DEF6

Ідентифікатори

Символи

DEF6, IBP, SLAT, SWAP70L, guanine nucleotide exchange factor, DEF6 guanine nucleotide exchange factor, IMD87

Зовнішні ІД

OMIM: 610094 MGI: 1346328 HomoloGene: 11103 GeneCards: DEF6

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


50619


23853

Ensembl


ENSG00000023892


ENSMUSG00000002257

UniProt


Q9H4E7


Q8C2K1

RefSeq (мРНК)


NM_022047


NM_027185

RefSeq (білок)


NP_071330


NP_081461

Локус (UCSC)

Хр. 6: 35.3 – 35.32 Mb

Хр. 17: 28.43 – 28.45 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DEF6 (англ. DEF6, guanine nucleotide exchange factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 631 амінокислот, а молекулярна маса — 73 910^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALRKELLKS	IWYAFTALDV	EKSGKVSKSQ	LKVLSHNLYT	VLHIPHDPVA
LEEHFRDDDD	GPVSSQGYMP	YLNKYILDKV	EEGAFVKEHF	DELCWTLTAK
KNYRADSNGN	SMLSNQDAFR	LWCLFNFLSE	DKYPLIMVPD	EVEYLLKKVL
SSMSLEVSLG	ELEELLAQEA	QVAQTTGGLS	VWQFLELFNS	GRCLRGVGRD
TLSMAIHEVY	QELIQDVLKQ	GYLWKRGHLR	RNWAERWFQL	QPSCLCYFGS
EECKEKRGII	PLDAHCCVEV	LPDRDGKRCM	FCVKTANRTY	EMSASDTRQR
QEWTAAIQMA	IRLQAEGKTS	LHKDLKQKRR	EQREQRERRR	AAKEEELLRL
QQLQEEKERK	LQELELLQEA	QRQAERLLQE	EEERRRSQHR	ELQQALEGQL
REAEQARASM	QAEMELKEEE	AARQRQRIKE	LEEMQQRLQE	ALQLEVKARR
DEESVRIAQT	RLLEEEEEKL	KQLMQLKEEQ	ERYIERAQQE	KEELQQEMAQ
QSRSLQQAQQ	QLEEVRQNRQ	RADEDVEAAQ	RKLRQASTNV	KHWNVQMNRL
MHPIEPGDKR	PVTSSSFSGF	QPPLLAHRDS	SLKRLTRWGS	QGNRTPSPNS
NEQQKSLNGG	DEAPAPASTP	QEDKLDPAPE	N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

Mavrakis K.J., McKinlay K.J., Jones P., Sablitzky F. (2004). DEF6, a novel PH-DH-like domain protein, is an upstream activator of the Rho GTPases Rac1, Cdc42, and RhoA. Exp. Cell Res. 294: 335—344. PMID 15023524 DOI:10.1016/j.yexcr.2003.12.004
Oka T., Ihara S., Fukui Y. (2007). Cooperation of DEF6 with activated Rac in regulating cell morphology. J. Biol. Chem. 282: 2011—2018. PMID 17121847 DOI:10.1074/jbc.M605153200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2760 (англ.) . Архів оригіналу за 3 липня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H4E7 (англ.) . Архів оригіналу за 30 січня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.