DCLRE1A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4B87, 5AHR

Ідентифікатори

Символи

DCLRE1A, PSO2, SNM1, SNM1A, DNA cross-link repair 1A

Зовнішні ІД

OMIM: 609682 MGI: 1930042 HomoloGene: 8920 GeneCards: DCLRE1A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• 5'-3' exodeoxyribonuclease activity • damaged DNA binding
Клітинна компонента	• fibrillar center • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• cellular response to DNA damage stimulus • клітинний цикл • double-strand break repair via nonhomologous end joining • interstrand cross-link repair • protection from non-homologous end joining at telomere • поділ клітини • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • GO:0100026 Репарація ДНК
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9937


55947

Ensembl


ENSG00000198924


ENSMUSG00000025077

UniProt


Q6PJP8


Q9JIC3

RefSeq (мРНК)


NM_001271816 NM_014881


NM_018831 NM_001360437 NM_001360438 NM_001360439

RefSeq (білок)


NP_001258745 NP_055696


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 10: 113.83 – 113.85 Mb

Хр. 19: 56.52 – 56.54 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DCLRE1A (англ. DNA cross-link repair 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 040 амінокислот, а молекулярна маса — 116 400^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLEDISEEDI	WEYKSKRKPK	RVDPNNGSKN	ILKSVEKATD	GKYQSKRSRN
RKRAAEAKEV	KDHEVPLGNA	GCQTSVASSQ	NSSCGDGIQQ	TQDKETTPGK
LCRTQKSQHV	SPKIRPVYDG	YCPNCQMPFS	SLIGQTPRWH	VFECLDSPPR
SETECPDGLL	CTSTIPFHYK	RYTHFLLAQS	RAGDHPFSSP	SPASGGSFSE
TKSGVLCSLE	ERWSSYQNQT	DNSVSNDPLL	MTQYFKKSPS	LTEASEKIST
HIQTSQQALQ	FTDFVENDKL	VGVALRLANN	SEHINLPLPE	NDFSDCEISY
SPLQSDEDTH	DIDEKPDDSQ	EQLFFTESSK	DGSLEEDDDS	CGFFKKRHGP
LLKDQDESCP	KVNSFLTRDK	YDEGLYRFNS	LNDLSQPISQ	NNESTLPYDL
ACTGGDFVLF	PPALAGKLAA	SVHQATKAKP	DEPEFHSAQS	NKQKQVIEES
SVYNQVSLPL	VKSLMLKPFE	SQVEGYLSSQ	PTQNTIRKLS	SENLNAKNNT
NSACFCRKAL	EGVPVGKATI	LNTENLSSTP	APKYLKILPS	GLKYNARHPS
TKVMKQMDIG	VYFGLPPKRK	EEKLLGESAL	EGINLNPVPS	PNQKRSSQCK
RKAEKSLSDL	EFDASTLHES	QLSVELSSER	SQRQKKRCRK	SNSLQEGACQ
KRSDHLINTE	SEAVNLSKVK	VFTKSAHGGL	QRGNKKIPES	SNVGGSRKKT
CPFYKKIPGT	GFTVDAFQYG	VVEGCTAYFL	THFHSDHYAG	LSKHFTFPVY
CSEITGNLLK	NKLHVQEQYI	HPLPLDTECI	VNGVKVVLLD	ANHCPGAVMI
LFYLPNGTVI	LHTGDFRADP	SMERSLLADQ	KVHMLYLDTT	YCSPEYTFPS
QQEVIRFAIN	TAFEAVTLNP	HALVVCGTYS	IGKEKVFLAI	ADVLGSKVGM
SQEKYKTLQC	LNIPEINSLI	TTDMCSSLVH	LLPMMQINFK	GLQSHLKKCG
GKYNQILAFR	PTGWTHSNKF	TRIADVIPQT	KGNISIYGIP	YSEHSSYLEM
KRFVQWLKPQ	KIIPTVNVGT	WKSRSTMEKY	FREWKLEAGY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang X., Richie C., Legerski R.J. (2002). Translation of hSNM1 is mediated by an internal ribosome entry site that upregulates expression during mitosis. DNA Repair. 1: 379—390. PMID 12509242

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17660 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6PJP8 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.