FAT4

FAT4
Ідентифікатори
Символи FAT4, CDHF14, CDHR11, FAT-J, FATJ, NBLA00548, VMLDS2, HKLLS2, FAT atypical cadherin 4
Зовнішні ІД OMIM: 612411 MGI: 3045256 HomoloGene: 14377 GeneCards: FAT4
Пов'язані генетичні захворювання
біполярний афективний розлад, великий депресивний розлад, unipolar depression, Van Maldergem syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001948, GO:0016582 protein binding
calcium ion binding

Клітинна компонента

integral component of membrane
apical part of cell
мембрана
внутрішньоклітинний
клітинна мембрана
екзосома

Біологічний процес

cerebral cortex development
heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
Нейрогенез
heart morphogenesis
regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation
розвиток нирки
plasma membrane organization
digestive tract development
inner ear receptor cell stereocilium organization
ossification involved in bone maturation
hippo signaling
branching involved in ureteric bud morphogenesis
адгезія клітин
nephron development
fibroblast growth factor receptor signaling pathway
Сигнальний шлях Notch
condensed mesenchymal cell proliferation
cell-cell adhesion

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
79633
329628
Ensembl
ENSG00000196159
ENSMUSG00000046743
UniProt
Q6V0I7
Q2PZL6
RefSeq (мРНК)
NM_001291285
NM_001291303
NM_024582
NM_183221
RefSeq (білок)
NP_001278214
NP_001278232
NP_078858
NP_001278214.1
NP_001278232.1
NP_899044
Локус (UCSC) Хр. 4: 125.31 – 125.49 Mb Хр. 3: 38.94 – 39.07 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

FAT4 (англ. FAT atypical cadherin 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 981 амінокислот, а молекулярна маса — 542 687[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDLAPDRATGRPWLPLHTLSVSQLLRVFWLLSLLPGQAWVHGAEPRQVFQ
VLEEQPPGTLVGTIQTRPGFTYRLSESHALFAINSSTGALYTTSTIDRES
LPSDVINLVVLSSAPTYPTEVRVLVRDLNDNAPVFPDPSIVVTFKEDSSS
GRQVILDTATDSDIGSNGVDHRSYRIIRGNEAGRFRLDITLNPSGEGAFL
HLVSKGGLDREVTPQYQLLVEVEDKGEPKRRGYLQVNVTVQDINDNPPVF
GSSHYQAGVPEDAVVGSSVLQVAAADADEGTNADIRYRLQDEGTPFQMDP
ETGLITVREPLDFEARRQYSLTVQAMDRGVPSLTGRAEALIQLLDVNDND
PVVKFRYFPATSRYASVDENAQVGTVVALLTVTDADSPAANGNISVQILG
GNEQRHFEVQSSKVPNLSLIKVASALDRERIPSYNLTVSVSDNYGAPPGA
AVQARSSVASLVIFVNDINDHPPVFSQQVYRVNLSEEAPPGSYVSGISAT
DGDSGLNANLRYSIVSGNGLGWFHISEHSGLVTTGSSGGLDRELASQIVL
NISARDQGVHPKVSYAQLVVTLLDVNDEKPVFSQPEGYDVSVVENAPTGT
ELLMLRATDGDLGDNGTVRFSLQEAETDRRSFRLDPVSGRLSTISSLDRE
EQAFYSLLVLATDLGSPPQSSMARINVSLLDINDNSPVFYPVQYFAHIKE
NEPGGSYITTVSATDPDLGTNGTVKYSISAGDRSRFQVNAQSGVISTRMA
LDREEKTAYQLQIVATDGGNLQSPNQAIVTITVLDTQDNPPVFSQVAYSF
VVFENVALGYHVGSVSASTMDLNSNISYLITTGDQKGMFAINQVTGQLTT
ANVIDREEQSFYQLKVVASGGTVTGDTMVNITVKDLNDNSPHFLQAIESV
NVVENWQAGHSIFQAKAVDPDEGVNGMVLYSLKQNPKNLFAINEKNGTIS
LLGPLDVHAGSYQIEILASDMGVPQLSSSVILTVYVHDVNDNSPVFDQLS
YEVTLSESEPVNSRFFKVQASDKDSGANGEIAYTIAEGNTGDAFGIFPDG
QLYIKSELDRELQDRYVLMVVASDRAVEPLSATVNVTVILEDVNDNRPLF
NSTNYTFYFEEEQRAGSFVGKVSAVDKDFGPNGEVRYSFEMVQPDFELHA
ISGEITNTHQFDRESLMRRRGTAVFSFTVIATDQGIPQPLKDQATVHVYM
KDINDNAPKFLKDFYQATISESAANLTQVLRVSASDVDEGNNGLIHYSII
KGNEERQFAIDSTSGQVTLIGKLDYEATPAYSLVIQAVDSGTIPLNSTCT
LNIDILDENDNTPSFPKSTLFVDVLENMRIGELVSSVTATDSDSGDNADL
YYSITGTNNHGTFSISPNTGSIFLAKKLDFETQSLYKLNITAKDQGRPPR
SSTMSVVIHVRDFNDNPPSFPPGDIFKSIVENIPIGTSVISVTAHDPDAD
INGQLSYTIIQQMPRGNHFTIDEVKGTIYTNAEIDREFANLFELTVKAND
QAVPIETRRYALKNVTILVTDLNDNVPMFISQNALAADPSAVIGSVLTTI
MAADPDEGANGEIEYEIINGDTDTFIVDRYSGDLRVASALVPSQLIYNLI
VSATDLGPERRKSTTELTIILQGLDGPVFTQPKYITILKEGEPIGTNVIS
IEAASPRGSEAPVEYYIVSVRCEEKTVGRLFTIGRHTGIIQTAAILDREQ
GACLYLVDVYAIEKSTAFPRTQRAEVEITLQDINDNPPVFPTDMLDLTVE
ENIGDGSKIMQLTAMDADEGANALVTYTIISGADDSFRIDPESGDLIATR
RLDRERRSKYSLLVRADDGLQSSDMRINITVSDVNDHTPKFSRPVYSFDI
PEDTIPGSLVAAILATDDDSGVNGEITYIVNEDDEDGIFFLNPITGVFNL
TRLLDYEVQQYYILTVRAEDGGGQFTTIRVYFNILDVNDNPPIFSLNSYS
TSLMENLPVGSTVLVFNVTDADDGINSQLTYSIASGDSLGQFTVDKNGVL
KVLKALDRESQSFYNLVVQVHDLPQIPASRFTSTAQVSIILLDVNDNPPT
FLSPKLTYIPENTPIDTVVFKAQATDPDSGPNSYIEYTLLNPLGNKFSIG
TIDGEVRLTGELDREEVSNYTLTVVATDKGQPSLSSSTEVVVMVLDINDN
NPIFAQALYKVEINENTLTGTDIIQVFAADGDEGTNGQVRYGIVNGNTNQ
EFRIDSVTGAITVAKPLDREKTPTYHLTVQATDRGSTPRTDTSTVSIVLL
DINDFVPVFELSPYSVNVPENLGTLPRTILQVVARDDDRGSNSKLSYVLF
GGNEDNAFTLSASGELGVTQSLDRETKERFVLMITATDSGSPALTGTGTI
NVIVDDVNDNVPTFASKAYFTTIPEDAPTGTDVLLVNASDADASKNAVIR
IIGGNSQFTINPSTGQIITSALLDRETKDNYTLVVVCSDAGSPEPLSSST
SVLVTVTDVNDNPPRFQHHPYVTHIPSPTLPGSFVFAVTVTDADIGPNSE
LHYSLSGRNSEKFHIDPLRGAIMAAGPLNGASEVTFSVHVKDGGSFPKTD
STTVTVRFVNKADFPKVRAKEQTFMFPENQPVSSLVTTITGSSLRGEPMS
YYIASGNLGNTFQIDQLTGQVSISQPLDFEKIQKYVVWIEARDGGFPPFS
SYEKLDITVLDVNDNAPIFKEDPFISEILENLSPRKILTVSAMDKDSGPN
GQLDYEIVNGNMENSFSINHATGEIRSVRPLDREKVSHYVLTIKSSDKGS
PSQSTSVKVMINILDENDNAPRFSQIFSAHVPENSPLGYTVTRVTTSDED
IGINAISRYSIMDASLPFTINPSTGDIVISRPLNREDTDRYRIRVSAHDS
GWTVSTDVTIFVTDINDNAPRFSRTSYYLDCPELTEIGSKVTQVFATDPD
EGSNGQVFYFIKSQSEYFRINATTGEIFNKQILKYQNVTGFSNVNINRHS
FIVTSSDRGKPSLISETTVTINIVDSNDNAPQFLKSKYFTPVTKNVKVGT
KLIRVTAIDDKDFGLNSEVEYFISNDNHLGKFKLDNDTGWISVASSLISD
LNQNFFITVTAKDKGNPPLSSQATVHITVTEENYHTPEFSQSHMSATIPE
SHSIGSIVRTVSARDRDAAMNGLIKYSISSGNEEGIFAINSSTGILTLAK
ALDYELCQKHEMTISAIDGGWVARTGYCSVTVNVIDVNDNSPVFLSDDYF
PTVLENAPSGTTVIHLNATDADSGTNAVIAYTVQSSDSDLFVIDPNTGVI
TTQGFLDFETKQSYHLTVKAFNVPDEERCSFATVNIQLKGTNEYVPRFVS
KLYYFEISEAAPKGTIVGEVFASDRDLGTDGEVHYLIFGNSRKKGFQINK
KTGQIYVSGILDREKEERVSLKVLAKNFGSIRGADIDEVTVNVTVLDAND
PPIFTLNIYSVQISEGVPIGTHVTFVSAFDSDSIPSWSRFSYFIGSGNEN
GAFSINPQTGQITVTAELDRETLPIYNLSVLAVDSGTPSATGSASLLVTL
EDINDNGPMLTVSEGEVMENKRPGTLVMTLQSTDPDLPPNQGPFTYYLLS
TGPATSYFSLSTAGVLSTTREIDREQIADFYLSVVTKDSGVPQMSSTGTV
HITVIDQNDNPSQSRTVEIFVNYYGNLFPGGILGSVKPQDPDVLDSFHCS
LTSGVTSLFSIPGGTCDLNSQPRSTDGTFDLTVLSNDGVHSTVTSNIRVF
FAGFSNATVDNSILLRLGVPTVKDFLTNHYLHFLRIASSQLTGLGTAVQL
YSAYEENNRTFLLAAVKRNHNQYVNPSGVATFFESIKEILLRQSGVKVES
VDHDSCVHGPCQNGGSCLRRLAVSSVLKSRESLPVIIVANEPLQPFLCKC
LPGYAGSWCEIDIDECLPSPCHSGGTCHNLVGGFSCSCPDGFTGRACERD
INECLQSPCKNGAICQNFPGSFNCVCKTGYTGKMCESSVNYCECNPCFNG
GSCQSGVDSYYCHCPFGVFGKHCELNSYGFEELSYMEFPSLDPNNNYIYV
KFATIKSHALLLYNYDNQTGDRAEFLALEIAEERLRFSYNLGSGTYKLTT
MKKVSDGHFHTVIARRAGMAASLTVDSCSENQEPGYCTVSNVAVSDDWTL
DVQPNRVTVGGIRSLEPILQRRGHVESHDFVGCIMEFAVNGRPLEPSQAL
AAQGILDQCPRLEGACTRSPCQHGGTCMDYWSWQQCHCKEGLTGKYCEKS
VTPDTALSLEGKGRLDYHMSQNEKREYLLRQSLRGAMLEPFGVNSLEVKF
RTRSENGVLIHIQESSNYTTVKIKNGKVYFTSDAGIAGKVERNIPEVYVA
DGHWHTFLIGKNGTATVLSVDRIYNRDIIHPTQDFGGLDVLTISLGGIPP
NQAHRDAQTAGFDGCIASMWYGGESLPFSGKHSLASISKTDPSVKIGCRG
PNICASNPCWGDLLCINQWYAYRCVPPGDCASHPCQNGGSCEPGLHSGFT
CSCPDSHTGRTCEMVVACLGVLCPQGKVCKAGSPAGHVCVLSQGPEEISL
PLWAVPAIVGSCATVLALLVLSLILCNQCRGKKAKNPKEEKKPKEKKKKG
SENVAFDDPDNIPPYGDDMTVRKQPEGNPKPDIIERENPYLIYDETDIPH
NSETIPSAPLASPEQEIEHYDIDNASSIAPSDADIIQHYKQFRSHTPKFS
IQRHSPLGFARQSPMPLGASSLTYQPSYGQGLRTSSLSHSACPTPNPLSR
HSPAPFSKSSTFYRNSPARELHLPIRDGNTLEMHGDTCQPGIFNYATRLG
RRSKSPQAMASHGSRPGSRLKQPIGQIPLESSPPVGLSIEEVERLNTPRP
RNPSICSADHGRSSSEEDCRRPLSRTRNPADGIPAPESSSDSDSHESFTC
SEMEYDREKPMVYTSRMPKLSQVNESDADDEDNYGARLKPRRYHGRRAEG
GPVGTQAAAPGTADNTLPMKLGQQAGTFNWDNLLNWGPGFGHYVDVFKDL
ASLPEKAAANEEGKAGTTKPVPKDGEAEQYV

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

  • Katoh Y., Katoh M. (2006). Comparative integromics on FAT1, FAT2, FAT3 and FAT4. Int. J. Mol. Med. 18: 523—528. PMID 16865240

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з FAT4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23109 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  5. UniProt, Q6V0I7 (англ.) . Архів оригіналу за 30 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.