FEN1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/ce/Protein_FEN1_PDB_1ul1.png/250px-Protein_FEN1_PDB_1ul1.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1U7B, 1UL1, 3Q8K, 3Q8L, 3Q8M, 3UVU, 5E0V | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | FEN1, Flap endonuclease 1, flap structure-specific endonuclease 1, FEN-1, MF1, RAD2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600393 MGI: 102779 HomoloGene: 3034 GeneCards: FEN1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • RNA-DNA hybrid ribonuclease activity • hydrolase activity, acting on ester bonds • nuclease activity • hydrolase activity • double-stranded DNA binding • каталітична активність • damaged DNA binding • double-stranded DNA exodeoxyribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • endonuclease activity • exonuclease activity • 5'-3' exonuclease activity • 5'-flap endonuclease activity • flap endonuclease activity • magnesium ion binding • manganese ion binding |
---|
Клітинна компонента | • мітохондрія • клітинне ядро • мембрана • нуклеоплазма • ядерце • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • double-strand break repair via homologous recombination • double-strand break repair • пам'ять • cellular response to DNA damage stimulus • УФ-захист • реплікація ДНК • GO:0100026 Репарація ДНК • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • DNA replication, removal of RNA primer • positive regulation of sister chromatid cohesion • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • telomere maintenance via semi-conservative replication • base-excision repair • apoptotic DNA fragmentation • retina development in camera-type eye |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/22/PBB_GE_FEN1_204768_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_FEN1_204768_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/02/PBB_GE_FEN1_204767_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_FEN1_204767_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001271614 NM_001271615 NM_007999 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 61.79 – 61.8 Mb | Хр. 19: 10.18 – 10.18 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FEN1 (англ. Flap structure-specific endonuclease 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 42 593[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGIQGLAKLI | | ADVAPSAIRE | | NDIKSYFGRK | | VAIDASMSIY | | QFLIAVRQGG |
DVLQNEEGET | | TSHLMGMFYR | | TIRMMENGIK | | PVYVFDGKPP | | QLKSGELAKR |
SERRAEAEKQ | | LQQAQAAGAE | | QEVEKFTKRL | | VKVTKQHNDE | | CKHLLSLMGI |
PYLDAPSEAE | | ASCAALVKAG | | KVYAAATEDM | | DCLTFGSPVL | | MRHLTASEAK |
KLPIQEFHLS | | RILQELGLNQ | | EQFVDLCILL | | GSDYCESIRG | | IGPKRAVDLI |
QKHKSIEEIV | | RRLDPNKYPV | | PENWLHKEAH | | QLFLEPEVLD | | PESVELKWSE |
PNEEELIKFM | | CGEKQFSEER | | IRSGVKRLSK | | SRQGSTQGRL | | DDFFKVTGSL |
SSAKRKEPEP | | KGSTKKKAKT | | GAAGKFKRGK |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі, мітохондрії.
Література
- Hiraoka L.R., Harrington J.J., Gerhard D.S., Lieber M.R., Hsieh C.-L. (1995). Sequence of human FEN-1, a structure-specific endonuclease, and chromosomal localization of the gene (FEN1) in mouse and human. Genomics. 25: 220—225. PMID 7774922 DOI:10.1016/0888-7543(95)80129-A
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Shen B., Nolan J.P., Sklar L.A., Park M.S. (1996). Essential amino acids for substrate binding and catalysis of human flap endonuclease 1. J. Biol. Chem. 271: 9173—9176. PMID 8621570 DOI:10.1074/jbc.271.16.9173
- Gary R., Ludwig D.L., Cornelius H.L., MacInnes M.A., Park M.S. (1997). The DNA repair endonuclease XPG binds to proliferating cell nuclear antigen (PCNA) and shares sequence elements with the PCNA-binding regions of FEN-1 and cyclin-dependent kinase inhibitor p21. J. Biol. Chem. 272: 24522—24529. PMID 9305916 DOI:10.1074/jbc.272.39.24522
- Tom S., Henricksen L.A., Bambara R.A. (2000). Mechanism whereby proliferating cell nuclear antigen stimulates flap endonuclease 1. J. Biol. Chem. 275: 10498—10505. PMID 10744741 DOI:10.1074/jbc.275.14.10498
- Qiu J., Bimston D.N., Partikian A., Shen B. (2002). Arginine residues 47 and 70 of human flap endonuclease-1 are involved in DNA substrate interactions and cleavage site determination. J. Biol. Chem. 277: 24659—24666. PMID 11986308 DOI:10.1074/jbc.M111941200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3650 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P39748 (англ.) . Архів оригіналу за 18 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |