FNIP1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | FNIP1, folliculin interacting protein 1, IMD93 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610594 MGI: 2444668 HomoloGene: 28173 GeneCards: FNIP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • ATPase inhibitor activity • chaperone binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • regulation of protein phosphorylation • regulation of pro-B cell differentiation • cellular response to starvation • negative regulation of TOR signaling • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of protein phosphorylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • TOR signaling • positive regulation of B cell apoptotic process • positive regulation of protein-containing complex assembly • immature B cell differentiation • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • mitochondrion organization • TORC1 signaling • negative regulation of mitochondrion organization • negative regulation of TORC1 signaling |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_133372 NM_001008738 NM_001346113 NM_001346114 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001008738 NP_001333042 NP_001333043 NP_588613 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 131.64 – 131.8 Mb | Хр. 11: 54.33 – 54.41 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FNIP1 (англ. Folliculin interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 166 амінокислот, а молекулярна маса — 130 555[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPTLFQKLF | | SKRTGLGAPG | | RDARDPDCGF | | SWPLPEFDPS | | QIRLIVYQDC |
ERRGRNVLFD | | SSVKRRNEDI | | SVSKLGSDAQ | | VKVFGKCCQL | | KPGGDSSSSL |
DSSVTSSSDI | | KDQCLKYQGS | | RCSSDANMLG | | EMMFGSVAMS | | YKGSTLKIHQ |
IRSPPQLMLS | | KVFTARTGSS | | ICGSLNTLQD | | SLEFINQDNN | | TLKADNNTVI |
NGLLGNIGLS | | QFCSPRRAFS | | EQGPLRLIRS | | ASFFAVHSNP | | MDMPGRELNE |
DRDSGIARSA | | SLSSLLITPF | | PSPNSSLTRS | | CASSYQRRWR | | RSQTTSLENG |
VFPRWSIEES | | FNLSDESCGP | | NPGIVRKKKI | | AIGVIFSLSK | | DEDENNKFNE |
FFFSHFPLFE | | SHMNKLKSAI | | EQAMKMSRRS | | ADASQRSLAY | | NRIVDALNEF |
RTTICNLYTM | | PRIGEPVWLT | | MMSGTPEKNH | | LCYRFMKEFT | | FLMENASKNQ |
FLPALITAVL | | TNHLAWVPTV | | MPNGQPPIKI | | FLEKHSSQSV | | DMLAKTHPYN |
PLWAQLGDLY | | GAIGSPVRLA | | RTVVVGKRQD | | MVQRLLYFLT | | YFIRCSELQE |
THLLENGEDE | | AIVMPGTVIT | | TTLEKGEIEE | | SEYVLVTMHR | | NKSSLLFKES |
EEIRTPNCNC | | KYCSHPLLGQ | | NVENISQQER | | EDIQNSSKEL | | LGISDECQMI |
SPSDCQEENA | | VDVKQYRDKL | | RTCFDAKLET | | VVCTGSVPVD | | KCALSESGLE |
STEETWQSEK | | LLDSDSHTGK | | AMRSTGMVVE | | KKPPDKIVPA | | SFSCEAAQTK |
VTFLIGDSMS | | PDSDTELRSQ | | AVVDQITRHH | | TKPLKEERGA | | IDQHQETKQT |
TKDQSGESDT | | QNMVSEEPCE | | LPCWNHSDPE | | SMSLFDEYFN | | DDSIETRTID |
DVPFKTSTDS | | KDHCCMLEFS | | KILCTKNNKQ | | NNEFCKCIET | | VPQDSCKTCF |
PQQDQRDTLS | | ILVPHGDKES | | SDKKIAVGTE | | WDIPRNESSD | | SALGDSESED |
TGHDMTRQVS | | SYYGGEQEDW | | AEEDEIPFPG | | SKLIEVSAVQ | | PNIANFGRSL |
LGGYCSSYVP | | DFVLQGIGSD | | ERFRQCLMSD | | LSHAVQHPVL | | DEPIAEAVCI |
IADMDKWTVQ | | VASSQRRVTD | | NKLGKEVLVS | | SLVSNLLHST | | LQLYKHNLSP |
NFCVMHLEDR | | LQELYFKSKM | | LSEYLRGQMR | | VHVKELGVVL | | GIESSDLPLL |
AAVASTHSPY | | VAQILL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29418 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8TF40 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |