GAPVD1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | GAPVD1, GAPEX5, GAPex-5, RAP6, GTPase activating protein and VPS9 domains 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611714 MGI: 1913941 HomoloGene: 32637 GeneCards: GAPVD1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GTPase activating protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • guanyl-nucleotide exchange factor activity • cadherin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • ендосома • мембрана • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • ендоцитоз • regulation of protein transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • membrane organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ec/PBB_GE_GAPVD1_212804_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_GAPVD1_212804_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a7/PBB_GE_GAPVD1_214869_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_GAPVD1_214869_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/da/PBB_GE_GAPVD1_212802_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_GAPVD1_212802_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001282679 NM_001282680 NM_001282681 NM_015635 NM_001330777
| NM_001330778 NM_001354293 NM_001354294 NM_001354295 NM_001354296 NM_001354297 NM_001354298 NM_001354299 NM_001354300 NM_001354301 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001269608 NP_001269609 NP_001269610 NP_001317706 NP_001317707
| NP_056450 NP_001341222 NP_001341223 NP_001341224 NP_001341225 NP_001341226 NP_001341227 NP_001341228 NP_001341229 NP_001341230 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 125.26 – 125.37 Mb | Хр. 2: 34.67 – 34.76 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GAPVD1 (англ. GTPase activating protein and VPS9 domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 478 амінокислот, а молекулярна маса — 164 980[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVKLDIHTLA | | HHLKQERLYV | | NSEKQLIQRL | | NADVLKTAEK | | LYRTAWIAKQ |
QRINLDRLII | | TSAEASPAEC | | CQHAKILEDT | | QFVDGYKQLG | | FQETAYGEFL |
SRLRENPRLI | | ASSLVAGEKL | | NQENTQSVIY | | TVFTSLYGNC | | IMQEDESYLL |
QVLRYLIEFE | | LKESDNPRRL | | LRRGTCAFSI | | LFKLFSEGLF | | SAKLFLTATL |
HEPIMQLLVE | | DEDHLETDPN | | KLIERFSPSQ | | QEKLFGEKGS | | DRFRQKVQEM |
VESNEAKLVA | | LVNKFIGYLK | | QNTYCFPHSL | | RWIVSQMYKT | | LSCVDRLEVG |
EVRAMCTDLL | | LACFICPAVV | | NPEQYGIISD | | APINEVARFN | | LMQVGRLLQQ |
LAMTGSEEGD | | PRTKSSLGKF | | DKSCVAAFLD | | VVIGGRAVET | | PPLSSVNLLE |
GLSRTVVYIT | | YSQLITLVNF | | MKSVMSGDQL | | REDRMALDNL | | LANLPPAKPG |
KSSSLEMTPY | | NTPQLSPATT | | PANKKNRLPI | | ATRSRSRTNM | | LMDLHMDHEG |
SSQETIQEVQ | | PEEVLVISLG | | TGPQLTPGMM | | SENEVLNMQL | | SDGGQGDVPV |
DENKLHGKPD | | KTLRFSLCSD | | NLEGISEGPS | | NRSNSVSSLD | | LEGESVSELG |
AGPSGSNGVE | | ALQLLEHEQA | | TTQDNLDDKL | | RKFEIRDMMG | | LTDDRDISET |
VSETWSTDVL | | GSDFDPNIDE | | DRLQEIAGAA | | AENMLGSLLC | | LPGSGSVLLD |
PCTGSTISET | | TSEAWSVEVL | | PSDSEAPDLK | | QEERLQELES | | CSGLGSTSDD |
TDVREVSSRP | | STPGLSVVSG | | ISATSEDIPN | | KIEDLRSECS | | SDFGGKDSVT |
SPDMDEITHG | | AHQLTSPPSQ | | SESLLAMFDP | | LSSHEGASAV | | VRPKVHYARP |
SHPPPDPPIL | | EGAVGGNEAR | | LPNFGSHVLT | | PAEMEAFKQR | | HSYPERLVRS |
RSSDIVSSVR | | RPMSDPSWNR | | RPGNEERELP | | PAAAIGATSL | | VAAPHSSSSS |
PSKDSSRGET | | EERKDSDDEK | | SDRNRPWWRK | | RFVSAMPKAP | | IPFRKKEKQE |
KDKDDLGPDR | | FSTLTDDPSP | | RLSAQAQVAE | | DILDKYRNAI | | KRTSPSDGAM |
ANYESTGDNH | | DRDLSSKLLY | | HSDKEVMGDG | | ESAHDSPRDE | | ALQNISADDL |
PDSASQAAHP | | QDSAFSYRDA | | KKKLRLALCS | | ADSVAFPVLT | | HSTRNGLPDH |
TDPEDNEIVC | | FLKVQIAEAI | | NLQDKNLMAQ | | LQETMRCVCR | | FDNRTCRKLL |
ASIAEDYRKR | | APYIAYLTRC | | RQGLQTTQAH | | LERLLQRVLR | | DKEVANRYFT |
TVCVRLLLES | | KEKKIREFIQ | | DFQKLTAADD | | KTAQVEDFLQ | | FLYGAMAQDV |
IWQNASEEQL | | QDAQLAIERS | | VMNRIFKLAF | | YPNQDGDILR | | DQVLHEHIQR |
LSKVVTANHR | | ALQIPEVYLR | | EAPWPSAQSE | | IRTISAYKTP | | RDKVQCILRM |
CSTIMNLLSL | | ANEDSVPGAD | | DFVPVLVFVL | | IKANPPCLLS | | TVQYISSFYA |
SCLSGEESYW | | WMQFTAAVEF | | IKTIDDRK |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендосомах.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23375 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q14C86 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |