DNMT3B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3QKJ, 3FLG, 5CIU

Ідентифікатори

Символи

DNMT3B, ICF, ICF1, M.HsaIIIB, DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta, DNA methyltransferase 3 beta, FSHD4

Зовнішні ІД

OMIM: 602900 MGI: 1261819 HomoloGene: 56000 GeneCards: DNMT3B

Пов'язані генетичні захворювання

запальні захворювання кишківника, immunodeficiency-centromeric instability-facial anomalies syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • DNA-methyltransferase activity • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• response to ionizing radiation • C-5 methylation of cytosine • response to estradiol • response to hypoxia • cellular response to hyperoxia • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • response to activity • cellular response to dexamethasone stimulus • response to vitamin A • Метилювання ДНК • Метилювання • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression, epigenetic • positive regulation of histone H3-K4 methylation • positive regulation of neuron differentiation • negative regulation of histone H3-K9 methylation • регуляція експресії генів • response to caffeine • response to toxic substance • response to cocaine
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1789


13436

Ensembl


ENSG00000088305


ENSMUSG00000027478

UniProt


Q9UBC3


O88509

RefSeq (мРНК)

NM_001207055 NM_001207056 NM_006892 NM_175848 NM_175849
NM_175850

NM_001003960 NM_001003961 NM_001003963 NM_001122997 NM_001271744
NM_001271745 NM_001271746 NM_001271747 NM_010068

RefSeq (білок)

NP_001193984 NP_001193985 NP_008823 NP_787044 NP_787045
NP_787046

NP_001003960 NP_001003961 NP_001003963 NP_001116469 NP_001258673
NP_001258674 NP_001258675 NP_001258676 NP_034198

Локус (UCSC)

Хр. 20: 32.76 – 32.81 Mb

Хр. 2: 153.49 – 153.53 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DNMT3B (англ. DNA methyltransferase 3 beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 853 амінокислот, а молекулярна маса — 95 751^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKGDTRHLNG	EEDAGGREDS	ILVNGACSDQ	SSDSPPILEA	IRTPEIRGRR
SSSRLSKREV	SSLLSYTQDL	TGDGDGEDGD	GSDTPVMPKL	FRETRTRSES
PAVRTRNNNS	VSSRERHRPS	PRSTRGRQGR	NHVDESPVEF	PATRSLRRRA
TASAGTPWPS	PPSSYLTIDL	TDDTEDTHGT	PQSSSTPYAR	LAQDSQQGGM
ESPQVEADSG	DGDSSEYQDG	KEFGIGDLVW	GKIKGFSWWP	AMVVSWKATS
KRQAMSGMRW	VQWFGDGKFS	EVSADKLVAL	GLFSQHFNLA	TFNKLVSYRK
AMYHALEKAR	VRAGKTFPSS	PGDSLEDQLK	PMLEWAHGGF	KPTGIEGLKP
NNTQPVVNKS	KVRRAGSRKL	ESRKYENKTR	RRTADDSATS	DYCPAPKRLK
TNCYNNGKDR	GDEDQSREQM	ASDVANNKSS	LEDGCLSCGR	KNPVSFHPLF
EGGLCQTCRD	RFLELFYMYD	DDGYQSYCTV	CCEGRELLLC	SNTSCCRCFC
VECLEVLVGT	GTAAEAKLQE	PWSCYMCLPQ	RCHGVLRRRK	DWNVRLQAFF
TSDTGLEYEA	PKLYPAIPAA	RRRPIRVLSL	FDGIATGYLV	LKELGIKVGK
YVASEVCEES	IAVGTVKHEG	NIKYVNDVRN	ITKKNIEEWG	PFDLVIGGSP
CNDLSNVNPA	RKGLYEGTGR	LFFEFYHLLN	YSRPKEGDDR	PFFWMFENVV
AMKVGDKRDI	SRFLECNPVM	IDAIKVSAAH	RARYFWGNLP	GMNRPVIASK
NDKLELQDCL	EYNRIAKLKK	VQTITTKSNS	IKQGKNQLFP	VVMNGKEDVL
WCTELERIFG	FPVHYTDVSN	MGRGARQKLL	GRSWSVPVIR	HLFAPLKDYF
ACE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, активаторів, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

Kang E.S., Park C.W., Chung J.H. (2001). Dnmt3b, de novo DNA methyltransferase, interacts with SUMO-1 and Ubc9 through its N-terminal region and is subject to modification by SUMO-1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 289: 862—868. PMID 11735126 DOI:10.1006/bbrc.2001.6057
Kim G.-D., Ni J., Kelesoglu N., Roberts R.J., Pradhan S. (2002). Co-operation and communication between the human maintenance and de novo DNA (cytosine-5) methyltransferases. EMBO J. 21: 4183—4195. PMID 12145218 DOI:10.1093/emboj/cdf401
Okano M., Bell D.W., Haber D.A., Li E. (1999). DNA methyltransferases Dnmt3a and Dnmt3b are essential for de novo methylation and mammalian development. Cell. 99: 247—257. PMID 10555141 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81656-6

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DNMT3B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2979 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UBC3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.