GATAD2B |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | GATAD2B, MRD18, P66beta, p68, GATA zinc finger domain containing 2B, GANDS |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 614998 MGI: 2443225 HomoloGene: 32484 GeneCards: GATAD2B |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 18[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • nucleosomal DNA binding • sequence-specific DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма • NuRD complex • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f8/PBB_GE_GATAD2B_gnf1h03747_at_fs.png/250px-PBB_GE_GATAD2B_gnf1h03747_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000143614 ENSG00000261992 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_139304 NM_001379655 NM_001379656 NM_001379657 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_647465 NP_001366584 NP_001366585 NP_001366586 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 153.79 – 153.92 Mb | Хр. 3: 90.2 – 90.27 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GATAD2B (англ. GATA zinc finger domain containing 2B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 593 амінокислот, а молекулярна маса — 65 261[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDRMTEDALR | | LNLLKRSLDP | | ADERDDVLAK | | RLKMEGHEAM | | ERLKMLALLK |
RKDLANLEVP | | HELPTKQDGS | | GVKGYEEKLN | | GNLRPHGDNR | | TAGRPGKENI |
NDEPVDMSAR | | RSEPERGRLT | | PSPDIIVLSD | | NEASSPRSSS | | RMEERLKAAN |
LEMFKGKGIE | | ERQQLIKQLR | | DELRLEEARL | | VLLKKLRQSQ | | LQKENVVQKT |
PVVQNAASIV | | QPSPAHVGQQ | | GLSKLPSRPG | | AQGVEPQNLR | | TLQGHSVIRS |
ATNTTLPHML | | MSQRVIAPNP | | AQLQGQRGPP | | KPGLVRTTTP | | NMNPAINYQP |
QSSSSVPCQR | | TTSSAIYMNL | | ASHIQPGTVN | | RVSSPLPSPS | | AMTDAANSQA |
AAKLALRKQL | | EKTLLEIPPP | | KPPAPLLHFL | | PSAANSEFIY | | MVGLEEVVQS |
VIDSQGKSCA | | SLLRVEPFVC | | AQCRTDFTPH | | WKQEKNGKIL | | CEQCMTSNQK |
KALKAEHTNR | | LKNAFVKALQ | | QEQEIEQRLQ | | QQAALSPTTA | | PAVSSVSKQE |
TIMRHHTLRQ | | APQPQSSLQR | | GIPTSARSML | | SNFAQAPQLS | | VPGGLLGMPG |
VNIAYLNTGI | | GGHKGPSLAD | | RQREYLLDMI | | PPRSISQSIS | | GQK |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. (2002). Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3. J. Biol. Chem. 277: 40958—40966. PMID 12183469 DOI:10.1074/jbc.M207467200
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Brackertz M., Gong Z., Leers J., Renkawitz R. (2006). p66alpha and p66beta of the Mi-2/NuRD complex mediate MBD2 and histone interaction. Nucleic Acids Res. 34: 397—406. PMID 16415179 DOI:10.1093/nar/gkj437
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з GATAD2B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30778 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8WXI9 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |