DNASE1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4AWN

Ідентифікатори

Символи

DNASE1, DNL1, DRNI, deoxyribonuclease I, deoxyribonuclease 1

Зовнішні ІД

OMIM: 125505 MGI: 103157 HomoloGene: 3826 GeneCards: DNASE1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nuclease activity • endonuclease activity • deoxyribonuclease I activity • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • deoxyribonuclease activity • DNA binding
Клітинна компонента	• extracellular region • екзосома • nuclear envelope • клітинне ядро
Біологічний процес	• DNA catabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • GO:0097285 апоптоз • DNA catabolic process, endonucleolytic • neutrophil activation involved in immune response • regulation of acute inflammatory response • regulation of neutrophil mediated cytotoxicity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1773


13419

Ensembl


ENSG00000213918


ENSMUSG00000005980

UniProt


P24855


P49183

RefSeq (мРНК)

NM_005223 NM_001351825 NM_001387135 NM_001387139 NM_001387140
NM_001387141


NM_010061 NM_001357143

RefSeq (білок)


NP_005214 NP_001338754


NP_034191 NP_001344072

Локус (UCSC)

Хр. 16: 3.61 – 3.68 Mb

Хр. 16: 3.85 – 3.86 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DNASE1 (англ. Deoxyribonuclease 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 282 амінокислот, а молекулярна маса — 31 434^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRGMKLLGAL	LALAALLQGA	VSLKIAAFNI	QTFGETKMSN	ATLVSYIVQI
LSRYDIALVQ	EVRDSHLTAV	GKLLDNLNQD	APDTYHYVVS	EPLGRNSYKE
RYLFVYRPDQ	VSAVDSYYYD	DGCEPCGNDT	FNREPAIVRF	FSRFTEVREF
AIVPLHAAPG	DAVAEIDALY	DVYLDVQEKW	GLEDVMLMGD	FNAGCSYVRP
SQWSSIRLWT	SPTFQWLIPD	SADTTATPTH	CAYDRIVVAG	MLLRGAVVPD
SALPFNFQAA	YGLSDQLAQA	ISDHYPVEVM	LK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іоном кальцію. Локалізований у ядрі. Також секретований назовні.

Література

Shak S., Capon D.J., Hellmiss R., Marsters S.A., Baker C.L. (1990). Recombinant human DNase I reduces the viscosity of cystic fibrosis sputum. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 9188—9192. PMID 2251263 DOI:10.1073/pnas.87.23.9188
Yasuda T., Kishi K., Yanagawa Y., Yoshida A. (1995). Structure of the human deoxyribonuclease I (DNase I) gene: identification of the nucleotide substitution that generates its classical genetic polymorphism. Ann. Hum. Genet. 59: 1—15. PMID 7762978 DOI:10.1111/j.1469-1809.1995.tb01601.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yasuda T., Nadano D., Takeshita H., Tenjo E., Kishi K. (1995). Molecular analysis of the third allele of human deoxyribonuclease I polymorphism. Ann. Hum. Genet. 59: 139—147. PMID 7625762 DOI:10.1111/j.1469-1809.1995.tb00737.x
Yasuda T., Takeshita H., Iida R., Kogure S., Kishi K. (1999). A new allele, DNASE1*6, of human deoxyribonuclease I polymorphism encodes an Arg to Cys substitution responsible for its instability. Biochem. Biophys. Res. Commun. 260: 280—283. PMID 10381379 DOI:10.1006/bbrc.1999.0900

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2956 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P24855 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.