FNIP1

Ідентифікатори

Символи

FNIP1, folliculin interacting protein 1, IMD93

Зовнішні ІД

OMIM: 610594 MGI: 2444668 HomoloGene: 28173 GeneCards: FNIP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • ATPase inhibitor activity • chaperone binding
Клітинна компонента	• цитоплазма
Біологічний процес	• regulation of protein phosphorylation • regulation of pro-B cell differentiation • cellular response to starvation • negative regulation of TOR signaling • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of protein phosphorylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • TOR signaling • positive regulation of B cell apoptotic process • positive regulation of protein-containing complex assembly • immature B cell differentiation • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • mitochondrion organization • TORC1 signaling • negative regulation of mitochondrion organization • negative regulation of TORC1 signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


96459


216742

Ensembl


ENSG00000217128


ENSMUSG00000035992

UniProt


Q8TF40


Q68FD7

RefSeq (мРНК)


NM_133372 NM_001008738 NM_001346113 NM_001346114


NM_173753

RefSeq (білок)


NP_001008738 NP_001333042 NP_001333043 NP_588613


NP_776114

Локус (UCSC)

Хр. 5: 131.64 – 131.8 Mb

Хр. 11: 54.33 – 54.41 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FNIP1 (англ. Folliculin interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 166 амінокислот, а молекулярна маса — 130 555^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPTLFQKLF	SKRTGLGAPG	RDARDPDCGF	SWPLPEFDPS	QIRLIVYQDC
ERRGRNVLFD	SSVKRRNEDI	SVSKLGSDAQ	VKVFGKCCQL	KPGGDSSSSL
DSSVTSSSDI	KDQCLKYQGS	RCSSDANMLG	EMMFGSVAMS	YKGSTLKIHQ
IRSPPQLMLS	KVFTARTGSS	ICGSLNTLQD	SLEFINQDNN	TLKADNNTVI
NGLLGNIGLS	QFCSPRRAFS	EQGPLRLIRS	ASFFAVHSNP	MDMPGRELNE
DRDSGIARSA	SLSSLLITPF	PSPNSSLTRS	CASSYQRRWR	RSQTTSLENG
VFPRWSIEES	FNLSDESCGP	NPGIVRKKKI	AIGVIFSLSK	DEDENNKFNE
FFFSHFPLFE	SHMNKLKSAI	EQAMKMSRRS	ADASQRSLAY	NRIVDALNEF
RTTICNLYTM	PRIGEPVWLT	MMSGTPEKNH	LCYRFMKEFT	FLMENASKNQ
FLPALITAVL	TNHLAWVPTV	MPNGQPPIKI	FLEKHSSQSV	DMLAKTHPYN
PLWAQLGDLY	GAIGSPVRLA	RTVVVGKRQD	MVQRLLYFLT	YFIRCSELQE
THLLENGEDE	AIVMPGTVIT	TTLEKGEIEE	SEYVLVTMHR	NKSSLLFKES
EEIRTPNCNC	KYCSHPLLGQ	NVENISQQER	EDIQNSSKEL	LGISDECQMI
SPSDCQEENA	VDVKQYRDKL	RTCFDAKLET	VVCTGSVPVD	KCALSESGLE
STEETWQSEK	LLDSDSHTGK	AMRSTGMVVE	KKPPDKIVPA	SFSCEAAQTK
VTFLIGDSMS	PDSDTELRSQ	AVVDQITRHH	TKPLKEERGA	IDQHQETKQT
TKDQSGESDT	QNMVSEEPCE	LPCWNHSDPE	SMSLFDEYFN	DDSIETRTID
DVPFKTSTDS	KDHCCMLEFS	KILCTKNNKQ	NNEFCKCIET	VPQDSCKTCF
PQQDQRDTLS	ILVPHGDKES	SDKKIAVGTE	WDIPRNESSD	SALGDSESED
TGHDMTRQVS	SYYGGEQEDW	AEEDEIPFPG	SKLIEVSAVQ	PNIANFGRSL
LGGYCSSYVP	DFVLQGIGSD	ERFRQCLMSD	LSHAVQHPVL	DEPIAEAVCI
IADMDKWTVQ	VASSQRRVTD	NKLGKEVLVS	SLVSNLLHST	LQLYKHNLSP
NFCVMHLEDR	LQELYFKSKM	LSEYLRGQMR	VHVKELGVVL	GIESSDLPLL
AAVASTHSPY	VAQILL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29418 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8TF40 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.