EPHB6 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | EPHB6, HEP, EPH receptor B6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602757 MGI: 1096338 HomoloGene: 20940 GeneCards: EPHB6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ephrin receptor activity • signaling receptor activity • protein tyrosine kinase activity • receptor tyrosine kinase • transmembrane signaling receptor activity • transmembrane-ephrin receptor activity • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • extracellular region • гіалоплазма • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • цитоплазма • neuron projection • receptor complex |
---|
Біологічний процес | • protein phosphorylation • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • ephrin receptor signaling pathway • peptidyl-tyrosine phosphorylation • negative regulation of signal transduction • диференціація клітин • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • axon guidance |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0f/PBB_GE_EPHB6_204718_at_fs.png/250px-PBB_GE_EPHB6_204718_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000106123 ENSG00000275482 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001280794 NM_001280795 NM_004445 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001267723 NP_001267724 NP_004436 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 142.86 – 142.87 Mb | Хр. 6: 41.58 – 41.6 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EPHB6 (англ. EPH receptor B6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 021 амінокислот, а молекулярна маса — 110 700[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATEGAAQLG | | NRVAGMVCSL | | WVLLLVSSVL | | ALEEVLLDTT | | GETSEIGWLT |
YPPGGWDEVS | | VLDDQRRLTR | | TFEACHVAGA | | PPGTGQDNWL | | QTHFVERRGA |
QRAHIRLHFS | | VRACSSLGVS | | GGTCRETFTL | | YYRQAEEPDS | | PDSVSSWHLK |
RWTKVDTIAA | | DESFPSSSSS | | SSSSSSAAWA | | VGPHGAGQRA | | GLQLNVKERS |
FGPLTQRGFY | | VAFQDTGACL | | ALVAVRLFSY | | TCPAVLRSFA | | SFPETQASGA |
GGASLVAAVG | | TCVAHAEPEE | | DGVGGQAGGS | | PPRLHCNGEG | | KWMVAVGGCR |
CQPGYQPARG | | DKACQACPRG | | LYKSSAGNAP | | CSPCPARSHA | | PNPAAPVCPC |
LEGFYRASSD | | PPEAPCTGPP | | SAPQELWFEV | | QGSALMLHWR | | LPRELGGRGD |
LLFNVVCKEC | | EGRQEPASGG | | GGTCHRCRDE | | VHFDPRQRGL | | TESRVLVGGL |
RAHVPYILEV | | QAVNGVSELS | | PDPPQAAAIN | | VSTSHEVPSA | | VPVVHQVSRA |
SNSITVSWPQ | | PDQTNGNILD | | YQLRYYDQAE | | DESHSFTLTS | | ETNTATVTQL |
SPGHIYGFQV | | RARTAAGHGP | | YGGKVYFQTL | | PQGELSSQLP | | ERLSLVIGSI |
LGALAFLLLA | | AITVLAVVFQ | | RKRRGTGYTE | | QLQQYSSPGL | | GVKYYIDPST |
YEDPCQAIRE | | LAREVDPAYI | | KIEEVIGTGS | | FGEVRQGRLQ | | PRGRREQTVA |
IQALWAGGAE | | SLQMTFLGRA | | AVLGQFQHPN | | ILRLEGVVTK | | SRPLMVLTEF |
MELGPLDSFL | | RQREGQFSSL | | QLVAMQRGVA | | AAMQYLSSFA | | FVHRSLSAHS |
VLVNSHLVCK | | VARLGHSPQG | | PSCLLRWAAP | | EVIAHGKHTT | | SSDVWSFGIL |
MWEVMSYGER | | PYWDMSEQEV | | LNAIEQEFRL | | PPPPGCPPGL | | HLLMLDTWQK |
DRARRPHFDQ | | LVAAFDKMIR | | KPDTLQAGGD | | PGERPSQALL | | TPVALDFPCL |
DSPQAWLSAI | | GLECYQDNFS | | KFGLCTFSDV | | AQLSLEDLPA | | LGITLAGHQK |
KLLHHIQLLQ | | QHLRQQGSVE | | V |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
- Freywald A., Sharfe N., Roifman C.M. (2002). The kinase-null EphB6 receptor undergoes transphosphorylation in a complex with EphB1. J. Biol. Chem. 277: 3823—3828. PMID 11713248 DOI:10.1074/jbc.M108011200
- Freywald A., Sharfe N., Rashotte C., Grunberger T., Roifman C.M. (2003). The EphB6 receptor inhibits JNK activation in T lymphocytes and modulates T cell receptor-mediated responses. J. Biol. Chem. 278: 10150—10156. PMID 12517763 DOI:10.1074/jbc.M208179200
- Matsuoka H., Obama H., Kelly M.L., Matsui T., Nakamoto M. (2005). Biphasic functions of the kinase-defective Ephb6 receptor in cell adhesion and migration. J. Biol. Chem. 280: 29355—29363. PMID 15955811 DOI:10.1074/jbc.M500010200
- Fox B.P., Kandpal R.P. (2009). EphB6 receptor significantly alters invasiveness and other phenotypic characteristics of human breast carcinoma cells. Oncogene. 28: 1706—1713. PMID 19234485 DOI:10.1038/onc.2009.18
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3396 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O15197 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |