FXR1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CPQ, 3KUF, 3O8V

Ідентифікатори

Символи

FXR1, FXR1P, FMR1 autosomal homolog 1, MYORIBF, MYOPMIL

Зовнішні ІД

OMIM: 600819 MGI: 104860 HomoloGene: 3573 GeneCards: FXR1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • G-quadruplex RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • nucleic acid binding • mRNA binding • RNA strand annealing activity • RNA binding • translation regulator activity
Клітинна компонента	• мембрана • ribonucleoprotein granule • dendritic spine • аксон • дендрит (нейробіологія) • ядерце • perinuclear region of cytoplasm • costamere • клітинне ядро • гіалоплазма • цитоплазма • Полісома • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • neuronal cell body • postsynapse • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• диференціація клітин • muscle organ development • multicellular organism development • GO:0097285 апоптоз • GO:1905618 positive regulation of gene silencing by miRNA • negative regulation of translation • regulation of translation • regulation of mRNA stability • positive regulation of translation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8087


14359

Ensembl


ENSG00000114416


ENSMUSG00000027680

UniProt


P51114


Q61584

RefSeq (мРНК)


NM_001013438 NM_001013439 NM_005087 NM_001363882


NM_001113188 NM_001113189 NM_008053

RefSeq (білок)


NP_001013456 NP_001013457 NP_005078 NP_001350811


NP_001106659 NP_001106660 NP_032079

Локус (UCSC)

Хр. 3: 180.87 – 180.98 Mb

Хр. 3: 34.07 – 34.12 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FXR1 (англ. FMR1 autosomal homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 621 амінокислот, а молекулярна маса — 69 721^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAELTVEVRG	SNGAFYKGFI	KDVHEDSLTV	VFENNWQPER	QVPFNEVRLP
PPPDIKKEIS	EGDEVEVYSR	ANDQEPCGWW	LAKVRMMKGE	FYVIEYAACD
ATYNEIVTFE	RLRPVNQNKT	VKKNTFFKCT	VDVPEDLREA	CANENAHKDF
KKAVGACRIF	YHPETTQLMI	LSASEATVKR	VNILSDMHLR	SIRTKLMLMS
RNEEATKHLE	CTKQLAAAFH	EEFVVREDLM	GLAIGTHGSN	IQQARKVPGV
TAIELDEDTG	TFRIYGESAD	AVKKARGFLE	FVEDFIQVPR	NLVGKVIGKN
GKVIQEIVDK	SGVVRVRIEG	DNENKLPRED	GMVPFVFVGT	KESIGNVQVL
LEYHIAYLKE	VEQLRMERLQ	IDEQLRQIGS	RSYSGRGRGR	RGPNYTSGYG
TNSELSNPSE	TESERKDELS	DWSLAGEDDR	DSRHQRDSRR	RPGGRGRSVS
GGRGRGGPRG	GKSSISSVLK	DPDSNPYSLL	DNTESDQTAD	TDASESHHST
NRRRRSRRRR	TDEDAVLMDG	MTESDTASVN	ENGLVTVADY	ISRAESQSRQ
RNLPRETLAK	NKKEMAKDVI	EEHGPSEKAI	NGPTSASGDD	ISKLQRTPGE
EKINTLKEEN	TQEAAVLNGV	S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, міогенез, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Siomi M.C., Zhang Y., Siomi H., Dreyfuss G. (1996). Specific sequences in the fragile X syndrome protein FMR1 and the FXR proteins mediate their binding to 60S ribosomal subunits and the interactions among them. Mol. Cell. Biol. 16: 3825—3832. PMID 8668200 DOI:10.1128/MCB.16.7.3825
Laggerbauer B., Ostareck D., Keidel E.M., Ostareck-Lederer A., Fischer U. (2001). Evidence that fragile X mental retardation protein is a negative regulator of translation. Hum. Mol. Genet. 10: 329—338. PMID 11157796 DOI:10.1093/hmg/10.4.329

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4023 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P51114 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.