DMTN

DMTN
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1QZP, 1ZV6

Ідентифікатори
Символи DMTN, DMT, EPB49, dematin actin binding protein
Зовнішні ІД OMIM: 125305 MGI: 99670 HomoloGene: 1496 GeneCards: DMTN
Онтологія гена
Молекулярна функція

• spectrin binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• actin binding
• signaling receptor binding
• protein self-association
• actin filament binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• cell projection
• мембрана
• cortical cytoskeleton
• клітинна мембрана
• platelet dense tubular network membrane
• cell projection membrane
• мікрофіламент
• actin cytoskeleton
• spectrin-associated cytoskeleton
• perinuclear region of cytoplasm
• система ендомембран
• цитоскелет
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle

Біологічний процес

• negative regulation of cell-substrate adhesion
• regulation of lamellipodium assembly
• cellular response to calcium ion
• regulation of filopodium assembly
• actin filament reorganization
• regulation of actin cytoskeleton organization
• negative regulation of peptidyl-threonine phosphorylation
• positive regulation of wound healing
• actin filament bundle assembly
• positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading
• negative regulation of protein targeting to membrane
• negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
• positive regulation of blood coagulation
• calcium-mediated signaling using extracellular calcium source
• cytoskeleton organization
• actin filament capping
• трансмембранний транспорт
• negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation
• positive regulation of integrin-mediated signaling pathway
• protein secretion by platelet
• negative regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading
• calcium-mediated signaling using intracellular calcium source
• positive regulation of fibroblast migration
• negative regulation of focal adhesion assembly
• actin cytoskeleton organization
• positive regulation of platelet aggregation
• cellular response to cAMP
• erythrocyte development
• regulation of cell shape
• GO:0034622 protein-containing complex assembly
• lamellipodium assembly

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2039
13829
Ensembl
ENSG00000158856
ENSMUSG00000022099
UniProt
Q08495
Q9WV69
RefSeq (мРНК)
NM_001114135
NM_001114136
NM_001114137
NM_001114138
NM_001114139
NM_001302816
NM_001302817
NM_001978
NM_001323378
NM_001323380
NM_001323381
NM_001323382
NM_001323383
NM_001323384
NM_001323385
NM_001323387
NM_001323388
NM_001323389
NM_001323390
NM_001323391
NM_001323392
NM_001323393
NM_001323394
NM_001323395
NM_001323396
NM_001323397
NM_001323398
NM_001323399
NM_001323400
NM_001323401
NM_001323379
NM_001387723
NM_001387726
NM_001387727
NM_001387728
NM_001387730
NM_001387732
NM_001387734
NM_001387735
NM_001387736
NM_001387737
NM_001387742
NM_001387743
NM_001387744
NM_001387745
NM_001387750
NM_001387751
NM_001387752
NM_001387753
NM_001387754
NM_001387755
NM_001387756
NM_001387757
NM_001252662
NM_001252663
NM_001252664
NM_001252665
NM_001252666
NM_013514
NM_001360024
NM_001360025
NM_001360026
NM_001360027
NM_001360028
NM_001360029
NM_001360030
RefSeq (білок)
NP_001107607
NP_001107608
NP_001107609
NP_001107610
NP_001107611
NP_001289745
NP_001289746
NP_001310307
NP_001310308
NP_001310309
NP_001310310
NP_001310311
NP_001310312
NP_001310313
NP_001310314
NP_001310316
NP_001310317
NP_001310318
NP_001310319
NP_001310320
NP_001310321
NP_001310322
NP_001310323
NP_001310324
NP_001310325
NP_001310326
NP_001310327
NP_001310328
NP_001310329
NP_001310330
NP_001969
NP_001239591
NP_001239592
NP_001239593
NP_001239594
NP_001239595
NP_038542
NP_001346953
NP_001346954
NP_001346955
NP_001346956
NP_001346957
NP_001346958
NP_001346959
Локус (UCSC) Хр. 8: 22.05 – 22.08 Mb Хр. 14: 70.6 – 70.64 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DMTN (англ. Dematin actin binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 405 амінокислот, а молекулярна маса — 45 514[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MERLQKQPLTSPGSVSPSRDSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKD
KAILDIERPDLMIYEPHFTYSLLEHVELPRSRERSLSPKSTSPPPSPEVW
ADSRSPGIISQASAPRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQR
ESVGGSPQTKHLIEDLIIESSKFPAAQPPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAV
VETEWRKRKASRRGAEEEEEEEDDDSGEEMKALRERQREELSKVTSNLGK
MILKEEMEKSLPIRRKTRSLPDRTPFHTSLHQGTSKSSSLPAYGRTTLSR
LQSTEFSPSGSETGSPGLQNGEGQRGRMDRGNSLPCVLEQKIYPYEMLVV
TNKGRTKLPPGVDRMRLERHLSAEDFSRVFAMSPEEFGKLALWKRNELKK
KASLF

Кодований геном білок за функціями належить до кепінгів актину, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література

  • Rana A.P., Ruff P., Maalouf G.J., Speicher D.W., Chishti A.H. (1993). Cloning of human erythroid dematin reveals another member of the villin family. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 6651—6655. PMID 8341682 DOI:10.1073/pnas.90.14.6651
  • Azim A.C., Knoll J.H.M., Beggs A.H., Chishti A.H. (1995). Isoform cloning, actin binding, and chromosomal localization of human erythroid dematin, a member of the villin superfamily. J. Biol. Chem. 270: 17407—17413. PMID 7615546 DOI:10.1074/jbc.270.29.17407
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
  • Chen L., Jiang Z.G., Khan A.A., Chishti A.H., McKnight C.J. (2009). Dematin exhibits a natively unfolded core domain and an independently folded headpiece domain. Protein Sci. 18: 629—636. PMID 19241372 DOI:10.1002/pro.59
  • Koshino I., Mohandas N., Takakuwa Y. (2012). Identification of a novel role for dematin in regulating red cell membrane function by modulating spectrin-actin interaction. J. Biol. Chem. 287: 35244—35250. PMID 22927433 DOI:10.1074/jbc.M111.305441

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3382 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q08495 (англ.) . Архів оригіналу за 1 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.