EHD1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2JQ6, 2KFF, 2KFG, 2KFH, 2KSP

Ідентифікатори

Символи

EHD1, H-PAST, HPAST1, PAST, PAST1, EH domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 605888 MGI: 1341878 HomoloGene: 81678 GeneCards: EHD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • calcium ion binding • GTP binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • cadherin binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• ендосома • cell projection • early endosome membrane • мембрана • lipid droplet • клітинна мембрана • війка • recycling endosome membrane • platelet dense tubular network membrane • ciliary membrane • ciliary pocket membrane • endosome membrane • екзосома
Біологічний процес	• cellular response to nerve growth factor stimulus • ендоцитоз • low-density lipoprotein particle clearance • positive regulation of cholesterol storage • зсідання крові • positive regulation of myoblast fusion • cell projection organization • protein localization to cilium • positive regulation of endocytic recycling • cholesterol homeostasis • intracellular protein transport • protein homooligomerization • neuron projection development • protein transport • endocytic recycling • cilium assembly • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10938


13660

Ensembl


ENSG00000110047


ENSMUSG00000024772

UniProt


Q9H4M9


Q9WVK4

RefSeq (мРНК)


NM_001282444 NM_001282445 NM_006795


NM_010119

RefSeq (білок)


NP_001269373 NP_001269374 NP_006786


NP_034249

Локус (UCSC)

Хр. 11: 64.85 – 64.89 Mb

Хр. 19: 6.33 – 6.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

EHD1 (англ. EH domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 534 амінокислот, а молекулярна маса — 60 627^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFSWVSKDAR	RKKEPELFQT	VAEGLRQLYA	QKLLPLEEHY	RFHEFHSPAL
EDADFDNKPM	VLLVGQYSTG	KTTFIRHLIE	QDFPGMRIGP	EPTTDSFIAV
MHGPTEGVVP	GNALVVDPRR	PFRKLNAFGN	AFLNRFMCAQ	LPNPVLDSIS
IIDTPGILSG	EKQRISRGYD	FAAVLEWFAE	RVDRIILLFD	AHKLDISDEF
SEVIKALKNH	EDKIRVVLNK	ADQIETQQLM	RVYGALMWSL	GKIINTPEVV
RVYIGSFWSH	PLLIPDNRKL	FEAEEQDLFK	DIQSLPRNAA	LRKLNDLIKR
ARLAKVHAYI	ISSLKKEMPN	VFGKESKKKE	LVNNLGEIYQ	KIEREHQISP
GDFPSLRKMQ	ELLQTQDFSK	FQALKPKLLD	TVDDMLANDI	ARLMVMVRQE
ESLMPSQVVK	GGAFDGTMNG	PFGHGYGEGA	GEGIDDVEWV	VGKDKPTYDE
IFYTLSPVNG	KITGANAKKE	MVKSKLPNTV	LGKIWKLADV	DKDGLLDDEE
FALANHLIKV	KLEGHELPAD	LPPHLVPPSK	RRHE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, біогенез та деградація війок. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках, війках, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Naslavsky N., Boehm M., Backlund P.S. Jr., Caplan S. (2004). Rabenosyn-5 and EHD1 interact and sequentially regulate protein recycling to the plasma membrane. Mol. Biol. Cell. 15: 2410—2422. PMID 15020713 DOI:10.1091/mbc.E03-10-0733
Naslavsky N., Rahajeng J., Sharma M., Jovic M., Caplan S. (2006). Interactions between EHD proteins and Rab11-FIP2: a role for EHD3 in early endosomal transport. Mol. Biol. Cell. 17: 163—177. PMID 16251358 DOI:10.1091/mbc.E05-05-0466
Sharma M., Naslavsky N., Caplan S. (2008). A role for EHD4 in the regulation of early endosomal transport. Traffic. 9: 995—1018. PMID 18331452 DOI:10.1111/j.1600-0854.2008.00732.x
Sharma M., Giridharan S.S., Rahajeng J., Naslavsky N., Caplan S. (2009). MICAL-L1 links EHD1 to tubular recycling endosomes and regulates receptor recycling. Mol. Biol. Cell. 20: 5181—5194. PMID 19864458 DOI:10.1091/mbc.E09-06-0535
Rahajeng J., Giridharan S.S., Naslavsky N., Caplan S. (2010). Collapsin response mediator protein-2 (Crmp2) regulates trafficking by linking endocytic regulatory proteins to dynein motors. J. Biol. Chem. 285: 31918—31922. PMID 20801876 DOI:10.1074/jbc.C110.166066

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3242 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9H4M9 (англ.) . Архів оригіналу за 21 листопада 2017. Процитовано 22 серпня 2017.