GAPVD1

Ідентифікатори

Символи

GAPVD1, GAPEX5, GAPex-5, RAP6, GTPase activating protein and VPS9 domains 1

Зовнішні ІД

OMIM: 611714 MGI: 1913941 HomoloGene: 32637 GeneCards: GAPVD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GTPase activating protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • guanyl-nucleotide exchange factor activity • cadherin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• ендосома • мембрана • гіалоплазма
Біологічний процес	• GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • ендоцитоз • regulation of protein transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • membrane organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26130


66691

Ensembl


ENSG00000165219


ENSMUSG00000026867

UniProt


Q14C86


Q6PAR5

RefSeq (мРНК)

NM_001282679 NM_001282680 NM_001282681 NM_015635 NM_001330777
NM_001330778 NM_001354293 NM_001354294 NM_001354295 NM_001354296 NM_001354297 NM_001354298 NM_001354299 NM_001354300 NM_001354301


NM_025709 NM_001356441

RefSeq (білок)

NP_001269608 NP_001269609 NP_001269610 NP_001317706 NP_001317707
NP_056450 NP_001341222 NP_001341223 NP_001341224 NP_001341225 NP_001341226 NP_001341227 NP_001341228 NP_001341229 NP_001341230


NP_079985 NP_001343370

Локус (UCSC)

Хр. 9: 125.26 – 125.37 Mb

Хр. 2: 34.67 – 34.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GAPVD1 (англ. GTPase activating protein and VPS9 domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 478 амінокислот, а молекулярна маса — 164 980^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVKLDIHTLA	HHLKQERLYV	NSEKQLIQRL	NADVLKTAEK	LYRTAWIAKQ
QRINLDRLII	TSAEASPAEC	CQHAKILEDT	QFVDGYKQLG	FQETAYGEFL
SRLRENPRLI	ASSLVAGEKL	NQENTQSVIY	TVFTSLYGNC	IMQEDESYLL
QVLRYLIEFE	LKESDNPRRL	LRRGTCAFSI	LFKLFSEGLF	SAKLFLTATL
HEPIMQLLVE	DEDHLETDPN	KLIERFSPSQ	QEKLFGEKGS	DRFRQKVQEM
VESNEAKLVA	LVNKFIGYLK	QNTYCFPHSL	RWIVSQMYKT	LSCVDRLEVG
EVRAMCTDLL	LACFICPAVV	NPEQYGIISD	APINEVARFN	LMQVGRLLQQ
LAMTGSEEGD	PRTKSSLGKF	DKSCVAAFLD	VVIGGRAVET	PPLSSVNLLE
GLSRTVVYIT	YSQLITLVNF	MKSVMSGDQL	REDRMALDNL	LANLPPAKPG
KSSSLEMTPY	NTPQLSPATT	PANKKNRLPI	ATRSRSRTNM	LMDLHMDHEG
SSQETIQEVQ	PEEVLVISLG	TGPQLTPGMM	SENEVLNMQL	SDGGQGDVPV
DENKLHGKPD	KTLRFSLCSD	NLEGISEGPS	NRSNSVSSLD	LEGESVSELG
AGPSGSNGVE	ALQLLEHEQA	TTQDNLDDKL	RKFEIRDMMG	LTDDRDISET
VSETWSTDVL	GSDFDPNIDE	DRLQEIAGAA	AENMLGSLLC	LPGSGSVLLD
PCTGSTISET	TSEAWSVEVL	PSDSEAPDLK	QEERLQELES	CSGLGSTSDD
TDVREVSSRP	STPGLSVVSG	ISATSEDIPN	KIEDLRSECS	SDFGGKDSVT
SPDMDEITHG	AHQLTSPPSQ	SESLLAMFDP	LSSHEGASAV	VRPKVHYARP
SHPPPDPPIL	EGAVGGNEAR	LPNFGSHVLT	PAEMEAFKQR	HSYPERLVRS
RSSDIVSSVR	RPMSDPSWNR	RPGNEERELP	PAAAIGATSL	VAAPHSSSSS
PSKDSSRGET	EERKDSDDEK	SDRNRPWWRK	RFVSAMPKAP	IPFRKKEKQE
KDKDDLGPDR	FSTLTDDPSP	RLSAQAQVAE	DILDKYRNAI	KRTSPSDGAM
ANYESTGDNH	DRDLSSKLLY	HSDKEVMGDG	ESAHDSPRDE	ALQNISADDL
PDSASQAAHP	QDSAFSYRDA	KKKLRLALCS	ADSVAFPVLT	HSTRNGLPDH
TDPEDNEIVC	FLKVQIAEAI	NLQDKNLMAQ	LQETMRCVCR	FDNRTCRKLL
ASIAEDYRKR	APYIAYLTRC	RQGLQTTQAH	LERLLQRVLR	DKEVANRYFT
TVCVRLLLES	KEKKIREFIQ	DFQKLTAADD	KTAQVEDFLQ	FLYGAMAQDV
IWQNASEEQL	QDAQLAIERS	VMNRIFKLAF	YPNQDGDILR	DQVLHEHIQR
LSKVVTANHR	ALQIPEVYLR	EAPWPSAQSE	IRTISAYKTP	RDKVQCILRM
CSTIMNLLSL	ANEDSVPGAD	DFVPVLVFVL	IKANPPCLLS	TVQYISSFYA
SCLSGEESYW	WMQFTAAVEF	IKTIDDRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23375 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14C86 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.