DCLRE1B |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3BUA, 5AHO | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DCLRE1B, APOLLO, SNM1B, SNMIB, DNA cross-link repair 1B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609683 MGI: 2156057 HomoloGene: 32553 GeneCards: DCLRE1B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • 5'-3' exonuclease activity • 5'-3' exodeoxyribonuclease activity • damaged DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • protein homodimerization activity • GO:0032403 protein-containing complex binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • центросома • хромосома • центр організації мікротрубочок • теломера • цитоскелет • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця |
---|
Біологічний процес | • cell cycle checkpoint signaling • protection from non-homologous end joining at telomere • telomeric 3' overhang formation • cellular response to DNA damage stimulus • double-strand break repair via nonhomologous end joining • telomere maintenance • telomeric loop formation • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • telomere maintenance via telomere lengthening • telomere capping • interstrand cross-link repair • mitotic cell cycle checkpoint signaling |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/ce/PBB_GE_DCLRE1B_219490_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_DCLRE1B_219490_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_022836 NM_001319946 NM_001319947 NM_001363690 NM_001363691 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001306875 NP_001306876 NP_073747 NP_001350619 NP_001350620 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 113.91 – 113.91 Mb | Хр. 3: 103.71 – 103.72 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DCLRE1B (англ. DNA cross-link repair 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 532 амінокислот, а молекулярна маса — 60 002[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNGVLIPHTP | | IAVDFWSLRR | | AGTARLFFLS | | HMHSDHTVGL | | SSTWARPLYC |
SPITAHLLHR | | HLQVSKQWIQ | | ALEVGESHVL | | PLDEIGQETM | | TVTLLDANHC |
PGSVMFLFEG | | YFGTILYTGD | | FRYTPSMLKE | | PALTLGKQIH | | TLYLDNTNCN |
PALVLPSRQE | | AAHQIVQLIR | | KHPQHNIKIG | | LYSLGKESLL | | EQLALEFQTW |
VVLSPRRLEL | | VQLLGLADVF | | TVEEKAGRIH | | AVDHMEICHS | | NMLRWNQTHP |
TIAILPTSRK | | IHSSHPDIHV | | IPYSDHSSYS | | ELRAFVAALK | | PCQVVPIVSR |
RPCGGFQDSL | | SPRISVPLIP | | DSVQQYMSSS | | SRKPSLLWLL | | ERRLKRPRTQ |
GVVFESPEES | | ADQSQADRDS | | KKAKKEKLSP | | WPADLEKQPS | | HHPLRIKKQL |
FPDLYSKEWN | | KAVPFCESQK | | RVTMLTAPLG | | FSVHLRSTDE | | EFISQKTREE |
IGLGSPLVPM | | GDDDGGPEAT | | GNQSAWMGHG | | SPLSHSSKGT | | PLLATEFRGL |
ALKYLLTPVN | | FFQAGYSSRR | | FDQQVEKYHK | | PC |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Demuth I., Digweed M., Concannon P. (2004). Human SNM1B is required for normal cellular response to both DNA interstrand crosslink-inducing agents and ionizing radiation. Oncogene. 23: 8611—8618. PMID 15467758 DOI:10.1038/sj.onc.1207895
- van Overbeek M., de Lange T. (2006). Apollo, an Artemis-related nuclease, interacts with TRF2 and protects human telomeres in S phase. Curr. Biol. 16: 1295—1302. PMID 16730176 DOI:10.1016/j.cub.2006.05.022
- Freibaum B.D., Counter C.M. (2006). hSnm1B is a novel telomere-associated protein. J. Biol. Chem. 281: 15033—15036. PMID 16606622 DOI:10.1074/jbc.C600038200
- Freibaum B.D., Counter C.M. (2008). The protein hSnm1B is stabilized when bound to the telomere-binding protein TRF2. J. Biol. Chem. 283: 23671—23676. PMID 18593705 DOI:10.1074/jbc.M800388200
- Anders M., Mattow J., Digweed M., Demuth I. (2009). Evidence for hSNM1B/Apollo functioning in the HSP70 mediated DNA damage response. Cell Cycle. 8: 1725—1732. PMID 19411856 DOI:10.4161/cc.8.11.8605
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17641 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H816 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |