FNBP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EFL

Ідентифікатори

Символи

FNBP1, FBP17, formin binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606191 MGI: 109606 HomoloGene: 100983 GeneCards: FNBP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • lipid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинна мембрана • clathrin-coated pit • лізосома • cell cortex • цитоскелет • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма
Біологічний процес	• ендоцитоз • membrane organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23048


14269

Ensembl


ENSG00000187239


ENSMUSG00000075415

UniProt


Q96RU3


Q80TY0

RefSeq (мРНК)


NM_015033 NM_001363755

NM_001038700 NM_001177648 NM_001177649 NM_001177650 NM_019406
NM_001355105 NM_001355106

RefSeq (білок)


NP_055848 NP_001350684

NP_001033789 NP_001171119 NP_001171120 NP_001171121 NP_062279
NP_001342034 NP_001342035

Локус (UCSC)

Хр. 9: 129.89 – 130.04 Mb

Хр. 2: 30.92 – 31.03 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FNBP1 (англ. Formin binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 617 амінокислот, а молекулярна маса — 71 307^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSWGTELWDQ	FDNLEKHTQW	GIDILEKYIK	FVKERTEIEL	SYAKQLRNLS
KKYQPKKNSK	EEEEYKYTSC	KAFISNLNEM	NDYAGQHEVI	SENMASQIIV
DLARYVQELK	QERKSNFHDG	RKAQQHIETC	WKQLESSKRR	FERDCKEADR
AQQYFEKMDA	DINVTKADVE	KARQQAQIRH	QMAEDSKADY	SSILQKFNHE
QHEYYHTHIP	NIFQKIQEME	ERRIVRMGES	MKTYAEVDRQ	VIPIIGKCLD
GIVKAAESID	QKNDSQLVIE	AYKSGFEPPG	DIEFEDYTQP	MKRTVSDNSL
SNSRGEGKPD	LKFGGKSKGK	LWPFIKKNKL	MSLLTSPHQP	PPPPPASASP
SAVPNGPQSP	KQQKEPLSHR	FNEFMTSKPK	IHCFRSLKRG	LSLKLGATPE
DFSNLPPEQR	RKKLQQKVDE	LNKEIQKEMD	QRDAITKMKD	VYLKNPQMGD
PASLDHKLAE	VSQNIEKLRV	ETQKFEAWLA	EVEGRLPARS	EQARRQSGLY
DSQNPPTVNN	CAQDRESPDG	SYTEEQSQES	EMKVLATDFD	DEFDDEEPLP
AIGTCKALYT	FEGQNEGTIS	VVEGETLYVI	EEDKGDGWTR	IRRNEDEEGY
VPTSYVEVCL	DKNAKDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, цитоплазматичних везикулах, лізосомі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Richnau N., Aspenstroem P. (2001). Rich, a rho GTPase-activating protein domain-containing protein involved in signaling by Cdc42 and Rac1. J. Biol. Chem. 276: 35060—35070. PMID 11431473 DOI:10.1074/jbc.M103540200
Fuchs U., Rehkamp G.F., Slany R., Follo M., Borkhardt A. (2003). The formin-binding protein 17, FBP17, binds via a TNKS binding motif to tankyrase, a protein involved in telomere maintenance. FEBS Lett. 554: 10—16. PMID 14596906 DOI:10.1016/S0014-5793(03)01063-9
Aspenstroem P., Richnau N., Johansson A.-S. (2006). The diaphanous-related formin DAAM1 collaborates with the Rho GTPases RhoA and Cdc42, CIP4 and Src in regulating cell morphogenesis and actin dynamics. Exp. Cell Res. 312: 2180—2194. PMID 16630611 DOI:10.1016/j.yexcr.2006.03.013
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17069 (англ.) . Архів оригіналу за 28 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96RU3 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.