNSP | | PLFTLDEQSG | | LLTVAWPLAR |
| RANSVVQLEI | | GAEDGGGLQA | | EPSARVDISI | | VPGTPTPPIF | | EQLQYVFSVP |
| EDVAPGTSVG | | IVQAHNPPGR | | LAPVTLSLSG | | GDPRGLFSLD | | AVSGLLQTLR |
| PLDRELLGPV | | LELEVRAGSG | | VPPAFAVARV | | RVLLDDVNDN | | SPAFPAPEDT |
| VLLPPNTAPG | | TPIYTLRALD | | PDSGVNSRVT | | FTLLAGGGGA | | FTVDPTTGHV |
| RLMRPLGPSG | | GPAHELELEA | | RDGGSPPRTS | | HFRLRVVVQD | | VGTRGLAPRF |
| NSPTYRVDLP | | SGTTAGTQVL | | QVQAQAPDGG | | PITYHLAAEG | | ASSPFGLEPQ |
| SGWLWVRAAL | | DREAQELYIL | | KVMAVSGSKA | | ELGQQTGTAT | | VRVSILNQNE |
| HSPRLSEDPT | | FLAVAENQPP | | GTSVGRVFAT | | DRDSGPNGRL | | TYSLQQLSED |
| SKAFRIHPQT | | GEVTTLQTLD | | REQQSSYQLL | | VQVQDGGSPP | | RSTTGTVHVA |
| VLDLNDNSPT | | FLQASGAAGG | | GLPIQVPDRV | | PPGTLVTTLQ | | AKDPDEGENG |
| TILYTLTGPG | | SELFSLHPHS | | GELLTAAPLI | | RAERPHYVLT | | LSAHDQGSPP |
| RSASLQLLVQ | | VLPSARLAEP | | PPDLAERDPA | | APVPVVLTVT | | AAEGLRPGSL |
| LGSVAAPEPA | | GVGALTYTLV | | GGADPEGTFA | | LDAASGRLYL | | ARPLDFEAGP |
| PWRALTVRAE | | GPGGAGARLL | | RVQVQVQDEN | | EHAPAFARDP | | LALALPENPE |
| PGAALYTFRA | | SDADGPGPNS | | DVRYRLLRQE | | PPVPALRLDA | | RTGALSAPRG |
| LDRETTPALL | | LLVEATDRPA | | NASRRRAARV | | SARVFVTDEN | | DNAPVFASPS |
| RVRLPEDQPP | | GPAALHVVAR | | DPDLGEAARV | | SYRLASGGDG | | HFRLHSSTGA |
| LSVVRPLDRE | | QRAEHVLTVV | | ASDHGSPPRS | | ATQVLTVSVA | | DVNDEAPTFQ |
| QQEYSVLLRE | | NNPPGTSLLT | | LRATDPDVGA | | NGQVTYGGVS | | SESFSLDPDT |
| GVLTTLRALD | | REEQEEINLT | | VYAQDRGSPP | | QLTHVTVRVA | | VEDENDHAPT |
| FGSAHLSLEV | | PEGQDPQTLT | | MLRASDPDVG | | ANGQLQYRIL | | DGDPSGAFVL |
| DLASGEFGTM | | RPLDREVEPA | | FQLRIEARDG | | GQPALSATLL | | LTVTVLDAND |
| HAPAFPVPAY | | SVEVPEDVPA | | GTLLLQLQAH | | DPDAGANGHV | | TYYLGAGTAG |
| AFLLEPSSGE | | LRTAAALDRE | | QCPSYTFSVS | | AVDGAAAGPL | | STTVSVTITV |
| RDVNDHAPTF | | PTSPLRLRLP | | RPGPSFSTPT | | LALATLRAED | | RDAGANASIL |
| YRLAGTPPPG | | TTVDSYTGEI | | RVARSPVALG | | PRDRVLFIVA | | TDLGRPARSA |
| TGVIIVGLQG | | EAERGPRFPR | | ASSEATIREN | | APPGTPIVSP | | RAVHAGGTNG |
| PITYSILSGN | | EKGTFSIQPS | | TGAITVRSAE | | GLDFEVSPRL | | RLVLQAESGG |
| AFAFTVLTLT | | LQDANDNAPR | | FLRPHYVAFL | | PESRPLEGPL | | LQVEADDLDQ |
| GSGGQISYSL | | AASQPARGLF | | HVDPTTGTIT | | TTAILDREIW | | AETRLVLMAT |
| DRGSPALVGS | | ATLTVMVIDT | | NDNRPTIPQP | | WELRVSEDAL | | LGSEIAQVTG |
| NDVDSGPVLW | | YVLSPSGPQD | | PFSVGRYGGR | | VSLTGPLDFE | | QCDRYQLQLL |
| AHDGPHEGRA | | NLTVLVEDVN | | DNAPAFSQSL | | YQVMLLEHTP | | PGSAILSVSA |
| TDRDSGANGH | | ISYHLASPAD | | GFSVDPNNGT | | LFTIVGTVAL | | GHDGSGAVDV |
| VLEARDHGAP | | GRAARATVHV | | QLQDQNDHAP | | SFTLSHYRVA | | VTEDLPPGST |
| LLTLEATDAD | | GSRSHAAVDY | | SIISGNWGRV | | FQLEPRLAEA | | GESAGPGPRA |
| LGCLVLLEPL | | DFESLTQYNL | | TVAAADRGQP | | PQSSVVPVTV | | TVLDVNDNPP |
| VFTRASYRVT | | VPEDTPVGAE | | LLHVEASDAD | | PGPHGLVRFT | | VSSGDPSGLF |
| ELDESSGTLR | | LAHALDCETQ | | ARHQLVVQAA | | DPAGAHFALA | | PVTIEVQDVN |
| DHGPAFPLNL | | LSTSVAENQP | | PGTLVTTLHA | | IDGDAGAFGR | | LRYSLLEAGP |
| GPEGREAFAL | | NSSTGELRAR | | VPFDYEHTES | | FRLLVGAADA | | GNLSASVTVS |
| VLVTGEDEYD | | PVFLAPAFHF | | QVPEGARRGH | | SLGHVQATDE | | DGGADGLVLY |
| SLATSSPYFG | | INQTTGALYL | | RVDSRAPGSG | | TATSGGGGRT | | RREAPRELRL |
| EVIARGPLPG | | SRSATVPVTV | | DITHTALGLA | | PDLNLLLVGA | | VAASLGVVVV |
| LALAALVLGL | | VRARSRKAEA | | APGPMSQAAP | | LASDSLQKLG | | REPPSPPPSE |
| HLYHQTLPSY | | GGPGAGGPYP | | RGGSLDPSHS | | SGRGSAEAAE | | DDEIRMINEF |
| PRVASVASSL | | AARGPDSGIQ | | QDADGLSDTS | | CEPPAPDTWY | | KGRKAGLLLP |
| GAGATLYREE | | GPPATATAFL | | GGCGLSPAPT | | GDYGFPADGK | | PCVAGALTAI |
| VAGEEELRGS | | YNWDYLLSWC | | PQFQPLASVF | | TEIARLKDEA | | RPCPPAPRID |
| PPPLITAVAH | | PGAKSVPPKP | | ANTAAARAIF | | PPASHRSPIS | | HEGSLSSAAM |
| SPSFSPSLSP | | LAARSPVVSP | | FGVAQGPSAS | | ALSAESGLEP | | PDDTELHI |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Matsuyoshi N., Imamura S. (1997). Multiple cadherins are expressed in human fibroblasts. Biochem. Biophys. Res. Commun. 235: 355—358. PMID 9199196 DOI:10.1006/bbrc.1997.6707
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з DCHS1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13681 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96JQ0 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
