FAM172A

Ідентифікатори

Символи

FAM172A, C5orf21, family with sequence similarity 172 member A, Toupee

Зовнішні ІД

MGI: 1915925 HomoloGene: 12933 GeneCards: FAM172A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• siRNA binding
Клітинна компонента	• ендоплазматичний ретикулум • extracellular region • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • neural crest cell development • mRNA processing • Сплайсинг РНК • heterochromatin assembly by small RNA
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


83989


68675

Ensembl


ENSG00000113391


ENSMUSG00000064138

UniProt


Q8WUF8


Q3TNH5

RefSeq (мРНК)


NM_001163417 NM_001163418 NM_032042


NM_001163419 NM_001163420 NM_138312

RefSeq (білок)


NP_001156889 NP_001156890 NP_114431


NP_001156891 NP_001156892 NP_612185

Локус (UCSC)

Хр. 5: 93.62 – 94.11 Mb

Хр. 13: 77.85 – 78.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FAM172A (англ. Family with sequence similarity 172 member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 416 амінокислот, а молекулярна маса — 47 972^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSISLSSLIL	LPIWINMAQI	QQGGPDEKEK	TTALKDLLSR	IDLDELMKKD
EPPLDFPDTL	EGFEYAFNEK	GQLRHIKTGE	PFVFNYREDL	HRWNQKRYEA
LGEIITKYVY	ELLEKDCNLK	KVSIPVDATE	SEPKSFIFMS	EDALTNPQKL
MVLIHGSGVV	RAGQWARRLI	INEDLDSGTQ	IPFIKRAVAE	GYGVIVLNPN
ENYIEVEKPK	IHVQSSSDSS	DEPAEKRERK	DKVSKETKKR	RDFYEKYRNP
QREKEMMQLY	IRENGSPEEH	AIYVWDHFIA	QAAAENVFFV	AHSYGGLAFV
ELMIQREADV	KNKVTAVALT	DSVHNVWHQE	AGKTIREWMR	ENCCNWVSSS
EPLDTSVESM	LPDCPRVSAG	TDRHELTSWK	SFPSIFKFFT	EASEAKTSSL
KPAVTRRSHR	IKHEEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25365 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8WUF8 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.