FAM20B |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | FAM20B, gxk1, family with sequence similarity 20 member B, glycosaminoglycan xylosylkinase, FAM20B glycosaminoglycan xylosylkinase |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611063 MGI: 2443990 HomoloGene: 8909 GeneCards: FAM20B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotide binding • ATP binding • зв'язування з іоном металу • phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • фосфорилювання • protein phosphorylation • proteoglycan biosynthetic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e6/PBB_GE_FAM20B_202915_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_FAM20B_202915_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/42/PBB_GE_FAM20B_202916_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_FAM20B_202916_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_014864 NM_001324310 NM_001324311 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001311239 NP_001311240 NP_055679 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 179.03 – 179.08 Mb | Хр. 1: 156.51 – 156.55 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FAM20B (англ. FAM20B, glycosaminoglycan xylosylkinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 409 амінокислот, а молекулярна маса — 46 432[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKLKQRVVLL | | AILLVIFIFT | | KVFLIDNLDT | | SAANREDQRA | | FHRMMTGLRV |
ELAPKLDHTL | | QSPWEIAAQW | | VVPREVYPEE | | TPELGAVMHA | | MATKKIIKAD |
VGYKGTQLKA | | LLILEGGQKV | | VFKPKRYSRD | | HVVEGEPYAG | | YDRHNAEVAA |
FHLDRILGFH | | RAPLVVGRFV | | NLRTEIKPVA | | TEQLLSTFLT | | VGNNTCFYGK |
CYYCRETEPA | | CADGDIMEGS | | VTLWLPDVWP | | LQKHRHPWGR | | TYREGKLARW |
EYDESYCDAV | | KKTSPYDSGP | | RLLDIIDTAV | | FDYLIGNADR | | HHYESFQDDE |
GASMLILLDN | | AKSFGNPSLD | | ERSILAPLYQ | | CCIIRVSTWN | | RLNYLKNGVL |
KSALKSAMAH | | DPISPVLSDP | | HLDAVDQRLL | | SVLATVKQCT | | DQFGMDTVLV |
EDRMPLSHL |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном марганцю. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.
Література
- Koike T., Izumikawa T., Tamura J., Kitagawa H. (2009). FAM20B is a kinase that phosphorylates xylose in the glycosaminoglycan-protein linkage region. Biochem. J. 421: 157—162. PMID 19473117 DOI:10.1042/BJ20090474
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Koike T., Izumikawa T., Sato B., Kitagawa H. (2014). Identification of phosphatase that dephosphorylates xylose in the glycosaminoglycan-protein linkage region of proteoglycans. J. Biol. Chem. 289: 6695—6708. PMID 24425863 DOI:10.1074/jbc.M113.520536
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23017 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O75063 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |