DCLRE1B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3BUA, 5AHO

Ідентифікатори

Символи

DCLRE1B, APOLLO, SNM1B, SNMIB, DNA cross-link repair 1B

Зовнішні ІД

OMIM: 609683 MGI: 2156057 HomoloGene: 32553 GeneCards: DCLRE1B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• 5'-3' exonuclease activity • 5'-3' exodeoxyribonuclease activity • damaged DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • protein homodimerization activity • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • центросома • хромосома • центр організації мікротрубочок • теломера • цитоскелет • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес	• cell cycle checkpoint signaling • protection from non-homologous end joining at telomere • telomeric 3' overhang formation • cellular response to DNA damage stimulus • double-strand break repair via nonhomologous end joining • telomere maintenance • telomeric loop formation • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • telomere maintenance via telomere lengthening • telomere capping • interstrand cross-link repair • mitotic cell cycle checkpoint signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64858


140917

Ensembl


ENSG00000118655


ENSMUSG00000027845

UniProt


Q9H816


Q8C7W7

RefSeq (мРНК)


NM_022836 NM_001319946 NM_001319947 NM_001363690 NM_001363691


NM_001025312 NM_133865

RefSeq (білок)


NP_001306875 NP_001306876 NP_073747 NP_001350619 NP_001350620


NP_001020483 NP_598626

Локус (UCSC)

Хр. 1: 113.91 – 113.91 Mb

Хр. 3: 103.71 – 103.72 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DCLRE1B (англ. DNA cross-link repair 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 532 амінокислот, а молекулярна маса — 60 002^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNGVLIPHTP	IAVDFWSLRR	AGTARLFFLS	HMHSDHTVGL	SSTWARPLYC
SPITAHLLHR	HLQVSKQWIQ	ALEVGESHVL	PLDEIGQETM	TVTLLDANHC
PGSVMFLFEG	YFGTILYTGD	FRYTPSMLKE	PALTLGKQIH	TLYLDNTNCN
PALVLPSRQE	AAHQIVQLIR	KHPQHNIKIG	LYSLGKESLL	EQLALEFQTW
VVLSPRRLEL	VQLLGLADVF	TVEEKAGRIH	AVDHMEICHS	NMLRWNQTHP
TIAILPTSRK	IHSSHPDIHV	IPYSDHSSYS	ELRAFVAALK	PCQVVPIVSR
RPCGGFQDSL	SPRISVPLIP	DSVQQYMSSS	SRKPSLLWLL	ERRLKRPRTQ
GVVFESPEES	ADQSQADRDS	KKAKKEKLSP	WPADLEKQPS	HHPLRIKKQL
FPDLYSKEWN	KAVPFCESQK	RVTMLTAPLG	FSVHLRSTDE	EFISQKTREE
IGLGSPLVPM	GDDDGGPEAT	GNQSAWMGHG	SPLSHSSKGT	PLLATEFRGL
ALKYLLTPVN	FFQAGYSSRR	FDQQVEKYHK	PC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Demuth I., Digweed M., Concannon P. (2004). Human SNM1B is required for normal cellular response to both DNA interstrand crosslink-inducing agents and ionizing radiation. Oncogene. 23: 8611—8618. PMID 15467758 DOI:10.1038/sj.onc.1207895
van Overbeek M., de Lange T. (2006). Apollo, an Artemis-related nuclease, interacts with TRF2 and protects human telomeres in S phase. Curr. Biol. 16: 1295—1302. PMID 16730176 DOI:10.1016/j.cub.2006.05.022
Freibaum B.D., Counter C.M. (2006). hSnm1B is a novel telomere-associated protein. J. Biol. Chem. 281: 15033—15036. PMID 16606622 DOI:10.1074/jbc.C600038200
Freibaum B.D., Counter C.M. (2008). The protein hSnm1B is stabilized when bound to the telomere-binding protein TRF2. J. Biol. Chem. 283: 23671—23676. PMID 18593705 DOI:10.1074/jbc.M800388200
Anders M., Mattow J., Digweed M., Demuth I. (2009). Evidence for hSNM1B/Apollo functioning in the HSP70 mediated DNA damage response. Cell Cycle. 8: 1725—1732. PMID 19411856 DOI:10.4161/cc.8.11.8605

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17641 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9H816 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.