DEDD

Ідентифікатори

Символи

DEDD, CASP8IP1, DEDD1, DEFT, FLDED1, KE05, death effector domain containing

Зовнішні ІД

OMIM: 606841 MGI: 1333874 HomoloGene: 7980 GeneCards: DEDD

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • ядерце
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0097285 апоптоз • Сперматогенез • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • decidualization • negative regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9191


21945

Ensembl


ENSG00000158796


ENSMUSG00000013973

UniProt


O75618


Q9Z1L3

RefSeq (мРНК)


NM_001039711 NM_001039712 NM_004216 NM_032998 NM_001330765

NM_001128609 NM_011615 NM_001357550 NM_001357551 NM_001357552
NM_001357553

RefSeq (білок)


NP_001034800 NP_001034801 NP_001317694 NP_127491

NP_001122081 NP_035745 NP_001344479 NP_001344480 NP_001344481
NP_001344482

Локус (UCSC)

Хр. 1: 161.12 – 161.13 Mb

Хр. 1: 171.16 – 171.17 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DEDD (англ. Death effector domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 318 амінокислот, а молекулярна маса — 36 794^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGLKRRASQ	VWPEEHGEQE	HGLYSLHRMF	DIVGTHLTHR	DVRVLSFLFV
DVIDDHERGL	IRNGRDFLLA	LERQGRCDES	NFRQVLQLLR	IITRHDLLPY
VTLKRRRAVC	PDLVDKYLEE	TSIRYVTPRA	LSDPEPRPPQ	PSKTVPPHYP
VVCCPTSGPQ	MCSKRPARGR	ATLGSQRKRR	KSVTPDPKEK	QTCDIRLRVR
AEYCQHETAL	QGNVFSNKQD	PLERQFERFN	QANTILKSRD	LGSIICDIKF
SELTYLDAFW	RDYINGSLLE	ALKGVFITDS	LKQAVGHEAI	KLLVNVDEED
YELGRQKLLR	NLMLQALP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Leo C.P., Hsu S.Y., McGee E.A., Salanova M., Hsueh A.J.W. (1998). DEFT, a novel death effector domain-containing molecule predominantly expressed in testicular germ cells. Endocrinology. 139: 4839—4848. PMID 9832420 DOI:10.1210/endo.139.12.6335
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhan Y., Hegde R., Srinivasula S.M., Fernandes-Alnemri T., Alnemri E.S. (2002). Death effector domain-containing proteins DEDD and FLAME-3 form nuclear complexes with the TFIIIC102 subunit of human transcription factor IIIC. Cell Death Differ. 9: 439—447. PMID 11965497 DOI:10.1038/sj.cdd.4401038
Alcivar A., Hu S., Tang J., Yang X. (2003). DEDD and DEDD2 associate with caspase-8/10 and signal cell death. Oncogene. 22: 291—297. PMID 12527898 DOI:10.1038/sj.onc.1206099

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2755 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O75618 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.