GBF1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | GBF1, ARF1GEF, golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1, CMT2GG |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603698 MGI: 1861607 HomoloGene: 37897 GeneCards: GBF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • lipid binding |
---|
Клітинна компонента | • lipid droplet • Golgi membrane • trans-Golgi network • cell leading edge • пероксисома • цитоплазма • endoplasmic reticulum lumen • Golgi stack • мітохондрія • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • cis-Golgi network • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment |
---|
Біологічний процес | • Golgi disassembly • protein localization to endoplasmic reticulum tubular network • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • protein transport • Golgi organization • GO:0022415 viral process • regulation of mitotic cell cycle • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment organization • post-Golgi vesicle-mediated transport • establishment of monopolar cell polarity • protein localization to endoplasmic reticulum exit site • regulation of protein localization to cell surface • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • cell activation involved in immune response • protein localization to Golgi apparatus • neutrophil chemotaxis • reactive oxygen species biosynthetic process • retrograde transport, endosome to Golgi • Golgi to endosome transport • regulation of ARF protein signal transduction • COPI coating of Golgi vesicle • GO:0015915 транспорт • regulation of molecular function |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c8/PBB_GE_GBF1_201439_at_fs.png/250px-PBB_GE_GBF1_201439_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001199378 NM_001199379 NM_004193 NM_001377137 NM_001377138
| NM_001377139 NM_001377140 NM_001377141 NM_001391922 NM_001391923 NM_001391924 NM_001391925 NM_001391926 NM_001391927 NM_001391928 NM_001391929 NM_001391930 NM_001391931 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001186307 NP_001186308 NP_004184 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 102.25 – 102.38 Mb | Хр. 19: 46.14 – 46.27 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GBF1 (англ. Golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 859 амінокислот, а молекулярна маса — 206 446[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVDKNIYIIQ | | GEINIVVGAI | | KRNARWSTHT | | PLDEERDPLL | | HSFGHLKEVL |
NSITELSEIE | | PNVFLRPFLE | | VIRSEDTTGP | | ITGLALTSVN | | KFLSYALIDP |
THEGTAEGME | | NMADAVTHAR | | FVGTDPASDE | | VVLMKILQVL | | RTLLLTPVGA |
HLTNESVCEI | | MQSCFRICFE | | MRLSELLRKS | | AEHTLVDMVQ | | LLFTRLPQFK |
EEPKNYVGTN | | MKKLKMRAGG | | MSDSSKWKKQ | | KRSPRPPRHM | | TKVTPGSELP |
TPNGTTLSSN | | LTGGMPFIDV | | PTPISSASSE | | AASAVVSPST | | DSGLEFSSQT |
TSKEDLTDLE | | QPGSPGYSTA | | TEPGSSELGV | | PEQPDLQEGT | | HVEKSQSASV |
ESIPEVLEEC | | TSPADHSDSA | | SVHDMDYVNP | | RGVRFTQSSQ | | KEGTALVPYG |
LPCIRELFRF | | LISLTNPHDR | | HNSEVMIHMG | | LHLLTVALES | | APVAQCQTLL |
GLIKDEMCRH | | LFQLLSIERL | | NLYAASLRVC | | FLLFESMREH | | LKFQMEMYIK |
KLMEIITVEN | | PKMPYEMKEM | | ALEAIVQLWR | | IPSFVTELYI | | NYDCDYYCSN |
LFEELTKLLS | | KNAFPVSGQL | | YTTHLLSLDA | | LLTVIDSTEA | | HCQAKVLNSL |
TQQEKKETAR | | PSCEIVDGTR | | EASNTERTAS | | DGKAVGMASD | | IPGLHLPGGG |
RLPPEHGKSG | | CSDLEEAVDS | | GADKKFARKP | | PRFSCLLPDP | | RELIEIKNKK |
KLLITGTEQF | | NQKPKKGIQF | | LQEKGLLTIP | | MDNTEVAQWL | | RENPRLDKKM |
IGEFVSDRKN | | IDLLESFVST | | FSFQGLRLDE | | ALRLYLEAFR | | LPGEAPVIQR |
LLEAFTERWM | | NCNGSPFANS | | DACFSLAYAV | | IMLNTDQHNH | | NVRKQNAPMT |
LEEFRKNLKG | | VNGGKDFEQD | | ILEDMYHAIK | | NEEIVMPEEQ | | TGLVRENYVW |
NVLLHRGATP | | EGIFLRVPTA | | SYDLDLFTMT | | WGPTIAALSY | | VFDKSLEETI |
IQKAISGFRK | | CAMISAHYGL | | SDVFDNLIIS | | LCKFTALSSE | | SIENLPSVFG |
SNPKAHIAAK | | TVFHLAHRHG | | DILREGWKNI | | MEAMLQLFRA | | QLLPKAMIEV |
EDFVDPNGKI | | SLQREETPSN | | RGESTVLSFV | | SWLTLSGPEQ | | SSVRGPSTEN |
QEAKRVALEC | | IKQCDPEKMI | | TESKFLQLES | | LQELMKALVS | | VTPDEETYDE |
EDAAFCLEML | | LRIVLENRDR | | VGCVWQTVRD | | HLYHLCVQAQ | | DFCFLVERAV |
VGLLRLAIRL | | LRREEISAQV | | LLSLRILLLM | | KPSVLSRVSH | | QVAYGLHELL |
KTNAANIHSG | | DDWATLFTLL | | ECIGSGVKPP | | AALQATARAD | | APDAGAQSDS |
ELPSYHQNDV | | SLDRGYTSDS | | EVYTDHGRPG | | KIHRSATDAD | | VVNSGWLVVG |
KDDVDNSKPG | | PSRPGPSPLI | | NQYSLTVGLD | | LGPHDTKSLL | | KCVESLSFIV |
RDAAHITPDN | | FELCVKTLRI | | FVEASLNGGC | | KSQEKRGKSH | | KYDSKGNRFK |
KKSKEGSMLR | | RPRTSSQHAS | | RGGQSDDDED | | EGVPASYHTV | | SLQVSQDLLD |
LMHTLHTRAA | | SIYSSWAEEQ | | RHLETGGQKI | | EADSRTLWAH | | CWCPLLQGIA |
CLCCDARRQV | | RMQALTYLQR | | ALLVHDLQKL | | DALEWESCFN | | KVLFPLLTKL |
LENISPADVG | | GMEETRMRAS | | TLLSKVFLQH | | LSPLLSLSTF | | AALWLTILDF |
MDKYMHAGSS | | DLLSEAIPES | | LKNMLLVMDT | | AEIFHSADAR | | GGGPSALWEI |
TWERIDCFLP | | HLRDELFKQT | | VIQDPMPMEP | | QGQKPLASAH | | LTSAAGDTRT |
PGHPPPPEIP | | SELGACDFEK | | PESPRAASSS | | SPGSPVASSP | | SRLSPTPDGP |
PPLAQPPLIL | | QPLASPLQVG | | VPPMTLPIIL | | NPALIEATSP | | VPLLATPRPT |
DPIPTSEVN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ліпідних краплях, апараті гольджі.
Література
- Mansour S.J., Herbrick J.-A., Scherer S.W., Melancon P. (1998). Human GBF1 is a ubiquitously expressed gene of the sec7 domain family mapping to 10q24. Genomics. 54: 323—327. PMID 9828135 DOI:10.1006/geno.1998.5563
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Garcia-Mata R., Sztul E. (2003). The membrane-tethering protein p115 interacts with GBF1, an ARF guanine-nucleotide-exchange factor. EMBO Rep. 4: 320—325. PMID 12634853 DOI:10.1038/sj.embor.embor762
- Garcia-Mata R., Szul T., Alvarez C., Sztul E. (2003). ADP-ribosylation factor/COPI-dependent events at the endoplasmic reticulum-Golgi interface are regulated by the guanine nucleotide exchange factor GBF1. Mol. Biol. Cell. 14: 2250—2261. PMID 12808027 DOI:10.1091/mbc.E02-11-0730
- Niu T.K., Pfeifer A.C., Lippincott-Schwartz J., Jackson C.L. (2005). Dynamics of GBF1, a Brefeldin A-sensitive Arf1 exchange factor at the Golgi. Mol. Biol. Cell. 16: 1213—1222. PMID 15616190 DOI:10.1091/mbc.E04-07-0599
- Monetta P., Slavin I., Romero N., Alvarez C. (2007). Rab1b interacts with GBF1 and modulates both ARF1 dynamics and COPI association. Mol. Biol. Cell. 18: 2400—2410. PMID 17429068 DOI:10.1091/mbc.E06-11-1005
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4181 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q92538 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |