DXO |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3FQI, 3FQJ, 4J7L, 4J7M, 4J7N | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DXO, DOM3L, DOM3Z, NG6, RAI1, decapping exoribonuclease |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605996 MGI: 1890444 HomoloGene: 38061 GeneCards: DXO |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • nuclease activity • 5'-3' exonuclease activity • exonuclease activity • mRNA binding • RNA pyrophosphohydrolase activity • hydrolase activity • magnesium ion binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинна мембрана • клітинне ядро • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0071049, GO:0071048, GO:0071033 nuclear mRNA surveillance • mRNA catabolic process • RNA destabilization • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/74/PBB_GE_DOM3Z_204522_at_fs.png/250px-PBB_GE_DOM3Z_204522_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ed/PBB_GE_DOM3Z_38157_at_fs.png/250px-PBB_GE_DOM3Z_38157_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/91/PBB_GE_DOM3Z_215982_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_DOM3Z_215982_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | ENSG00000204348 ENSG00000236765 ENSG00000224313 ENSG00000206346 ENSG00000225682
| ENSG00000234798 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_005510 NM_001371205 NM_001371206 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_005501 NP_001358134 NP_001358135 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 31.97 – 31.97 Mb | Хр. 17: 35.06 – 35.06 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DXO (англ. Decapping exoribonuclease) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 396 амінокислот, а молекулярна маса — 44 929[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDPRGTKRGA | | EKTEVAEPRN | | KLPRPAPSLP | | TDPALYSGPF | | PFYRRPSELG |
CFSLDAQRQY | | HGDARALRYY | | SPPPTNGPGP | | NFDLRDGYPD | | RYQPRDEEVQ |
ERLDHLLCWL | | LEHRGRLEGG | | PGWLAEAIVT | | WRGHLTKLLT | | TPYERQEGWQ |
LAASRFQGTL | | YLSEVETPNA | | RAQRLARPPL | | LRELMYMGYK | | FEQYMCADKP |
GSSPDPSGEV | | NTNVAFCSVL | | RSRLGSHPLL | | FSGEVDCTDP | | QAPSTQPPTC |
YVELKTSKEM | | HSPGQWRSFY | | RHKLLKWWAQ | | SFLPGVPNVV | | AGFRNPDGFV |
SSLKTFPTMK | | MFEYVRNDRD | | GWNPSVCMNF | | CAAFLSFAQS | | TVVQDDPRLV |
HLFSWEPGGP | | VTVSVHQDAP | | YAFLPIWYVE | | AMTQDLPSPP | | KTPSPK |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Yang Z., Shen L., Dangel A.W., Wu L.-C., Yu C.Y. (1998). Four ubiquitously expressed genes, RD (D6S45)-SKI2W (SKIV2L)-DOM3Z-RP1 (D6S60E), are present between complement component genes factor B and C4 in the class III region of the HLA. Genomics. 53: 338—347. PMID 9799600 DOI:10.1006/geno.1998.5499
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zheng D., Chen C.Y., Shyu A.B. (2011). Unraveling regulation and new components of human P-bodies through a protein interaction framework and experimental validation. RNA. 17: 1619—1634. PMID 21750099 DOI:10.1261/rna.2789611
- Yang Z., Yu C.Y. (2000). Organizations and gene duplications of the human and mouse MHC complement gene clusters. Exp. Clin. Immunogenet. 17: 1—17. PMID 10686478
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2992 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O77932 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |