GBF1

Ідентифікатори

Символи

GBF1, ARF1GEF, golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1, CMT2GG

Зовнішні ІД

OMIM: 603698 MGI: 1861607 HomoloGene: 37897 GeneCards: GBF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • lipid binding
Клітинна компонента	• lipid droplet • Golgi membrane • trans-Golgi network • cell leading edge • пероксисома • цитоплазма • endoplasmic reticulum lumen • Golgi stack • мітохондрія • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • cis-Golgi network • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment
Біологічний процес	• Golgi disassembly • protein localization to endoplasmic reticulum tubular network • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • protein transport • Golgi organization • GO:0022415 viral process • regulation of mitotic cell cycle • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment organization • post-Golgi vesicle-mediated transport • establishment of monopolar cell polarity • protein localization to endoplasmic reticulum exit site • regulation of protein localization to cell surface • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • cell activation involved in immune response • protein localization to Golgi apparatus • neutrophil chemotaxis • reactive oxygen species biosynthetic process • retrograde transport, endosome to Golgi • Golgi to endosome transport • regulation of ARF protein signal transduction • COPI coating of Golgi vesicle • GO:0015915 транспорт • regulation of molecular function
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8729


107338

Ensembl


ENSG00000107862


ENSMUSG00000025224

UniProt


Q92538


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001199378 NM_001199379 NM_004193 NM_001377137 NM_001377138
NM_001377139 NM_001377140 NM_001377141 NM_001391922 NM_001391923 NM_001391924 NM_001391925 NM_001391926 NM_001391927 NM_001391928 NM_001391929 NM_001391930 NM_001391931


NM_178930

RefSeq (білок)


NP_001186307 NP_001186308 NP_004184


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 10: 102.25 – 102.38 Mb

Хр. 19: 46.14 – 46.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GBF1 (англ. Golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 859 амінокислот, а молекулярна маса — 206 446^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVDKNIYIIQ	GEINIVVGAI	KRNARWSTHT	PLDEERDPLL	HSFGHLKEVL
NSITELSEIE	PNVFLRPFLE	VIRSEDTTGP	ITGLALTSVN	KFLSYALIDP
THEGTAEGME	NMADAVTHAR	FVGTDPASDE	VVLMKILQVL	RTLLLTPVGA
HLTNESVCEI	MQSCFRICFE	MRLSELLRKS	AEHTLVDMVQ	LLFTRLPQFK
EEPKNYVGTN	MKKLKMRAGG	MSDSSKWKKQ	KRSPRPPRHM	TKVTPGSELP
TPNGTTLSSN	LTGGMPFIDV	PTPISSASSE	AASAVVSPST	DSGLEFSSQT
TSKEDLTDLE	QPGSPGYSTA	TEPGSSELGV	PEQPDLQEGT	HVEKSQSASV
ESIPEVLEEC	TSPADHSDSA	SVHDMDYVNP	RGVRFTQSSQ	KEGTALVPYG
LPCIRELFRF	LISLTNPHDR	HNSEVMIHMG	LHLLTVALES	APVAQCQTLL
GLIKDEMCRH	LFQLLSIERL	NLYAASLRVC	FLLFESMREH	LKFQMEMYIK
KLMEIITVEN	PKMPYEMKEM	ALEAIVQLWR	IPSFVTELYI	NYDCDYYCSN
LFEELTKLLS	KNAFPVSGQL	YTTHLLSLDA	LLTVIDSTEA	HCQAKVLNSL
TQQEKKETAR	PSCEIVDGTR	EASNTERTAS	DGKAVGMASD	IPGLHLPGGG
RLPPEHGKSG	CSDLEEAVDS	GADKKFARKP	PRFSCLLPDP	RELIEIKNKK
KLLITGTEQF	NQKPKKGIQF	LQEKGLLTIP	MDNTEVAQWL	RENPRLDKKM
IGEFVSDRKN	IDLLESFVST	FSFQGLRLDE	ALRLYLEAFR	LPGEAPVIQR
LLEAFTERWM	NCNGSPFANS	DACFSLAYAV	IMLNTDQHNH	NVRKQNAPMT
LEEFRKNLKG	VNGGKDFEQD	ILEDMYHAIK	NEEIVMPEEQ	TGLVRENYVW
NVLLHRGATP	EGIFLRVPTA	SYDLDLFTMT	WGPTIAALSY	VFDKSLEETI
IQKAISGFRK	CAMISAHYGL	SDVFDNLIIS	LCKFTALSSE	SIENLPSVFG
SNPKAHIAAK	TVFHLAHRHG	DILREGWKNI	MEAMLQLFRA	QLLPKAMIEV
EDFVDPNGKI	SLQREETPSN	RGESTVLSFV	SWLTLSGPEQ	SSVRGPSTEN
QEAKRVALEC	IKQCDPEKMI	TESKFLQLES	LQELMKALVS	VTPDEETYDE
EDAAFCLEML	LRIVLENRDR	VGCVWQTVRD	HLYHLCVQAQ	DFCFLVERAV
VGLLRLAIRL	LRREEISAQV	LLSLRILLLM	KPSVLSRVSH	QVAYGLHELL
KTNAANIHSG	DDWATLFTLL	ECIGSGVKPP	AALQATARAD	APDAGAQSDS
ELPSYHQNDV	SLDRGYTSDS	EVYTDHGRPG	KIHRSATDAD	VVNSGWLVVG
KDDVDNSKPG	PSRPGPSPLI	NQYSLTVGLD	LGPHDTKSLL	KCVESLSFIV
RDAAHITPDN	FELCVKTLRI	FVEASLNGGC	KSQEKRGKSH	KYDSKGNRFK
KKSKEGSMLR	RPRTSSQHAS	RGGQSDDDED	EGVPASYHTV	SLQVSQDLLD
LMHTLHTRAA	SIYSSWAEEQ	RHLETGGQKI	EADSRTLWAH	CWCPLLQGIA
CLCCDARRQV	RMQALTYLQR	ALLVHDLQKL	DALEWESCFN	KVLFPLLTKL
LENISPADVG	GMEETRMRAS	TLLSKVFLQH	LSPLLSLSTF	AALWLTILDF
MDKYMHAGSS	DLLSEAIPES	LKNMLLVMDT	AEIFHSADAR	GGGPSALWEI
TWERIDCFLP	HLRDELFKQT	VIQDPMPMEP	QGQKPLASAH	LTSAAGDTRT
PGHPPPPEIP	SELGACDFEK	PESPRAASSS	SPGSPVASSP	SRLSPTPDGP
PPLAQPPLIL	QPLASPLQVG	VPPMTLPIIL	NPALIEATSP	VPLLATPRPT
DPIPTSEVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ліпідних краплях, апараті гольджі.

Література

Mansour S.J., Herbrick J.-A., Scherer S.W., Melancon P. (1998). Human GBF1 is a ubiquitously expressed gene of the sec7 domain family mapping to 10q24. Genomics. 54: 323—327. PMID 9828135 DOI:10.1006/geno.1998.5563
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Garcia-Mata R., Sztul E. (2003). The membrane-tethering protein p115 interacts with GBF1, an ARF guanine-nucleotide-exchange factor. EMBO Rep. 4: 320—325. PMID 12634853 DOI:10.1038/sj.embor.embor762
Garcia-Mata R., Szul T., Alvarez C., Sztul E. (2003). ADP-ribosylation factor/COPI-dependent events at the endoplasmic reticulum-Golgi interface are regulated by the guanine nucleotide exchange factor GBF1. Mol. Biol. Cell. 14: 2250—2261. PMID 12808027 DOI:10.1091/mbc.E02-11-0730
Niu T.K., Pfeifer A.C., Lippincott-Schwartz J., Jackson C.L. (2005). Dynamics of GBF1, a Brefeldin A-sensitive Arf1 exchange factor at the Golgi. Mol. Biol. Cell. 16: 1213—1222. PMID 15616190 DOI:10.1091/mbc.E04-07-0599
Monetta P., Slavin I., Romero N., Alvarez C. (2007). Rab1b interacts with GBF1 and modulates both ARF1 dynamics and COPI association. Mol. Biol. Cell. 18: 2400—2410. PMID 17429068 DOI:10.1091/mbc.E06-11-1005

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4181 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q92538 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.