EDIL3 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

EDIL3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4D90

Ідентифікатори

Символи

EDIL3, DEL1, EGF like repeats and discoidin domains 3

Зовнішні ІД

OMIM: 606018 MGI: 1329025 HomoloGene: 21166 GeneCards: EDIL3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • integrin binding • зв'язування з іоном металу • extracellular matrix structural constituent
Клітинна компонента	• extracellular vesicle • extracellular region • екзосома • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• multicellular organism development • адгезія клітин • positive regulation of cell-substrate adhesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10085


13612

Ensembl


ENSG00000164176


ENSMUSG00000034488

UniProt


O43854


O35474

RefSeq (мРНК)


NM_001278642 NM_005711


NM_001037987 NM_010103

RefSeq (білок)


NP_001265571 NP_005702


NP_001033076 NP_034233

Локус (UCSC)

Хр. 5: 83.94 – 84.38 Mb

Хр. 13: 88.97 – 89.47 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

EDIL3 (англ. EGF like repeats and discoidin domains 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480 амінокислот, а молекулярна маса — 53 765^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKRSVAVWLL	VGLSLGVPQF	GKGDICDPNP	CENGGICLPG	LADGSFSCEC
PDGFTDPNCS	SVVEVASDEE	EPTSAGPCTP	NPCHNGGTCE	ISEAYRGDTF
IGYVCKCPRG	FNGIHCQHNI	NECEVEPCKN	GGICTDLVAN	YSCECPGEFM
GRNCQYKCSG	PLGIEGGIIS	NQQITASSTH	RALFGLQKWY	PYYARLNKKG
LINAWTAAEN	DRWPWIQINL	QRKMRVTGVI	TQGAKRIGSP	EYIKSYKIAY
SNDGKTWAMY	KVKGTNEDMV	FRGNIDNNTP	YANSFTPPIK	AQYVRLYPQV
CRRHCTLRME	LLGCELSGCS	EPLGMKSGHI	QDYQITASSI	FRTLNMDMFT
WEPRKARLDK	QGKVNAWTSG	HNDQSQWLQV	DLLVPTKVTG	IITQGAKDFG
HVQFVGSYKL	AYSNDGEHWT	VYQDEKQRKD	KVFQGNFDND	THRKNVIDPP
IYARHIRILP	WSWYGRITLR	SELLGCTEEE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3173 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, O43854 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.