DMTN |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/05/Protein_EPB49_PDB_1qzp.png/250px-Protein_EPB49_PDB_1qzp.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1QZP, 1ZV6 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DMTN, DMT, EPB49, dematin actin binding protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 125305 MGI: 99670 HomoloGene: 1496 GeneCards: DMTN |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • spectrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • signaling receptor binding • protein self-association • actin filament binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • cell projection • мембрана • cortical cytoskeleton • клітинна мембрана • platelet dense tubular network membrane • cell projection membrane • мікрофіламент • actin cytoskeleton • spectrin-associated cytoskeleton • perinuclear region of cytoplasm • система ендомембран • цитоскелет • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • GO:0016023 cytoplasmic vesicle |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of cell-substrate adhesion • regulation of lamellipodium assembly • cellular response to calcium ion • regulation of filopodium assembly • actin filament reorganization • regulation of actin cytoskeleton organization • negative regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • positive regulation of wound healing • actin filament bundle assembly • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • negative regulation of protein targeting to membrane • negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • positive regulation of blood coagulation • calcium-mediated signaling using extracellular calcium source • cytoskeleton organization • actin filament capping • трансмембранний транспорт • negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation • positive regulation of integrin-mediated signaling pathway • protein secretion by platelet • negative regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source • positive regulation of fibroblast migration • negative regulation of focal adhesion assembly • actin cytoskeleton organization • positive regulation of platelet aggregation • cellular response to cAMP • erythrocyte development • regulation of cell shape • GO:0034622 protein-containing complex assembly • lamellipodium assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/7f/PBB_GE_EPB49_204505_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_EPB49_204505_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001114135 NM_001114136 NM_001114137 NM_001114138 NM_001114139
| NM_001302816 NM_001302817 NM_001978 NM_001323378 NM_001323380 NM_001323381 NM_001323382 NM_001323383 NM_001323384 NM_001323385 NM_001323387 NM_001323388 NM_001323389 NM_001323390 NM_001323391 NM_001323392 NM_001323393 NM_001323394 NM_001323395 NM_001323396 NM_001323397 NM_001323398 NM_001323399 NM_001323400 NM_001323401 NM_001323379 NM_001387723 NM_001387726 NM_001387727 NM_001387728 NM_001387730 NM_001387732 NM_001387734 NM_001387735 NM_001387736 NM_001387737 NM_001387742 NM_001387743 NM_001387744 NM_001387745 NM_001387750 NM_001387751 NM_001387752 NM_001387753 NM_001387754 NM_001387755 NM_001387756 NM_001387757 |
| NM_001252662 NM_001252663 NM_001252664 NM_001252665 NM_001252666
| NM_013514 NM_001360024 NM_001360025 NM_001360026 NM_001360027 NM_001360028 NM_001360029 NM_001360030 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001107607 NP_001107608 NP_001107609 NP_001107610 NP_001107611
| NP_001289745 NP_001289746 NP_001310307 NP_001310308 NP_001310309 NP_001310310 NP_001310311 NP_001310312 NP_001310313 NP_001310314 NP_001310316 NP_001310317 NP_001310318 NP_001310319 NP_001310320 NP_001310321 NP_001310322 NP_001310323 NP_001310324 NP_001310325 NP_001310326 NP_001310327 NP_001310328 NP_001310329 NP_001310330 NP_001969 |
| NP_001239591 NP_001239592 NP_001239593 NP_001239594 NP_001239595
| NP_038542 NP_001346953 NP_001346954 NP_001346955 NP_001346956 NP_001346957 NP_001346958 NP_001346959 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 22.05 – 22.08 Mb | Хр. 14: 70.6 – 70.64 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DMTN (англ. Dematin actin binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 405 амінокислот, а молекулярна маса — 45 514[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MERLQKQPLT | | SPGSVSPSRD | | SSVPGSPSSI | | VAKMDNQVLG | | YKDLAAIPKD |
KAILDIERPD | | LMIYEPHFTY | | SLLEHVELPR | | SRERSLSPKS | | TSPPPSPEVW |
ADSRSPGIIS | | QASAPRTTGT | | PRTSLPHFHH | | PETSRPDSNI | | YKKPPIYKQR |
ESVGGSPQTK | | HLIEDLIIES | | SKFPAAQPPD | | PNQPAKIETD | | YWPCPPSLAV |
VETEWRKRKA | | SRRGAEEEEE | | EEDDDSGEEM | | KALRERQREE | | LSKVTSNLGK |
MILKEEMEKS | | LPIRRKTRSL | | PDRTPFHTSL | | HQGTSKSSSL | | PAYGRTTLSR |
LQSTEFSPSG | | SETGSPGLQN | | GEGQRGRMDR | | GNSLPCVLEQ | | KIYPYEMLVV |
TNKGRTKLPP | | GVDRMRLERH | | LSAEDFSRVF | | AMSPEEFGKL | | ALWKRNELKK |
KASLF |
Кодований геном білок за функціями належить до кепінгів актину, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Rana A.P., Ruff P., Maalouf G.J., Speicher D.W., Chishti A.H. (1993). Cloning of human erythroid dematin reveals another member of the villin family. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 6651—6655. PMID 8341682 DOI:10.1073/pnas.90.14.6651
- Azim A.C., Knoll J.H.M., Beggs A.H., Chishti A.H. (1995). Isoform cloning, actin binding, and chromosomal localization of human erythroid dematin, a member of the villin superfamily. J. Biol. Chem. 270: 17407—17413. PMID 7615546 DOI:10.1074/jbc.270.29.17407
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
- Chen L., Jiang Z.G., Khan A.A., Chishti A.H., McKnight C.J. (2009). Dematin exhibits a natively unfolded core domain and an independently folded headpiece domain. Protein Sci. 18: 629—636. PMID 19241372 DOI:10.1002/pro.59
- Koshino I., Mohandas N., Takakuwa Y. (2012). Identification of a novel role for dematin in regulating red cell membrane function by modulating spectrin-actin interaction. J. Biol. Chem. 287: 35244—35250. PMID 22927433 DOI:10.1074/jbc.M111.305441
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3382 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q08495 (англ.) . Архів оригіналу за 1 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |