DEPDC1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2YSR

Ідентифікатори

Символи

DEPDC1, DEP.8, DEPDC1-V2, DEPDC1A, SDP35, DEP domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 612002 MGI: 1923381 HomoloGene: 9834 GeneCards: DEPDC1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
Клітинна компонента	• transcription repressor complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0007243 intracellular signal transduction • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55635


76131

Ensembl


ENSG00000024526


ENSMUSG00000028175

UniProt


Q5TB30


Q8CIG0

RefSeq (мРНК)


NM_017779 NM_001114120


NM_001172092 NM_001172093 NM_029523

RefSeq (білок)


NP_001107592 NP_060249


NP_001165563 NP_001165564 NP_083799

Локус (UCSC)

Хр. 1: 68.47 – 68.5 Mb

Хр. 3: 159.2 – 159.24 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DEPDC1 (англ. DEP domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 811 амінокислот, а молекулярна маса — 92 960^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESQGVPPGP	YRATKLWNEV	TTSFRAGMPL	RKHRQHFKKY	GNCFTAGEAV
DWLYDLLRNN	SNFGPEVTRQ	QTIQLLRKFL	KNHVIEDIKG	RWGSENVDDN
NQLFRFPATS	PLKTLPRRYP	ELRKNNIENF	SKDKDSIFKL	RNLSRRTPKR
HGLHLSQENG	EKIKHEIINE	DQENAIDNRE	LSQEDVEEVW	RYVILIYLQT
ILGVPSLEEV	INPKQVIPQY	IMYNMANTSK	RGVVILQNKS	DDLPHWVLSA
MKCLANWPRS	NDMNNPTYVG	FERDVFRTIA	DYFLDLPEPL	LTFEYYELFV
NILVVCGYIT	VSDRSSGIHK	IQDDPQSSKF	LHLNNLNSFK	STECLLLSLL
HREKNKEESD	STERLQISNP	GFQERCAKKM	QLVNLRNRRV	SANDIMGGSC
HNLIGLSNMH	DLSSNSKPRC	CSLEGIVDVP	GNSSKEASSV	FHQSFPNIEG
QNNKLFLESK	PKQEFLLNLH	SEENIQKPFS	AGFKRTSTLT	VQDQEELCNG
KCKSKQLCRS	QSLLLRSSTR	RNSYINTPVA	EIIMKPNVGQ	GSTSVQTAME
SELGESSATI	NKRLCKSTIE	LSENSLLPAS	SMLTGTQSLL	QPHLERVAID
ALQLCCLLLP	PPNRRKLQLL	MRMISRMSQN	VDMPKLHDAM	GTRSLMIHTF
SRCVLCCAEE	VDLDELLAGR	LVSFLMDHHQ	EILQVPSYLQ	TAVEKHLDYL
KKGHIENPGD	GLFAPLPTYS	YCKQISAQEF	DEQKVSTSQA	AIAELLENII
KNRSLPLKEK	RKKLKQFQKE	YPLIYQKRFP	TTESEAALFG	DKPTIKQPML
ILRKPKFRSL	R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22949 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q5TB30 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.