DEFA3

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1DFN, 1ZMH, 1ZMI, 1ZMK, 2PM4, 2PM5

Ідентифікатори

Символи

DEFA3, DEF3, HNP-3, HNP3, HP-3, HP3, defensin alpha 3

Зовнішні ІД

OMIM: 604522 HomoloGene: 128756 GeneCards: DEFA3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • молекулярна функція
Клітинна компонента	• extracellular region • екзосома • azurophil granule lumen • Golgi lumen • міжклітинний простір
Біологічний процес	• defense response to fungus • intracellular estrogen receptor signaling pathway • defense response to bacterium • innate immune response in mucosa • defense response • defense response to virus • antimicrobial humoral response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • killing of cells of other organism • antibacterial humoral response • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • membrane disruption in other organism • cellular response to lipopolysaccharide
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1668


н/д

Ensembl


ENSG00000239839 ENSG00000284835


н/д

UniProt


P59666


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_005217


н/д

RefSeq (білок)


NP_005208


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 8: 7.02 – 7.02 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DEFA3 (англ. Defensin alpha 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 94 амінокислот, а молекулярна маса — 10 245^[3].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTLAILAAI		LLVALQAQAE		PLQARADEVA		AAPEQIAADI		PEVVVSLAWD
ESLAPKHPGS		RKNMDCYCRI		PACIAGERRY		GTCIYQGRLW		AFCC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Задіяний у такому біологічному процесі, як противірусний захист. Секретований назовні.

Література

Daher K.A., Lehrer R.I., Ganz T., Kronenberg M. (1988). Isolation and characterization of human defensin cDNA clones. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 7327—7331. PMID 3174637 DOI:10.1073/pnas.85.19.7327
Linzmeier R., Michaelson D., Liu L., Ganz T. (1993). The structure of neutrophil defensin genes. FEBS Lett. 321: 267—273. PMID 8477861 DOI:10.1016/0014-5793(93)80122-B
Linzmeier R., Michaelson D., Liu L., Ganz T. (1993). FEBS Lett. 326: 299—300. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 8325384 DOI:10.1016/0014-5793(93)81813-F
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Selsted M.E., Harwig S.S.L., Ganz T., Schilling J.W., Lehrer R.I. (1985). Primary structures of three human neutrophil defensins. J. Clin. Invest. 76: 1436—1439. PMID 4056036 DOI:10.1172/JCI112121
Ericksen B., Wu Z., Lu W., Lehrer R.I. (2005). Antibacterial activity and specificity of the six human alpha-defensins. Antimicrob. Agents Chemother. 49: 269—275. PMID 15616305 DOI:10.1128/AAC.49.1.269-275.2005

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2762 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P59666 (англ.) . Архів оригіналу за 29 березня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.