DDX56 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

DDX56

Ідентифікатори

Символи

DDX56, DDX21, DDX26, NOH61, DEAD-box helicase 56

Зовнішні ІД

OMIM: 608023 MGI: 1277172 HomoloGene: 6498 GeneCards: DDX56

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• мембрана • клітинне ядро • ядерце • цитоплазма
Біологічний процес	• rRNA processing • RNA secondary structure unwinding • ribosome biogenesis • positive regulation of neuron projection development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54606


52513

Ensembl


ENSG00000136271


ENSMUSG00000004393

UniProt


Q9NY93


Q9D0R4

RefSeq (мРНК)


NM_019082 NM_001257189


NM_026538

RefSeq (білок)


NP_001244118 NP_061955


NP_080814

Локус (UCSC)

Хр. 7: 44.57 – 44.58 Mb

Хр. 11: 6.21 – 6.22 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DDX56 (англ. DEAD-box helicase 56) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 547 амінокислот, а молекулярна маса — 61 590^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDSEALGFE	HMGLDPRLLQ	AVTDLGWSRP	TLIQEKAIPL	ALEGKDLLAR
ARTGSGKTAA	YAIPMLQLLL	HRKATGPVVE	QAVRGLVLVP	TKELARQAQS
MIQQLATYCA	RDVRVANVSA	AEDSVSQRAV	LMEKPDVVVG	TPSRILSHLQ
QDSLKLRDSL	ELLVVDEADL	LFSFGFEEEL	KSLLCHLPRI	YQAFLMSATF
NEDVQALKEL	ILHNPVTLKL	QESQLPGPDQ	LQQFQVVCET	EEDKFLLLYA
LLKLSLIRGK	SLLFVNTLER	SYRLRLFLEQ	FSIPTCVLNG	ELPLRSRCHI
ISQFNQGFYD	CVIATDAEVL	GAPVKGKRRG	RGPKGDKASD	PEAGVARGID
FHHVSAVLNF	DLPPTPEAYI	HRAGRTARAN	NPGIVLTFVL	PTEQFHLGKI
EELLSGENRG	PILLPYQFRM	EEIEGFRYRC	RDAMRSVTKQ	AIREARLKEI
KEELLHSEKL	KTYFEDNPRD	LQLLRHDLPL	HPAVVKPHLG	HVPDYLVPPA
LRGLVRPHKK	RKKLSSSCRK	AKRAKSQNPL	RSFKHKGKKF	RPTAKPS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, біогенез рибосом, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Zirwes R.F., Eilbracht J., Kneissel S., Schmidt-Zachmann M.S. (2000). A novel helicase-type protein in the nucleolus: protein NOH61. Mol. Biol. Cell. 11: 1153—1167. PMID 10749921 DOI:10.1091/mbc.11.4.1153
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18193 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NY93 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.