EAF1

Ідентифікатори

Символи

EAF1, ELL associated factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608315 MGI: 1921677 HomoloGene: 12561 GeneCards: EAF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• Тільце Кахаля • nuclear speck • transcription elongation factor complex • super elongation complex • внутрішньоклітинна мембранна органела • intercellular bridge • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription elongation from RNA polymerase II promoter
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


85403


74427

Ensembl


ENSG00000144597


ENSMUSG00000021890

UniProt


Q96JC9


Q9D4C5

RefSeq (мРНК)


NM_033083


NM_028932

RefSeq (білок)


NP_149074


NP_083208

Локус (UCSC)

Хр. 3: 15.43 – 15.45 Mb

Хр. 14: 31.22 – 31.23 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

EAF1 (англ. ELL associated factor 1) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 268 амінокислот, а молекулярна маса — 29 042^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNGTANPLLD	REEHCLRLGE	SFEKRPRASF	HTIRYDFKPA	SIDTSCEGEL
QVGKGDEVTI	TLPHIPGSTP	PMTVFKGNKR	PYQKDCVLII	NHDTGEYVLE
KLSSSIQVKK	TRAEGSSKIQ	ARMEQQPTRP	PQTSQPPPPP	PPMPFRAPTK
PPVGPKTSPL	KDNPSPEPQL	DDIKRELRAE	VDIIEQMSSS	SGSSSSDSES
SSGSDDDSSS	SGGEDNGPAS	PPQPSHQQPY	NSRPAVANGT	SRPQGSNQLM
NTLRNDLQLS	ESGSDSDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Polak P.E., Simone F., Kaberlein J.J., Luo R.T., Thirman M.J. (2003). ELL and EAF1 are Cajal body components that are disrupted in MLL-ELL leukemia. Mol. Biol. Cell. 14: 1517—1528. PMID 12686606 DOI:10.1091/mbc.E02-07-0394
Kong S.E., Banks C.A., Shilatifard A., Conaway J.W., Conaway R.C. (2005). ELL-associated factors 1 and 2 are positive regulators of RNA polymerase II elongation factor ELL. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 10094—10098. PMID 16006523 DOI:10.1073/pnas.0503017102
Luo Z., Lin C., Shilatifard A. (2012). The super elongation complex (SEC) family in transcriptional control. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 13: 543—547. PMID 22895430 DOI:10.1038/nrm3417

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20907 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96JC9 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.