DPP6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1XFD

Ідентифікатори

Символи

DPP6, DPPX, VF2, MRD33, DPL1, dipeptidyl peptidase like 6

Зовнішні ІД

OMIM: 126141 MGI: 94921 HomoloGene: 22560 GeneCards: DPP6

Пов'язані генетичні захворювання

колоректальний рак, посттравматичний стресовий розлад, рак підшлункової залози, бічний аміотрофічний склероз, autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 33^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• potassium channel regulator activity • serine-type peptidase activity • dipeptidyl-peptidase activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • voltage-gated potassium channel complex
Біологічний процес	• protein localization to plasma membrane • regulation of potassium ion transmembrane transport • протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1804


13483

Ensembl


ENSG00000130226 ENSG00000282974


ENSMUSG00000061576

UniProt


P42658 Q8IYG9


Q9Z218

RefSeq (мРНК)


NM_001039350 NM_001290252 NM_001290253 NM_001936 NM_130797


NM_001136060 NM_001198886 NM_010075 NM_207282

RefSeq (білок)

NP_001034439 NP_001277181 NP_001277182 NP_001927 NP_570629
NP_001351426 NP_001351427 NP_001351428 NP_001351429 NP_001351430 NP_001351431 NP_001277182.1 NP_570629.2 NP_001034439.1 NP_001277181.1 NP_001927.3 NP_570629.2


NP_001129532 NP_001185815 NP_034205 NP_997165

Локус (UCSC)

Хр. 7: 153.89 – 154.89 Mb

Хр. 5: 27.02 – 27.93 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DPP6 (англ. Dipeptidyl peptidase like 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 865 амінокислот, а молекулярна маса — 97 588^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASLYQRFTG	KINTSRSFPA	PPEASHLLGG	QGPEEDGGAG	AKPLGPRAQA
AAPRERGGGG	GGAGGRPRFQ	YQARSDGDEE	DELVGSNPPQ	RNWKGIAIAL
LVILVICSLI	VTSVILLTPA	EDNSLSQKKK	VTVEDLFSED	FKIHDPEAKW
ISDTEFIYRE	QKGTVRLWNV	ETNTSTVLIE	GKKIESLRAI	RYEISPDREY
ALFSYNVEPI	YQHSYTGYYV	LSKIPHGDPQ	SLDPPEVSNA	KLQYAGWGPK
GQQLIFIFEN	NIYYCAHVGK	QAIRVVSTGK	EGVIYNGLSD	WLYEEEILKT
HIAHWWSPDG	TRLAYAAIND	SRVPIMELPT	YTGSIYPTVK	PYHYPKAGSE
NPSISLHVIG	LNGPTHDLEM	MPPDDPRMRE	YYITMVKWAT	STKVAVTWLN
RAQNVSILTL	CDATTGVCTK	KHEDESEAWL	HRQNEEPVFS	KDGRKFFFIR
AIPQGGRGKF	YHITVSSSQP	NSSNDNIQSI	TSGDWDVTKI	LAYDEKGNKI
YFLSTEDLPR	RRQLYSANTV	GNFNRQCLSC	DLVENCTYFS	ASFSHSMDFF
LLKCEGPGVP	MVTVHNTTDK	KKMFDLETNE	HVKKAINDRQ	MPKVEYRDIE
IDDYNLPMQI	LKPATFTDTT	HYPLLLVVDG	TPGSQSVAEK	FEVSWETVMV
SSHGAVVVKC	DGRGSGFQGT	KLLHEVRRRL	GLLEEKDQME	AVRTMLKEQY
IDRTRVAVFG	KDYGGYLSTY	ILPAKGENQG	QTFTCGSALS	PITDFKLYAS
AFSERYLGLH	GLDNRAYEMT	KVAHRVSALE	EQQFLIIHPT	ADEKIHFQHT
AELITQLIRG	KANYSLQIYP	DESHYFTSSS	LKQHLYRSII	NFFVECFRIQ
DKLLTVTAKE	DEEED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Yokotani N., Doi K., Wenthold R.J., Wada K. (1993). Non-conservation of a catalytic residue in a dipeptidyl aminopeptidase IV-related protein encoded by a gene on human chromosome 7. Hum. Mol. Genet. 2: 1037—1039. PMID 8103397 DOI:10.1093/hmg/2.7.1037
Jerng H.H., Qian Y., Pfaffinger P.J. (2004). Modulation of Kv4.2 channel expression and gating by dipeptidyl peptidase 10 (DPP10). Biophys. J. 87: 2380—2396. PMID 15454437 DOI:10.1529/biophysj.104.042358
Soh H., Goldstein S.A. (2008). I SA channel complexes include four subunits each of DPP6 and Kv4.2. J. Biol. Chem. 283: 15072—15077. PMID 18364354 DOI:10.1074/jbc.M706964200
Garber K. (2008). Genetics. The elusive ALS genes. Science. 319: 20—20. PMID 18174402 DOI:10.1126/science.319.5859.20
Seikel E., Trimmer J.S. (2009). Convergent modulation of Kv4.2 channel alpha subunits by structurally distinct DPPX and KChIP auxiliary subunits. Biochemistry. 48: 5721—5730. PMID 19441798 DOI:10.1021/bi802316m
Strop P., Bankovich A.J., Hansen K.C., Garcia K.C., Brunger A.T. (2004). Structure of a human A-type potassium channel interacting protein DPPX, a member of the dipeptidyl aminopeptidase family. J. Mol. Biol. 343: 1055—1065. PMID 15476821 DOI:10.1016/j.jmb.2004.09.003

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DPP6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3010 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P42658 (англ.) . Архів оригіналу за 26 грудня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.