GBP1

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1DG3, 1F5N, 2B8W, 2B92, 2BC9, 2D4H

Ідентифікатори

Символи

GBP1, guanylate binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 600411 HomoloGene: 133759 GeneCards: GBP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • Hsp90 protein binding • spectrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • actin binding • hydrolase activity • GO:0019974 cytokine binding • GO:0006184 GTPase activity • GTP binding • GDP binding • protein homodimerization activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • extracellular region • цитоплазма • комплекс Ґольджі • vesicle membrane • actin cytoskeleton • GO:0016023 cytoplasmic vesicle
Біологічний процес	• процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • negative regulation of T cell receptor signaling pathway • negative regulation of protein localization to plasma membrane • defense response to virus • regulation of calcium-mediated signaling • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • negative regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • regulation of protein localization to plasma membrane • protein homooligomerization • cellular response to interferon-gamma • cellular response to interleukin-1 • cellular response to tumor necrosis factor • protein localization to vacuole
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2633


304266

Ensembl


ENSG00000117228


ENSRNOG00000023943

UniProt


P32455


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_002053


XM_006224278 XM_006233425 XM_008761538 XM_017591353

RefSeq (білок)


NP_002044


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 1: 89.05 – 89.07 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GBP1 (англ. Guanylate binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 592 амінокислот, а молекулярна маса — 67 931^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASEIHMTGP	MCLIENTNGR	LMANPEALKI	LSAITQPMVV	VAIVGLYRTG
KSYLMNKLAG	KKKGFSLGST	VQSHTKGIWM	WCVPHPKKPG	HILVLLDTEG
LGDVEKGDNQ	NDSWIFALAV	LLSSTFVYNS	IGTINQQAMD	QLYYVTELTH
RIRSKSSPDE	NENEVEDSAD	FVSFFPDFVW	TLRDFSLDLE	ADGQPLTPDE
YLTYSLKLKK	GTSQKDETFN	LPRLCIRKFF	PKKKCFVFDR	PVHRRKLAQL
EKLQDEELDP	EFVQQVADFC	SYIFSNSKTK	TLSGGIQVNG	PRLESLVLTY
VNAISSGDLP	CMENAVLALA	QIENSAAVQK	AIAHYEQQMG	QKVQLPTETL
QELLDLHRDS	EREAIEVFIR	SSFKDVDHLF	QKELAAQLEK	KRDDFCKQNQ
EASSDRCSAL	LQVIFSPLEE	EVKAGIYSKP	GGYRLFVQKL	QDLKKKYYEE
PRKGIQAEEI	LQTYLKSKES	MTDAILQTDQ	TLTEKEKEIE	VERVKAESAQ
ASAKMLQEMQ	RKNEQMMEQK	ERSYQEHLKQ	LTEKMENDRV	QLLKEQERTL
ALKLQEQEQL	LKEGFQKESR	IMKNEIQDLQ	TKMRRRKACT	IS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, антивірусний захист, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі. Також секретований назовні.

Література

Cheng Y.-S.E., Patterson C.E., Staeheli P. (1991). Interferon-induced guanylate-binding proteins lack an N(T)KXD consensus motif and bind GMP in addition to GDP and GTP. Mol. Cell. Biol. 11: 4717—4725. PMID 1715024 DOI:10.1128/MCB.11.9.4717
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Modiano N., Lu Y.E., Cresswell P. (2005). Golgi targeting of human guanylate-binding protein-1 requires nucleotide binding, isoprenylation, and an IFN-gamma-inducible cofactor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 8680—8685. PMID 15937107 DOI:10.1073/pnas.0503227102
Nordmann A., Wixler L., Boergeling Y., Wixler V., Ludwig S. (2012). A new splice variant of the human guanylate-binding protein 3 mediates anti-influenza activity through inhibition of viral transcription and replication. FASEB J. 26: 1290—1300. PMID 22106366 DOI:10.1096/fj.11-189886
Prakash B., Praefcke G.J.K., Renault L., Wittinghofer A., Herrmann C. (2000). Structure of human guanylate-binding protein 1 representing a unique class of GTP-binding proteins. Nature. 403: 567—571. PMID 10676968 DOI:10.1038/35000617
Prakash B., Renault L., Praefcke G.J., Herrmann C., Wittinghofer A. (2000). Triphosphate structure of guanylate-binding protein 1 and implications for nucleotide binding and GTPase mechanism. EMBO J. 19: 4555—4564. PMID 10970849 DOI:10.1093/emboj/19.17.4555

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4182 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P32455 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.