DEPTOR

Ідентифікатори

Символи

DEPTOR, DEP.6, DEPDC6, DEP domain containing MTOR-interacting protein, DEP domain containing MTOR interacting protein

Зовнішні ІД

OMIM: 612974 MGI: 2146322 HomoloGene: 32551 GeneCards: DEPTOR

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • цитоплазма
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • negative regulation of cell size • negative regulation of protein kinase activity • negative regulation of TOR signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64798


97998

Ensembl


ENSG00000155792


ENSMUSG00000022419

UniProt


Q8TB45


Q570Y9

RefSeq (мРНК)


NM_022783 NM_001283012


NM_001037937 NM_145470

RefSeq (білок)


NP_001269941 NP_073620


NP_001033026 NP_663445

Локус (UCSC)

Хр. 8: 119.87 – 120.05 Mb

Хр. 15: 54.98 – 55.12 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DEPTOR (англ. DEP domain containing MTOR interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 409 амінокислот, а молекулярна маса — 46 294^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEEGGSTGSA	GSDSSTSGSG	GAQQRELERM	AEVLVTGEQL	RLRLHEEKVI
KDRRHHLKTY	PNCFVAKELI	DWLIEHKEAS	DRETAIKLMQ	KLADRGIIHH
VCDEHKEFKD	VKLFYRFRKD	DGTFPLDNEV	KAFMRGQRLY	EKLMSPENTL
LQPREEEGVK	YERTFMASEF	LDWLVQEGEA	TTRKEAEQLC	HRLMEHGIIQ
HVSNKHPFVD	SNLLYQFRMN	FRRRRRLMEL	LNEKSPSSQE	THDSPFCLRK
QSHDNRKSTS	FMSVSPSKEI	KIVSAVRRSS	MSSCGSSGYF	SSSPTLSSSP
PVLCNPKSVL	KRPVTSEELL	TPGAPYARKT	FTIVGDAVGW	GFVVRGSKPC
HIQAVDPSGP	AAAAGMKVCQ	FVVSVNGLNV	LHVDYRTVSN	LILTGPRTIV
MEVMEELEC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22953 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8TB45 (англ.) . Архів оригіналу за 17 лютого 2017. Процитовано 7 вересня 2017.