FYB1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/43/Protein_FYB_PDB_1ri9.png/250px-Protein_FYB_PDB_1ri9.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1RI9, 2GTJ, 2GTO | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | FYB1, ADAP, PRO0823, SLAP-130, SLAP130, FYB, FYN binding protein, THC3, FYN binding protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602731 MGI: 1346327 HomoloGene: 22664 GeneCards: FYB1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding • GO:0032403 protein-containing complex binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • actin cytoskeleton • клітинна мембрана • міжклітинні контакти |
---|
Біологічний процес | • protein phosphorylation • GO:0007243 intracellular signal transduction • protein localization to plasma membrane • T cell receptor signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • NLS-bearing protein import into nucleus • GO:0022610 життєдіяльність • integrin-mediated signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f7/PBB_GE_FYB_205285_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_FYB_205285_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9d/PBB_GE_FYB_211795_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_FYB_211795_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/cb/PBB_GE_FYB_211794_at_fs.png/250px-PBB_GE_FYB_211794_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001243093 NM_001465 NM_199335 NM_001349333 NM_018594 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001230022 NP_001456 NP_955367 NP_001336262 NP_061064 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 39.11 – 39.27 Mb | Хр. 15: 6.55 – 6.69 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FYB1 (англ. FYN binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 783 амінокислот, а молекулярна маса — 85 387[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAKYNTGGNP | | TEDVSVNSRP | | FRVTGPNSSS | | GIQARKNLFN | | NQGNASPPAG |
PSNVPKFGSP | | KPPVAVKPSS | | EEKPDKEPKP | | PFLKPTGAGQ | | RFGTPASLTT |
RDPEAKVGFL | | KPVGPKPINL | | PKEDSKPTFP | | WPPGNKPSLH | | SVNQDHDLKP |
LGPKSGPTPP | | TSENEQKQAF | | PKLTGVKGKF | | MSASQDLEPK | | PLFPKPAFGQ |
KPPLSTENSH | | EDESPMKNVS | | SSKGSPAPLG | | VRSKSGPLKP | | AREDSENKDH |
AGEISSLPFP | | GVVLKPAASR | | GGPGLSKNGE | | EKKEDRKIDA | | AKNTFQSKIN |
QEELASGTPP | | ARFPKAPSKL | | TVGGPWGQSQ | | EKEKGDKNSA | | TPKQKPLPPL |
FTLGPPPPKP | | NRPPNVDLTK | | FHKTSSGNST | | SKGQTSYSTT | | SLPPPPPSHP |
ASQPPLPASH | | PSQPPVPSLP | | PRNIKPPFDL | | KSPVNEDNQD | | GVTHSDGAGN |
LDEEQDSEGE | | TYEDIEASKE | | REKKREKEEK | | KRLELEKKEQ | | KEKEKKEQEI |
KKKFKLTGPI | | QVIHLAKACC | | DVKGGKNELS | | FKQGEQIEII | | RITDNPEGKW |
LGRTARGSYG | | YIKTTAVEID | | YDSLKLKKDS | | LGAPSRPIED | | DQEVYDDVAE |
QDDISSHSQS | | GSGGIFPPPP | | DDDIYDGIEE | | EDADDGFPAP | | PKQLDMGDEV |
YDDVDTSDFP | | VSSAEMSQGT | | NVGKAKTEEK | | DLKKLKKQEK | | EEKDFRKKFK |
YDGEIRVLYS | | TKVTTSITSK | | KWGTRDLQVK | | PGESLEVIQT | | TDDTKVLCRN |
EEGKYGYVLR | | SYLADNDGEI | | YDDIADGCIY | | DND |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Marie-Cardine A., Verhagen A.M., Eckerskorn C., Schraven B. (1998). SKAP-HOM, a novel adaptor protein homologous to the FYN-associated protein SKAP55. FEBS Lett. 435: 55—60. PMID 9755858 DOI:10.1016/S0014-5793(98)01040-0
- Duke-Cohan J.S., Kang H., Liu H., Rudd C.E. (2006). Regulation and function of SKAP-55 non-canonical motif binding to the SH3c domain of adhesion and degranulation-promoting adaptor protein. J. Biol. Chem. 281: 13743—13750. PMID 16461356 DOI:10.1074/jbc.M508774200
- Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
- Hamamy H., Makrythanasis P., Al-Allawi N., Muhsin A.A., Antonarakis S.E. (2014). Recessive thrombocytopenia likely due to a homozygous pathogenic variant in the FYB gene: case report. BMC Med. Genet. 15: 135—135. PMID 25516138 DOI:10.1186/s12881-014-0135-0
- Heuer K., Kofler M., Langdon G., Thiemke K., Freund C. (2004). Structure of a helically extended SH3 domain of the T cell adapter protein ADAP. Structure. 12: 603—610. PMID 15062083 DOI:10.1016/j.str.2004.02.021
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4036 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O15117 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |