FAT4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | FAT4, CDHF14, CDHR11, FAT-J, FATJ, NBLA00548, VMLDS2, HKLLS2, FAT atypical cadherin 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612411 MGI: 3045256 HomoloGene: 14377 GeneCards: FAT4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
біполярний афективний розлад, великий депресивний розлад, unipolar depression, Van Maldergem syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • apical part of cell • мембрана • внутрішньоклітинний • клітинна мембрана • екзосома |
---|
Біологічний процес | • cerebral cortex development • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • Нейрогенез • heart morphogenesis • regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation • розвиток нирки • plasma membrane organization • digestive tract development • inner ear receptor cell stereocilium organization • ossification involved in bone maturation • hippo signaling • branching involved in ureteric bud morphogenesis • адгезія клітин • nephron development • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • Сигнальний шлях Notch • condensed mesenchymal cell proliferation • cell-cell adhesion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001291285 NM_001291303 NM_024582 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001278214 NP_001278232 NP_078858 NP_001278214.1 NP_001278232.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 125.31 – 125.49 Mb | Хр. 3: 38.94 – 39.07 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FAT4 (англ. FAT atypical cadherin 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 981 амінокислот, а молекулярна маса — 542 687[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDLAPDRATG | | RPWLPLHTLS | | VSQLLRVFWL | | LSLLPGQAWV | | HGAEPRQVFQ |
VLEEQPPGTL | | VGTIQTRPGF | | TYRLSESHAL | | FAINSSTGAL | | YTTSTIDRES |
LPSDVINLVV | | LSSAPTYPTE | | VRVLVRDLND | | NAPVFPDPSI | | VVTFKEDSSS |
GRQVILDTAT | | DSDIGSNGVD | | HRSYRIIRGN | | EAGRFRLDIT | | LNPSGEGAFL |
HLVSKGGLDR | | EVTPQYQLLV | | EVEDKGEPKR | | RGYLQVNVTV | | QDINDNPPVF |
GSSHYQAGVP | | EDAVVGSSVL | | QVAAADADEG | | TNADIRYRLQ | | DEGTPFQMDP |
ETGLITVREP | | LDFEARRQYS | | LTVQAMDRGV | | PSLTGRAEAL | | IQLLDVNDND |
PVVKFRYFPA | | TSRYASVDEN | | AQVGTVVALL | | TVTDADSPAA | | NGNISVQILG |
GNEQRHFEVQ | | SSKVPNLSLI | | KVASALDRER | | IPSYNLTVSV | | SDNYGAPPGA |
AVQARSSVAS | | LVIFVNDIND | | HPPVFSQQVY | | RVNLSEEAPP | | GSYVSGISAT |
DGDSGLNANL | | RYSIVSGNGL | | GWFHISEHSG | | LVTTGSSGGL | | DRELASQIVL |
NISARDQGVH | | PKVSYAQLVV | | TLLDVNDEKP | | VFSQPEGYDV | | SVVENAPTGT |
ELLMLRATDG | | DLGDNGTVRF | | SLQEAETDRR | | SFRLDPVSGR | | LSTISSLDRE |
EQAFYSLLVL | | ATDLGSPPQS | | SMARINVSLL | | DINDNSPVFY | | PVQYFAHIKE |
NEPGGSYITT | | VSATDPDLGT | | NGTVKYSISA | | GDRSRFQVNA | | QSGVISTRMA |
LDREEKTAYQ | | LQIVATDGGN | | LQSPNQAIVT | | ITVLDTQDNP | | PVFSQVAYSF |
VVFENVALGY | | HVGSVSASTM | | DLNSNISYLI | | TTGDQKGMFA | | INQVTGQLTT |
ANVIDREEQS | | FYQLKVVASG | | GTVTGDTMVN | | ITVKDLNDNS | | PHFLQAIESV |
NVVENWQAGH | | SIFQAKAVDP | | DEGVNGMVLY | | SLKQNPKNLF | | AINEKNGTIS |
LLGPLDVHAG | | SYQIEILASD | | MGVPQLSSSV | | ILTVYVHDVN | | DNSPVFDQLS |
YEVTLSESEP | | VNSRFFKVQA | | SDKDSGANGE | | IAYTIAEGNT | | GDAFGIFPDG |
QLYIKSELDR | | ELQDRYVLMV | | VASDRAVEPL | | SATVNVTVIL | | EDVNDNRPLF |
NSTNYTFYFE | | EEQRAGSFVG | | KVSAVDKDFG | | PNGEVRYSFE | | MVQPDFELHA |
ISGEITNTHQ | | FDRESLMRRR | | GTAVFSFTVI | | ATDQGIPQPL | | KDQATVHVYM |
KDINDNAPKF | | LKDFYQATIS | | ESAANLTQVL | | RVSASDVDEG | | NNGLIHYSII |
KGNEERQFAI | | DSTSGQVTLI | | GKLDYEATPA | | YSLVIQAVDS | | GTIPLNSTCT |
LNIDILDEND | | NTPSFPKSTL | | FVDVLENMRI | | GELVSSVTAT | | DSDSGDNADL |
YYSITGTNNH | | GTFSISPNTG | | SIFLAKKLDF | | ETQSLYKLNI | | TAKDQGRPPR |
SSTMSVVIHV | | RDFNDNPPSF | | PPGDIFKSIV | | ENIPIGTSVI | | SVTAHDPDAD |
INGQLSYTII | | QQMPRGNHFT | | IDEVKGTIYT | | NAEIDREFAN | | LFELTVKAND |
QAVPIETRRY | | ALKNVTILVT | | DLNDNVPMFI | | SQNALAADPS | | AVIGSVLTTI |
MAADPDEGAN | | GEIEYEIING | | DTDTFIVDRY | | SGDLRVASAL | | VPSQLIYNLI |
VSATDLGPER | | RKSTTELTII | | LQGLDGPVFT | | QPKYITILKE | | GEPIGTNVIS |
IEAASPRGSE | | APVEYYIVSV | | RCEEKTVGRL | | FTIGRHTGII | | QTAAILDREQ |
GACLYLVDVY | | AIEKSTAFPR | | TQRAEVEITL | | QDINDNPPVF | | PTDMLDLTVE |
ENIGDGSKIM | | QLTAMDADEG | | ANALVTYTII | | SGADDSFRID | | PESGDLIATR |
RLDRERRSKY | | SLLVRADDGL | | QSSDMRINIT | | VSDVNDHTPK | | FSRPVYSFDI |
PEDTIPGSLV | | AAILATDDDS | | GVNGEITYIV | | NEDDEDGIFF | | LNPITGVFNL |
TRLLDYEVQQ | | YYILTVRAED | | GGGQFTTIRV | | YFNILDVNDN | | PPIFSLNSYS |
TSLMENLPVG | | STVLVFNVTD | | ADDGINSQLT | | YSIASGDSLG | | QFTVDKNGVL |
KVLKALDRES | | QSFYNLVVQV | | HDLPQIPASR | | FTSTAQVSII | | LLDVNDNPPT |
FLSPKLTYIP | | ENTPIDTVVF | | KAQATDPDSG | | PNSYIEYTLL | | NPLGNKFSIG |
TIDGEVRLTG | | ELDREEVSNY | | TLTVVATDKG | | QPSLSSSTEV | | VVMVLDINDN |
NPIFAQALYK | | VEINENTLTG | | TDIIQVFAAD | | GDEGTNGQVR | | YGIVNGNTNQ |
EFRIDSVTGA | | ITVAKPLDRE | | KTPTYHLTVQ | | ATDRGSTPRT | | DTSTVSIVLL |
DINDFVPVFE | | LSPYSVNVPE | | NLGTLPRTIL | | QVVARDDDRG | | SNSKLSYVLF |
GGNEDNAFTL | | SASGELGVTQ | | SLDRETKERF | | VLMITATDSG | | SPALTGTGTI |
NVIVDDVNDN | | VPTFASKAYF | | TTIPEDAPTG | | TDVLLVNASD | | ADASKNAVIR |
IIGGNSQFTI | | NPSTGQIITS | | ALLDRETKDN | | YTLVVVCSDA | | GSPEPLSSST |
SVLVTVTDVN | | DNPPRFQHHP | | YVTHIPSPTL | | PGSFVFAVTV | | TDADIGPNSE |
LHYSLSGRNS | | EKFHIDPLRG | | AIMAAGPLNG | | ASEVTFSVHV | | KDGGSFPKTD |
STTVTVRFVN | | KADFPKVRAK | | EQTFMFPENQ | | PVSSLVTTIT | | GSSLRGEPMS |
YYIASGNLGN | | TFQIDQLTGQ | | VSISQPLDFE | | KIQKYVVWIE | | ARDGGFPPFS |
SYEKLDITVL | | DVNDNAPIFK | | EDPFISEILE | | NLSPRKILTV | | SAMDKDSGPN |
GQLDYEIVNG | | NMENSFSINH | | ATGEIRSVRP | | LDREKVSHYV | | LTIKSSDKGS |
PSQSTSVKVM | | INILDENDNA | | PRFSQIFSAH | | VPENSPLGYT | | VTRVTTSDED |
IGINAISRYS | | IMDASLPFTI | | NPSTGDIVIS | | RPLNREDTDR | | YRIRVSAHDS |
GWTVSTDVTI | | FVTDINDNAP | | RFSRTSYYLD | | CPELTEIGSK | | VTQVFATDPD |
EGSNGQVFYF | | IKSQSEYFRI | | NATTGEIFNK | | QILKYQNVTG | | FSNVNINRHS |
FIVTSSDRGK | | PSLISETTVT | | INIVDSNDNA | | PQFLKSKYFT | | PVTKNVKVGT |
KLIRVTAIDD | | KDFGLNSEVE | | YFISNDNHLG | | KFKLDNDTGW | | ISVASSLISD |
LNQNFFITVT | | AKDKGNPPLS | | SQATVHITVT | | EENYHTPEFS | | QSHMSATIPE |
SHSIGSIVRT | | VSARDRDAAM | | NGLIKYSISS | | GNEEGIFAIN | | SSTGILTLAK |
ALDYELCQKH | | EMTISAIDGG | | WVARTGYCSV | | TVNVIDVNDN | | SPVFLSDDYF |
PTVLENAPSG | | TTVIHLNATD | | ADSGTNAVIA | | YTVQSSDSDL | | FVIDPNTGVI |
TTQGFLDFET | | KQSYHLTVKA | | FNVPDEERCS | | FATVNIQLKG | | TNEYVPRFVS |
KLYYFEISEA | | APKGTIVGEV | | FASDRDLGTD | | GEVHYLIFGN | | SRKKGFQINK |
KTGQIYVSGI | | LDREKEERVS | | LKVLAKNFGS | | IRGADIDEVT | | VNVTVLDAND |
PPIFTLNIYS | | VQISEGVPIG | | THVTFVSAFD | | SDSIPSWSRF | | SYFIGSGNEN |
GAFSINPQTG | | QITVTAELDR | | ETLPIYNLSV | | LAVDSGTPSA | | TGSASLLVTL |
EDINDNGPML | | TVSEGEVMEN | | KRPGTLVMTL | | QSTDPDLPPN | | QGPFTYYLLS |
TGPATSYFSL | | STAGVLSTTR | | EIDREQIADF | | YLSVVTKDSG | | VPQMSSTGTV |
HITVIDQNDN | | PSQSRTVEIF | | VNYYGNLFPG | | GILGSVKPQD | | PDVLDSFHCS |
LTSGVTSLFS | | IPGGTCDLNS | | QPRSTDGTFD | | LTVLSNDGVH | | STVTSNIRVF |
FAGFSNATVD | | NSILLRLGVP | | TVKDFLTNHY | | LHFLRIASSQ | | LTGLGTAVQL |
YSAYEENNRT | | FLLAAVKRNH | | NQYVNPSGVA | | TFFESIKEIL | | LRQSGVKVES |
VDHDSCVHGP | | CQNGGSCLRR | | LAVSSVLKSR | | ESLPVIIVAN | | EPLQPFLCKC |
LPGYAGSWCE | | IDIDECLPSP | | CHSGGTCHNL | | VGGFSCSCPD | | GFTGRACERD |
INECLQSPCK | | NGAICQNFPG | | SFNCVCKTGY | | TGKMCESSVN | | YCECNPCFNG |
GSCQSGVDSY | | YCHCPFGVFG | | KHCELNSYGF | | EELSYMEFPS | | LDPNNNYIYV |
KFATIKSHAL | | LLYNYDNQTG | | DRAEFLALEI | | AEERLRFSYN | | LGSGTYKLTT |
MKKVSDGHFH | | TVIARRAGMA | | ASLTVDSCSE | | NQEPGYCTVS | | NVAVSDDWTL |
DVQPNRVTVG | | GIRSLEPILQ | | RRGHVESHDF | | VGCIMEFAVN | | GRPLEPSQAL |
AAQGILDQCP | | RLEGACTRSP | | CQHGGTCMDY | | WSWQQCHCKE | | GLTGKYCEKS |
VTPDTALSLE | | GKGRLDYHMS | | QNEKREYLLR | | QSLRGAMLEP | | FGVNSLEVKF |
RTRSENGVLI | | HIQESSNYTT | | VKIKNGKVYF | | TSDAGIAGKV | | ERNIPEVYVA |
DGHWHTFLIG | | KNGTATVLSV | | DRIYNRDIIH | | PTQDFGGLDV | | LTISLGGIPP |
NQAHRDAQTA | | GFDGCIASMW | | YGGESLPFSG | | KHSLASISKT | | DPSVKIGCRG |
PNICASNPCW | | GDLLCINQWY | | AYRCVPPGDC | | ASHPCQNGGS | | CEPGLHSGFT |
CSCPDSHTGR | | TCEMVVACLG | | VLCPQGKVCK | | AGSPAGHVCV | | LSQGPEEISL |
PLWAVPAIVG | | SCATVLALLV | | LSLILCNQCR | | GKKAKNPKEE | | KKPKEKKKKG |
SENVAFDDPD | | NIPPYGDDMT | | VRKQPEGNPK | | PDIIERENPY | | LIYDETDIPH |
NSETIPSAPL | | ASPEQEIEHY | | DIDNASSIAP | | SDADIIQHYK | | QFRSHTPKFS |
IQRHSPLGFA | | RQSPMPLGAS | | SLTYQPSYGQ | | GLRTSSLSHS | | ACPTPNPLSR |
HSPAPFSKSS | | TFYRNSPARE | | LHLPIRDGNT | | LEMHGDTCQP | | GIFNYATRLG |
RRSKSPQAMA | | SHGSRPGSRL | | KQPIGQIPLE | | SSPPVGLSIE | | EVERLNTPRP |
RNPSICSADH | | GRSSSEEDCR | | RPLSRTRNPA | | DGIPAPESSS | | DSDSHESFTC |
SEMEYDREKP | | MVYTSRMPKL | | SQVNESDADD | | EDNYGARLKP | | RRYHGRRAEG |
GPVGTQAAAP | | GTADNTLPMK | | LGQQAGTFNW | | DNLLNWGPGF | | GHYVDVFKDL |
ASLPEKAAAN | | EEGKAGTTKP | | VPKDGEAEQY | | V |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.
Література
- Katoh Y., Katoh M. (2006). Comparative integromics on FAT1, FAT2, FAT3 and FAT4. Int. J. Mol. Med. 18: 523—528. PMID 16865240
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з FAT4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23109 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q6V0I7 (англ.) . Архів оригіналу за 30 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |