EMSY |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/09/Protein_C11orf30_PDB_1utu.png/250px-Protein_C11orf30_PDB_1utu.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1UTU, 1UZ3, 2FMM | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EMSY, GL002, C11orf30, BRCA2 interacting transcriptional repressor, EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608574 MGI: 1924203 HomoloGene: 32465 GeneCards: EMSY |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0100026 Репарація ДНК • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/73/PBB_GE_C11orf30_219012_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_C11orf30_219012_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001300942 NM_001300943 NM_001300944 NM_020193 |
| | NM_172280 NM_001381867 NM_001381868 NM_001381869 NM_001381870 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001287871 NP_001287872 NP_001287873 NP_064578 |
| | NP_758484 NP_001368796 NP_001368797 NP_001368798 NP_001368799 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 76.44 – 76.55 Mb | Хр. 7: 98.24 – 98.31 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EMSY (англ. EMSY, BRCA2 interacting transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 322 амінокислот, а молекулярна маса — 141 468[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPVVWPTLLD | | LSRDECKRIL | | RKLELEAYAG | | VISALRAQGD | | LTKEKKDLLG |
ELSKVLSIST | | ERHRAEVRRA | | VNDERLTTIA | | HNMSGPNSSS | | EWSIEGRRLV |
PLMPRLVPQT | | AFTVTANAVA | | NAAIQHNASL | | PVPAETGSKE | | VVCYSYTSTT |
STPTSTPVPS | | GSIATVKSPR | | PASPASNVVV | | LPSGSTVYVK | | SVSCSDEDEK |
PRKRRRTNSS | | SSSPVVLKEV | | PKAVVPVSKT | | ITVPVSGSPK | | MSNIMQSIAN |
SLPPHMSPVK | | ITFTKPSTQT | | TNTTTQKVII | | VTTSPSSTFV | | PNILSKSHNY |
AAVTKLVPTS | | VIASTTQKPP | | VVITASQSSL | | VSNSSSGSSS | | STPSPIPNTV |
AVTAVVSSTP | | SVVMSTVAQG | | VSTSAIKMAS | | TRLPSPKSLV | | SAPTQILAQF |
PKQHQQSPKQ | | QLYQVQQQTQ | | QQVAQPSPVS | | HQQQPQQSPL | | PPGIKPTIQI |
KQESGVKIIT | | QQVQPSKILP | | KPVTATLPTS | | SNSPIMVVSS | | NGAIMTTKLV |
TTPTGTQATY | | TRPTVSPSIG | | RMAATPGAAT | | YVKTTSGSII | | TVVPKSLATL |
GGKIISSNIV | | SGTTTKITTI | | PMTSKPNVIV | | VQKTTGKGTT | | IQGLPGKNVV |
TTLLNAGGEK | | TIQTVPTGAK | | PAILTATRPI | | TKMIVTQPKG | | IGSTVQPAAK |
IIPTKIVYGQ | | QGKTQVLIKP | | KPVTFQATVV | | SEQTRQLVTE | | TLQQASRVAE |
AGNSSIQEGK | | EEPQNYTDSS | | SSSTESSQSS | | QDSQPVVHVI | | ASRRQDWSEH |
EIAMETSPTI | | IYQDVSSESQ | | SATSTIKALL | | ELQQTTVKEK | | LESKPRQPTI |
DLSQMAVPIQ | | MTQEKRHSPE | | SPSIAVVESE | | LVAEYITTER | | TDEGTEVAFP |
LLVSHRSQPQ | | QPSQPQRTLL | | QHVAQSQTAT | | QTSVVVKSIP | | ASSPGAITHI |
MQQALSSHTA | | FTKHSEELGT | | EEGEVEEMDT | | LDPQTGLFYR | | SALTQSQSAK |
QQKLSQPPLE | | QTQLQVKTLQ | | CFQTKQKQTI | | HLQADQLQHK | | LPQMPQLSIR |
HQKLTPLQQE | | QAQPKPDVQH | | TQHPMVAKDR | | QLPTLMAQPP | | QTVVQVLAVK |
TTQQLPKLQQ | | APNQPKIYVQ | | PQTPQSQMSL | | PASSEKQTAS | | QVEQPIITQG |
SSVTKITFEG | | RQPPTVTKIT | | GGSSVPKLTS | | PVTSISPIQA | | SEKTAVSDIL |
KMSLMEAQID | | TNVEHMIVDP | | PKKALATSML | | TGEAGSLPST | | HMVVAGMANS |
TPQQQKCRES | | CSSPSTVGSS | | LTTRKIDPPA | | VPATGQFMRI | | QNVGQKKAEE |
SPAEIIIQAI | | PQYAIPCHSS | | SNVVVEPSGL | | LELNNFTSQQ | | LDDEETAMEQ |
DIDSSTEDGT | | EPSPSQSSAE | | RS |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Huang Y., Myers M.P., Xu R.-M. (2006). Crystal structure of the HP1-EMSY complex reveals an unusual mode of HP1 binding. Structure. 14: 703—712. PMID 16615912 DOI:10.1016/j.str.2006.01.007
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18071 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q7Z589 (англ.) . Архів оригіналу за 5 листопада 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |